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Buscar secuencias biológicas reveladas en patentes

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Datos obtenidos de: DDBJ Pat NCBI GenBank USPTO Fulltext EMBL-EBI Pat
226 secuencias encontradas en esta patente (en total)

Mostrando 1 - 10 de 226 secuencias

NÚMERO DE ID DE SEC
Longitud
Tipo
Ubicaciones
Organisms
Ocurrencia
Herramientas
NÚMERO DE ID DE SEC
1
Longitud
3.889
Tipo
nucleotide
Ubicaciones
Detailed Description, Drawings, Summary

Organismo declarado:
Homo sapiens

Organismo determinado:
  • Homo sapiens

    Homo sapiens

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:37182017
      AY358447
      1 de 5 aciertos reportados para Homo sapiens.
    • Longitud del golpe
      3.322 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      6.102,5 bits
    • Similitud
      100%
    • Cobertura
      84,96%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 1
      84,96% cov
      AY358447
      99,46% cov
    • Longitud de alineación
      3.304 bp
    • Cadena de CIGAR
      562H3304M23H desajustes: 0 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • Pongo abelii

    Pongo abelii

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:297698836
      XM_002826466
      1 de 4 aciertos reportados para Pongo abelii.
    • Longitud del golpe
      3.328 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      5.461,7 bits
    • Similitud
      96,47%
    • Cobertura
      85,11%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 1
      85,11% cov
      XM_002826466
      99,37% cov
    • Longitud de alineación
      3.315 bp
    • Cadena de CIGAR
      556H13MN5MN11MN5MN3MN3MNMI7MN74MN18MN11MN43MN8MDMI20MN4MN42MN49MN53MN26MN14MN12MN46MN50MN2MN56MN41MNM2N88MN2MN60MN68MN5MN28MN30MN23MN17MN80MN2MN46MN9MN5MN30MN88MN34MN111MN25MN5MN9MN3MDMI63MN68MN92MN5MNMN6MN18MN10MN5MN19MN5MN24MN24MN9MN5MN126MN38MN3MN17MN55MN21MN2MN5MN33MN76MN44MN31MN57MN52MN63MN19MN26MN38MN23MN12MN50MN15MI2MN46MN12MDMI6MN46MN39MN65MN6MN32MN2MN47M2D2M2D2MDMN23MN4MN5MN11MN2MN19MN28MN3MN58MN51MN75MN62M23H desajustes: 104 - inserciones: 5 - eliminaciones: 8
Ocurrencia
13 veces en PatSeqDB
Herramientas
Buscador de PatSeq
NÚMERO DE ID DE SEC
2
Longitud
528
Tipo
peptide
Ubicaciones
Detailed Description, Drawings, Summary

Organismo declarado:
Homo sapiens

Organismo determinado:
  • Homo sapiens

    Homo sapiens

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:24475871
      NP_722579
      1 de 3 aciertos reportados para Homo sapiens.
    • Longitud del golpe
      528 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.080,9 bits
    • Similitud
      100%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      NP_722579
      100% cov
    • Longitud de alineación
      528 aa
    • Cadena de CIGAR
      528M desajustes: 0 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • Pongo abelii

    Pongo abelii

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:297698837
      XP_002826512
      1 de 3 aciertos reportados para Pongo abelii.
    • Longitud del golpe
      528 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      945,3 bits
    • Similitud
      97,34%
    • Cobertura
      99,81%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 2
      99,81% cov
      XP_002826512
      99,81% cov
    • Longitud de alineación
      527 aa
    • Cadena de CIGAR
      20MN3MN17MN6M2N67MN66MN29M2N54MN67MN15MN40MN45MNMN4MN77M1H desajustes: 16 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • Pan troglodytes

    Pan troglodytes

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:332846075
      XP_003315174
    • Longitud del golpe
      555 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      819,7 bits
    • Similitud
      86,6%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      XP_003315174
      90,81% cov
    • Longitud de alineación
      530 aa
  • Sus scrofa

    Sus scrofa

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:335289338
      XP_003355854
    • Longitud del golpe
      525 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      763,1 bits
    • Similitud
      82,7%
    • Cobertura
      99,43%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 2
      99,43% cov
      XP_003355854
      99,62% cov
    • Longitud de alineación
      526 aa
  • Nomascus leucogenys

    Nomascus leucogenys

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:332227943
      XP_003263151
    • Longitud del golpe
      486 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      762,7 bits
    • Similitud
      96,85%
    • Cobertura
      78,22%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 2
      78,22% cov
      XP_003263151
      84,98% cov
    • Longitud de alineación
      413 aa
  • Bos taurus

    Bos taurus

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:296478080
      DAA20195
      1 de 2 aciertos reportados para Bos taurus.
    • Longitud del golpe
      531 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      761,9 bits
    • Similitud
      82,73%
    • Cobertura
      99,05%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 2
      99,05% cov
      DAA20195
      99,25% cov
    • Longitud de alineación
      527 aa
  • Equus caballus

    Equus caballus

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:194208638
      XP_001494143
    • Longitud del golpe
      529 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      760,8 bits
    • Similitud
      83,14%
    • Cobertura
      99,81%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 2
      99,81% cov
      XP_001494143
      99,81% cov
    • Longitud de alineación
      528 aa
  • Ailuropoda melanoleuca

    Ailuropoda melanoleuca

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:301752946
      XP_002912314
    • Longitud del golpe
      527 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      736,1 bits
    • Similitud
      81,1%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      XP_002912314
      100% cov
    • Longitud de alineación
      529 aa
  • Mus musculus

    Mus musculus

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:225543299
      NP_001139444
    • Longitud del golpe
      524 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      712,2 bits
    • Similitud
      76,94%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      NP_001139444
      100% cov
    • Longitud de alineación
      529 aa
Ocurrencia
790 veces en PatSeqDB
Herramientas
Buscador de PatSeq
NÚMERO DE ID DE SEC
3
Longitud
541
Tipo
peptide
Ubicaciones
Detailed Description, Drawings

Organismo declarado:
Homo sapiens

Organismo determinado:
  • Homo sapiens

    Homo sapiens

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:119568261
      EAW47876
      1 de 11 aciertos reportados para Homo sapiens.
    • Longitud del golpe
      1.221 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.124 bits
    • Similitud
      100%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 3
      100% cov
      EAW47876
      44,31% cov
    • Longitud de alineación
      541 aa
    • Cadena de CIGAR
      417MN123M desajustes: 1 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • Pan troglodytes

    Pan troglodytes

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:114609567
      XP_001172168
      1 de 2 aciertos reportados para Pan troglodytes.
    • Longitud del golpe
      1.250 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.120,1 bits
    • Similitud
      99,82%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 3
      100% cov
      XP_001172168
      43,28% cov
    • Longitud de alineación
      541 aa
  • Macaca mulatta

    Macaca mulatta

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:297291621
      XP_002803923
      1 de 2 aciertos reportados para Macaca mulatta.
    • Longitud del golpe
      1.248 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.111,7 bits
    • Similitud
      99,26%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 3
      100% cov
      XP_002803923
      43,35% cov
    • Longitud de alineación
      541 aa
  • Callithrix jacchus

    Callithrix jacchus

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:296199371
      XP_002747139
    • Longitud del golpe
      1.249 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.015 bits
    • Similitud
      97,41%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 3
      100% cov
      XP_002747139
      43,31% cov
    • Longitud de alineación
      541 aa
  • Oryctolagus cuniculus

    Oryctolagus cuniculus

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:291397084
      XP_002714897
      1 de 2 aciertos reportados para Oryctolagus cuniculus.
    • Longitud del golpe
      1.243 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.012,3 bits
    • Similitud
      98,15%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 3
      100% cov
      XP_002714897
      43,52% cov
    • Longitud de alineación
      541 aa
Ocurrencia
22 veces en PatSeqDB
Herramientas
Buscador de PatSeq
NÚMERO DE ID DE SEC
4
Longitud
1.014
Tipo
peptide
Ubicaciones
Detailed Description, Drawings

Organismo declarado:
Homo sapiens

Organismo determinado:
  • Homo sapiens

    Homo sapiens

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:2117161
      CAA57479
      1 de 15 aciertos reportados para Homo sapiens.
    • Longitud del golpe
      1.014 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      2.082,4 bits
    • Similitud
      100%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 4
      100% cov
      CAA57479
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.014 aa
    • Cadena de CIGAR
      1014M desajustes: 0 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • Nomascus leucogenys

    Nomascus leucogenys

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:332224022
      XP_003261166
    • Longitud del golpe
      1.014 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      2.040,4 bits
    • Similitud
      98,82%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 4
      100% cov
      XP_003261166
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.014 aa
  • Pan troglodytes

    Pan troglodytes

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:114687937
      XP_001141681
    • Longitud del golpe
      1.016 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.963,3 bits
    • Similitud
      98,82%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 4
      100% cov
      XP_001141681
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.016 aa
  • Macaca mulatta

    Macaca mulatta

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:297303435
      XP_001085509
    • Longitud del golpe
      1.014 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.939,9 bits
    • Similitud
      98,13%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 4
      100% cov
      XP_001085509
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.014 aa
Ocurrencia
138 veces en PatSeqDB
Herramientas
Buscador de PatSeq
NÚMERO DE ID DE SEC
5
Longitud
687
Tipo
peptide
Ubicaciones
Detailed Description, Drawings

Organismo declarado:
Mus musculus

Organismo determinado:
  • Mus musculus

    Mus musculus

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:6006811
      AAF00617
      1 de 3 aciertos reportados para Mus musculus.
    • Longitud del golpe
      687 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.411 bits
    • Similitud
      100%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      AAF00617
      100% cov
    • Longitud de alineación
      687 aa
    • Cadena de CIGAR
      687M desajustes: 0 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • Rattus norvegicus

    Rattus norvegicus

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:45476764
      Q8K3V3
      1 de 2 aciertos reportados para Rattus norvegicus.
    • Longitud del golpe
      687 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.239,6 bits
    • Similitud
      96,94%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      Q8K3V3
      100% cov
    • Longitud de alineación
      687 aa
  • Macaca mulatta

    Macaca mulatta

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:74271805
      NP_001028192
    • Longitud del golpe
      687 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.090,1 bits
    • Similitud
      88,62%
    • Cobertura
      97,23%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 5
      97,23% cov
      NP_001028192
      97,23% cov
    • Longitud de alineación
      668 aa
  • Pongo pygmaeus

    Pongo pygmaeus

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:68565557
      Q50DM5
    • Longitud del golpe
      687 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.082,8 bits
    • Similitud
      88,21%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      Q50DM5
      100% cov
    • Longitud de alineación
      687 aa
  • Pan troglodytes

    Pan troglodytes

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:166429542
      NP_001107638
    • Longitud del golpe
      687 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.080,1 bits
    • Similitud
      89,37%
    • Cobertura
      97,23%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 5
      97,23% cov
      NP_001107638
      97,23% cov
    • Longitud de alineación
      668 aa
  • Gorilla gorilla gorilla

    Gorilla gorilla gorilla

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:68565558
      Q50DM6
    • Longitud del golpe
      687 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.079,3 bits
    • Similitud
      89,22%
    • Cobertura
      97,23%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 5
      97,23% cov
      Q50DM6
      97,23% cov
    • Longitud de alineación
      668 aa
  • Homo sapiens

    Homo sapiens

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:4456467
      CAB37294
      1 de 6 aciertos reportados para Homo sapiens.
    • Longitud del golpe
      687 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.073,5 bits
    • Similitud
      88,77%
    • Cobertura
      97,23%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 5
      97,23% cov
      CAB37294
      97,23% cov
    • Longitud de alineación
      668 aa
  • synthetic construct

    synthetic construct

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:168279680
      BAG11447
    • Longitud del golpe
      687 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.073,2 bits
    • Similitud
      88,77%
    • Cobertura
      97,23%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 5
      97,23% cov
      BAG11447
      97,23% cov
    • Longitud de alineación
      668 aa
  • Pongo abelii

    Pongo abelii

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:207079965
      NP_001128935
      1 de 2 aciertos reportados para Pongo abelii.
    • Longitud del golpe
      687 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.070,5 bits
    • Similitud
      87,48%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      NP_001128935
      100% cov
    • Longitud de alineación
      687 aa
Ocurrencia
37 veces en PatSeqDB
Herramientas
Buscador de PatSeq
NÚMERO DE ID DE SEC
6
Longitud
687
Tipo
peptide
Ubicaciones
Detailed Description, Drawings

Organismo declarado:
Homo sapiens

Organismo determinado:
  • Homo sapiens

    Homo sapiens

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:4456467
      CAB37294
      1 de 9 aciertos reportados para Homo sapiens.
    • Longitud del golpe
      687 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.407,1 bits
    • Similitud
      100%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      CAB37294
      100% cov
    • Longitud de alineación
      687 aa
    • Cadena de CIGAR
      687M desajustes: 0 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • synthetic construct

    synthetic construct

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:168279680
      BAG11447
      1 de 2 aciertos reportados para synthetic construct.
    • Longitud del golpe
      687 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.402,9 bits
    • Similitud
      99,71%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      BAG11447
      100% cov
    • Longitud de alineación
      687 aa
  • Pan troglodytes

    Pan troglodytes

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:166429542
      NP_001107638
    • Longitud del golpe
      687 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.389,8 bits
    • Similitud
      99,13%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      NP_001107638
      100% cov
    • Longitud de alineación
      687 aa
  • Gorilla gorilla gorilla

    Gorilla gorilla gorilla

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:68565558
      Q50DM6
    • Longitud del golpe
      687 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.381,3 bits
    • Similitud
      98,69%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      Q50DM6
      100% cov
    • Longitud de alineación
      687 aa
  • Pongo pygmaeus

    Pongo pygmaeus

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:68565557
      Q50DM5
    • Longitud del golpe
      687 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.310 bits
    • Similitud
      98,11%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      Q50DM5
      100% cov
    • Longitud de alineación
      687 aa
  • Macaca mulatta

    Macaca mulatta

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:74271805
      NP_001028192
    • Longitud del golpe
      687 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.294,3 bits
    • Similitud
      97,67%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      NP_001028192
      100% cov
    • Longitud de alineación
      687 aa
  • Pongo abelii

    Pongo abelii

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:207079965
      NP_001128935
      1 de 2 aciertos reportados para Pongo abelii.
    • Longitud del golpe
      687 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.288,5 bits
    • Similitud
      96,94%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      NP_001128935
      100% cov
    • Longitud de alineación
      687 aa
  • Callithrix jacchus

    Callithrix jacchus

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:296231200
      XP_002761057
    • Longitud del golpe
      687 aa
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.225,3 bits
    • Similitud
      95,51%
    • Cobertura
      97,23%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 6
      97,23% cov
      XP_002761057
      97,23% cov
    • Longitud de alineación
      668 aa
Ocurrencia
32 veces en PatSeqDB
Herramientas
Buscador de PatSeq
NÚMERO DE ID DE SEC
7
Longitud
207
Tipo
nucleotide
Ubicaciones
Detailed Description

Organismo declarado:
Homo sapiens

Organismo determinado:
  • Pan troglodytes

    Pan troglodytes

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:332840686
      XM_509449
      1 de 2 aciertos reportados para Pan troglodytes.
    • Longitud del golpe
      3.234 bp
    • Valor E
      2,78E-103
    • Puntuación BLAST
      383,4 bits
    • Similitud
      100%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 7
      100% cov
      XM_509449
      6,4% cov
    • Longitud de alineación
      207 bp
    • Cadena de CIGAR
      207M desajustes: 0 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • Homo sapiens

    Homo sapiens

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:87162459
      NM_032554
      1 de 20 aciertos reportados para Homo sapiens.
    • Longitud del golpe
      2.977 bp
    • Valor E
      2,78E-103
    • Puntuación BLAST
      383,4 bits
    • Similitud
      100%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 7
      100% cov
      NM_032554
      6,95% cov
    • Longitud de alineación
      207 bp
    • Cadena de CIGAR
      207M desajustes: 0 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • synthetic construct

    synthetic construct

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:254071284
      GQ129268
      1 de 2 aciertos reportados para synthetic construct.
    • Longitud del golpe
      1.084 bp
    • Valor E
      2,78E-103
    • Puntuación BLAST
      383,4 bits
    • Similitud
      100%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 7
      100% cov
      GQ129268
      19,1% cov
    • Longitud de alineación
      207 bp
    • Cadena de CIGAR
      207M desajustes: 0 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • Nomascus leucogenys

    Nomascus leucogenys

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:332263434
      XM_003280706
    • Longitud del golpe
      1.809 bp
    • Valor E
      6,02E-100
    • Puntuación BLAST
      372,3 bits
    • Similitud
      99,03%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 7
      100% cov
      XM_003280706
      11,44% cov
    • Longitud de alineación
      207 bp
    • Cadena de CIGAR
      95MN20MN90M desajustes: 2 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
Ocurrencia
15 veces en PatSeqDB
Herramientas
Buscador de PatSeq
NÚMERO DE ID DE SEC
8
Longitud
80
Tipo
nucleotide
Ubicaciones
Detailed Description

Organismo declarado:
Homo sapiens

Organismo determinado:
  • Pan troglodytes

    Pan troglodytes

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:332840686
      XM_509449
      1 de 2 aciertos reportados para Pan troglodytes.
    • Longitud del golpe
      3.234 bp
    • Valor E
      3,14E-33
    • Puntuación BLAST
      148,9 bits
    • Similitud
      100%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      XM_509449
      2,47% cov
    • Longitud de alineación
      80 bp
    • Cadena de CIGAR
      80M desajustes: 0 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • Homo sapiens

    Homo sapiens

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:87162459
      NM_032554
      1 de 20 aciertos reportados para Homo sapiens.
    • Longitud del golpe
      2.977 bp
    • Valor E
      3,14E-33
    • Puntuación BLAST
      148,9 bits
    • Similitud
      100%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      NM_032554
      2,69% cov
    • Longitud de alineación
      80 bp
    • Cadena de CIGAR
      80M desajustes: 0 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • synthetic construct

    synthetic construct

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:254071284
      GQ129268
      1 de 2 aciertos reportados para synthetic construct.
    • Longitud del golpe
      1.084 bp
    • Valor E
      3,14E-33
    • Puntuación BLAST
      148,9 bits
    • Similitud
      100%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      GQ129268
      7,38% cov
    • Longitud de alineación
      80 bp
    • Cadena de CIGAR
      80M desajustes: 0 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • Nomascus leucogenys

    Nomascus leucogenys

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:332263434
      XM_003280706
    • Longitud del golpe
      1.809 bp
    • Valor E
      6,8E-30
    • Puntuación BLAST
      137,8 bits
    • Similitud
      97,5%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      XM_003280706
      4,42% cov
    • Longitud de alineación
      80 bp
    • Cadena de CIGAR
      24MN20MN34M desajustes: 2 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
Ocurrencia
15 veces en PatSeqDB
Herramientas
Buscador de PatSeq
NÚMERO DE ID DE SEC
9
Longitud
22
Tipo
nucleotide
Ubicaciones
Detailed Description, Drawings

Organismo declarado:
Homo sapiens

Organismo determinado:
  • Pan troglodytes

    Pan troglodytes

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:332840686
      XM_509449
      1 de 2 aciertos reportados para Pan troglodytes.
    • Longitud del golpe
      3.234 bp
    • Valor E
      6,44E-3
    • Puntuación BLAST
      44,1 bits
    • Similitud
      100%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      XM_509449
      0,68% cov
    • Longitud de alineación
      22 bp
    • Cadena de CIGAR
      22M desajustes: 0 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • Nomascus leucogenys

    Nomascus leucogenys

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:332263434
      XM_003280706
      1 de 2 aciertos reportados para Nomascus leucogenys.
    • Longitud del golpe
      1.809 bp
    • Valor E
      6,44E-3
    • Puntuación BLAST
      44,1 bits
    • Similitud
      100%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      XM_003280706
      1,22% cov
    • Longitud de alineación
      22 bp
    • Cadena de CIGAR
      22M desajustes: 0 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • Pongo abelii

    Pongo abelii

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:297693296
      XR_094794
      1 de 2 aciertos reportados para Pongo abelii.
    • Longitud del golpe
      3.232 bp
    • Valor E
      6,44E-3
    • Puntuación BLAST
      44,1 bits
    • Similitud
      100%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      XR_094794
      0,68% cov
    • Longitud de alineación
      22 bp
    • Cadena de CIGAR
      22M desajustes: 0 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • Callithrix jacchus

    Callithrix jacchus

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:296213191
      XM_002753127
      1 de 2 aciertos reportados para Callithrix jacchus.
    • Longitud del golpe
      1.032 bp
    • Valor E
      6,44E-3
    • Puntuación BLAST
      44,1 bits
    • Similitud
      100%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      XM_002753127
      2,13% cov
    • Longitud de alineación
      22 bp
  • Macaca mulatta

    Macaca mulatta

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:223671867
      NM_001145254
      1 de 3 aciertos reportados para Macaca mulatta.
    • Longitud del golpe
      1.014 bp
    • Valor E
      6,44E-3
    • Puntuación BLAST
      44,1 bits
    • Similitud
      100%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      NM_001145254
      2,17% cov
    • Longitud de alineación
      22 bp
  • Homo sapiens

    Homo sapiens

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:87162459
      NM_032554
      1 de 12 aciertos reportados para Homo sapiens.
    • Longitud del golpe
      2.977 bp
    • Valor E
      6,44E-3
    • Puntuación BLAST
      44,1 bits
    • Similitud
      100%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      NM_032554
      0,74% cov
    • Longitud de alineación
      22 bp
  • synthetic construct

    synthetic construct

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:254071284
      GQ129268
      1 de 2 aciertos reportados para synthetic construct.
    • Longitud del golpe
      1.084 bp
    • Valor E
      6,44E-3
    • Puntuación BLAST
      44,1 bits
    • Similitud
      100%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      GQ129268
      2,03% cov
    • Longitud de alineación
      22 bp
Ocurrencia
15 veces en PatSeqDB
Herramientas
Buscador de PatSeq
NÚMERO DE ID DE SEC
10
Longitud
25
Tipo
nucleotide
Ubicaciones
Detailed Description, Drawings

Organismo declarado:
Homo sapiens

Organismo determinado:
  • Pan troglodytes

    Pan troglodytes

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:332840686
      XM_509449
      1 de 2 aciertos reportados para Pan troglodytes.
    • Longitud del golpe
      3.234 bp
    • Valor E
      2,09E-4
    • Puntuación BLAST
      50,1 bits
    • Similitud
      100%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      XM_509449
      0,77% cov
    • Longitud de alineación
      25 bp
    • Cadena de CIGAR
      25M desajustes: 0 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • Nomascus leucogenys

    Nomascus leucogenys

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:332263434
      XM_003280706
      1 de 2 aciertos reportados para Nomascus leucogenys.
    • Longitud del golpe
      1.809 bp
    • Valor E
      2,09E-4
    • Puntuación BLAST
      50,1 bits
    • Similitud
      100%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      XM_003280706
      1,38% cov
    • Longitud de alineación
      25 bp
    • Cadena de CIGAR
      25M desajustes: 0 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • Pongo abelii

    Pongo abelii

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:297693296
      XR_094794
      1 de 2 aciertos reportados para Pongo abelii.
    • Longitud del golpe
      3.232 bp
    • Valor E
      2,09E-4
    • Puntuación BLAST
      50,1 bits
    • Similitud
      100%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      XR_094794
      0,77% cov
    • Longitud de alineación
      25 bp
    • Cadena de CIGAR
      25M desajustes: 0 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • Macaca mulatta

    Macaca mulatta

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:223671867
      NM_001145254
      1 de 3 aciertos reportados para Macaca mulatta.
    • Longitud del golpe
      1.014 bp
    • Valor E
      2,09E-4
    • Puntuación BLAST
      50,1 bits
    • Similitud
      100%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      NM_001145254
      2,47% cov
    • Longitud de alineación
      25 bp
  • Homo sapiens

    Homo sapiens

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:87162459
      NM_032554
      1 de 14 aciertos reportados para Homo sapiens.
    • Longitud del golpe
      2.977 bp
    • Valor E
      2,09E-4
    • Puntuación BLAST
      50,1 bits
    • Similitud
      100%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      NM_032554
      0,84% cov
    • Longitud de alineación
      25 bp
  • synthetic construct

    synthetic construct

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:254071284
      GQ129268
      1 de 2 aciertos reportados para synthetic construct.
    • Longitud del golpe
      1.084 bp
    • Valor E
      2,09E-4
    • Puntuación BLAST
      50,1 bits
    • Similitud
      100%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      GQ129268
      2,31% cov
    • Longitud de alineación
      25 bp
Ocurrencia
15 veces en PatSeqDB
Herramientas
Buscador de PatSeq

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