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recherche de séquences biologiques divulguées dans les brevets

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Données obtenues à partir de: DDBJ Pat NCBI GenBank USPTO PSIPS EMBL-EBI Pat
875 séquences trouvées dans ce brevet (au total)

Affichage 1 - 10 de 875 séquences

SEQ ID NO
Longueur
Type
Emplacements
Organisms
Occurrence
Outils
SEQ ID NO
1
Longueur
1 743
Type
DNA
Emplacements
Undetermined

Organisme déclaré:
Mycobacterium paraseoulense

Organisme déterminé:
  • Mycobacterium sp. KMS

    Mycobacterium sp. KMS

    • Accès à la base de données publique
      GI:119692146
      CP000518
    • Longueur du coup
      5 737 227 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      3 219,8 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      100% cov
      CP000518
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 743 bp
    • Chaîne CIGARE
      1743M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium sp. MCS

    Mycobacterium sp. MCS

    • Accès à la base de données publique
      GI:108767400
      CP000384
    • Longueur du coup
      5 705 448 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      3 219,8 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      100% cov
      CP000384
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 743 bp
    • Chaîne CIGARE
      1743M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium sp. JLS

    Mycobacterium sp. JLS

    • Accès à la base de données publique
      GI:126232413
      CP000580
    • Longueur du coup
      6 048 425 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      3 070,3 bits
    • Similarité
      98,45%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      100% cov
      CP000580
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 743 bp
    • Chaîne CIGARE
      19MN2MN31MN145MN236MN48MN142MN59MN8MN73MN36MN113MN156MN7MN8MN3MNMN2MN2MN5MN26MN50MN47MN41MN143MN11MN77MN225M incompatibilités: 27 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium gilvum PYR-GCK

    Mycobacterium gilvum PYR-GCK

    • Accès à la base de données publique
      GI:145213092
      CP000656
    • Longueur du coup
      5 619 607 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      2 097,1 bits
    • Similarité
      88,79%
    • Couverture
      98,45%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      98,45% cov
      CP000656
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 730 bp
  • Mycobacterium gilvum Spyr1

    Mycobacterium gilvum Spyr1

    • Accès à la base de données publique
      GI:315259999
      CP002385
    • Longueur du coup
      5 547 747 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      2 086 bits
    • Similarité
      88,67%
    • Couverture
      98,45%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      98,45% cov
      CP002385
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 730 bp
  • Mycobacterium smegmatis str. MC2 155

    Mycobacterium smegmatis str. MC2 155

    • Accès à la base de données publique
      GI:118168627
      CP000480
    • Longueur du coup
      6 988 209 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 912,4 bits
    • Similarité
      87,31%
    • Couverture
      96,21%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      96,21% cov
      CP000480
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      1 687 bp
  • Mycobacterium abscessus

    Mycobacterium abscessus

    • Accès à la base de données publique
      GI:169239075
      CU458896
    • Longueur du coup
      5 067 172 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 877,3 bits
    • Similarité
      86,55%
    • Couverture
      98,34%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      98,34% cov
      CU458896
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 732 bp
  • Mycobacterium vanbaalenii PYR-1

    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1

    • Accès à la base de données publique
      GI:119953846
      CP000511
    • Longueur du coup
      6 491 865 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 737 bits
    • Similarité
      85,46%
    • Couverture
      96,79%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      96,79% cov
      CP000511
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 712 bp
  • Mycobacterium avium 104

    Mycobacterium avium 104

    • Accès à la base de données publique
      GI:118163506
      CP000479
    • Longueur du coup
      5 475 491 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 631,7 bits
    • Similarité
      84,39%
    • Couverture
      96,79%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      96,79% cov
      CP000479
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 717 bp
  • Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

    Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

    • Accès à la base de données publique
      GI:41400296
      AE016958
    • Longueur du coup
      4 829 781 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 620,6 bits
    • Similarité
      84,29%
    • Couverture
      96,79%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      96,79% cov
      AE016958
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 719 bp
  • Nocardia farcinica IFM 10152

    Nocardia farcinica IFM 10152

    • Accès à la base de données publique
      GI:54013472
      AP006618
    • Longueur du coup
      6 021 225 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 570,8 bits
    • Similarité
      83,84%
    • Couverture
      96,27%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      96,27% cov
      AP006618
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 708 bp
  • Mycobacterium sp. JDM601

    Mycobacterium sp. JDM601

    • Accès à la base de données publique
      GI:333484608
      CP002329
    • Longueur du coup
      4 643 668 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 496,9 bits
    • Similarité
      83,07%
    • Couverture
      96,56%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      96,56% cov
      CP002329
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 719 bp
  • Rhodococcus equi 103S

    Rhodococcus equi 103S

    • Accès à la base de données publique
      GI:311886853
      FN563149
    • Longueur du coup
      5 043 170 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 469,2 bits
    • Similarité
      82,72%
    • Couverture
      96,73%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      96,73% cov
      FN563149
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 719 bp
  • Rhodococcus opacus B4

    Rhodococcus opacus B4

    • Accès à la base de données publique
      GI:226237899
      AP011115
    • Longueur du coup
      7 913 450 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 463,7 bits
    • Similarité
      82,75%
    • Couverture
      96,04%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      96,04% cov
      AP011115
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      1 704 bp
  • Rhodococcus jostii RHA1

    Rhodococcus jostii RHA1

    • Accès à la base de données publique
      GI:110816552
      CP000431
    • Longueur du coup
      7 804 765 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 443,4 bits
    • Similarité
      82,49%
    • Couverture
      96,27%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      96,27% cov
      CP000431
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      1 708 bp
  • Cellulomonas fimi ATCC 484

    Cellulomonas fimi ATCC 484

    • Accès à la base de données publique
      GI:332337569
      CP002666
    • Longueur du coup
      4 266 344 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 389,8 bits
    • Similarité
      83,11%
    • Couverture
      89,62%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      89,62% cov
      CP002666
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 599 bp
  • [Cellvibrio] gilvus ATCC 13127

    [Cellvibrio] gilvus ATCC 13127

    • Accès à la base de données publique
      GI:336102715
      CP002665
    • Longueur du coup
      3 526 441 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 358,4 bits
    • Similarité
      81,72%
    • Couverture
      96,04%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      96,04% cov
      CP002665
      0,05% cov
    • Longueur d'alignement
      1 712 bp
  • Isoptericola variabilis 225

    Isoptericola variabilis 225

    • Accès à la base de données publique
      GI:334105928
      CP002810
    • Longueur du coup
      3 307 740 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 352,9 bits
    • Similarité
      82,69%
    • Couverture
      89,5%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      89,5% cov
      CP002810
      0,05% cov
    • Longueur d'alignement
      1 594 bp
  • Beutenbergia cavernae DSM 12333

    Beutenbergia cavernae DSM 12333

    • Accès à la base de données publique
      GI:229564415
      CP001618
    • Longueur du coup
      4 669 183 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 352,9 bits
    • Similarité
      81,73%
    • Couverture
      95,35%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      95,35% cov
      CP001618
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 697 bp
  • Mycobacterium marinum M

    Mycobacterium marinum M

    • Accès à la base de données publique
      GI:183173361
      CP000854
    • Longueur du coup
      6 636 827 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 339,9 bits
    • Similarité
      81,33%
    • Couverture
      96,73%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      96,73% cov
      CP000854
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 714 bp
  • Cellulomonas flavigena DSM 20109

    Cellulomonas flavigena DSM 20109

    • Accès à la base de données publique
      GI:296019684
      CP001964
    • Longueur du coup
      4 123 179 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 332,6 bits
    • Similarité
      82,24%
    • Couverture
      90,76%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      90,76% cov
      CP001964
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 616 bp
  • Sanguibacter keddieii DSM 10542

    Sanguibacter keddieii DSM 10542

    • Accès à la base de données publique
      GI:269095543
      CP001819
    • Longueur du coup
      4 253 413 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 330,7 bits
    • Similarité
      81,7%
    • Couverture
      93,98%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      93,98% cov
      CP001819
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 672 bp
  • Mycobacterium ulcerans Agy99

    Mycobacterium ulcerans Agy99

    • Accès à la base de données publique
      GI:118568029
      CP000325
    • Longueur du coup
      5 631 606 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 328,9 bits
    • Similarité
      81,22%
    • Couverture
      96,73%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      96,73% cov
      CP000325
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 715 bp
  • Kineococcus radiotolerans SRS30216 = ATCC BAA-149

    Kineococcus radiotolerans SRS30216 = ATCC BAA-149

    • Accès à la base de données publique
      GI:196121877
      CP000750
    • Longueur du coup
      4 761 183 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 327 bits
    • Similarité
      81,25%
    • Couverture
      96,44%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      96,44% cov
      CP000750
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 712 bp
  • Gordonia bronchialis DSM 43247

    Gordonia bronchialis DSM 43247

    • Accès à la base de données publique
      GI:262083393
      CP001802
    • Longueur du coup
      5 208 602 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 319,6 bits
    • Similarité
      82,23%
    • Couverture
      89,67%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      89,67% cov
      CP001802
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 593 bp
Occurrence
44 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
2
Longueur
580
Type
peptide
Emplacements
Undetermined

Organisme déclaré:
Mycobacterium paraseoulense

Organisme déterminé:
  • Mycobacterium sp. MCS

    Mycobacterium sp. MCS

    • Accès à la base de données publique
      GI:108797126
      YP_637323
    • Longueur du coup
      580 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 163,7 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      YP_637323
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      580 aa
    • Chaîne CIGARE
      580M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium sp. JLS

    Mycobacterium sp. JLS

    • Accès à la base de données publique
      GI:126432749
      YP_001068440
    • Longueur du coup
      580 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 156 bits
    • Similarité
      99,83%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      YP_001068440
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      580 aa
    • Chaîne CIGARE
      6M2N10MN238MN102MN6MN212M incompatibilités: 6 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium gilvum PYR-GCK

    Mycobacterium gilvum PYR-GCK

    • Accès à la base de données publique
      GI:145221089
      YP_001131767
    • Longueur du coup
      589 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 100,9 bits
    • Similarité
      97,41%
    • Couverture
      99,83%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      99,83% cov
      YP_001131767
      97,79% cov
    • Longueur d'alignement
      579 aa
    • Chaîne CIGARE
      3MNMN3D3N4MN2MN14MN12MN30MN6MN3MN72MN17MN72M2N2MN51MNMN3MN4MN14M2N15MN14MN2MN160MN4MN42M1H incompatibilités: 28 - insertions: 0 - suppressions: 3
  • Mycobacterium gilvum Spyr1

    Mycobacterium gilvum Spyr1

    • Accès à la base de données publique
      GI:315441947
      YP_004074826
    • Longueur du coup
      586 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 100,1 bits
    • Similarité
      97,41%
    • Couverture
      99,83%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      99,83% cov
      YP_004074826
      98,29% cov
    • Longueur d'alignement
      579 aa
  • Mycobacterium abscessus

    Mycobacterium abscessus

    • Accès à la base de données publique
      GI:169631619
      YP_001705268
    • Longueur du coup
      578 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 069,7 bits
    • Similarité
      96,32%
    • Couverture
      98,28%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      98,28% cov
      YP_001705268
      98,79% cov
    • Longueur d'alignement
      571 aa
  • Mycobacterium smegmatis str. MC2 155

    Mycobacterium smegmatis str. MC2 155

    • Accès à la base de données publique
      GI:118471241
      YP_884644
    • Longueur du coup
      571 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 060,8 bits
    • Similarité
      96,63%
    • Couverture
      97,24%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      97,24% cov
      YP_884644
      98,77% cov
    • Longueur d'alignement
      564 aa
  • Mycobacterium vanbaalenii PYR-1

    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1

    • Accès à la base de données publique
      GI:120401201
      YP_951030
    • Longueur du coup
      565 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 024,6 bits
    • Similarité
      95,55%
    • Couverture
      96,9%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      96,9% cov
      YP_951030
      99,47% cov
    • Longueur d'alignement
      562 aa
  • Dietzia cinnamea P4

    Dietzia cinnamea P4

    • Accès à la base de données publique
      GI:319949518
      ZP_08023568
    • Longueur du coup
      581 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      994,2 bits
    • Similarité
      92,55%
    • Couverture
      99,14%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      99,14% cov
      ZP_08023568
      99,31% cov
    • Longueur d'alignement
      577 aa
  • Rhodococcus erythropolis PR4

    Rhodococcus erythropolis PR4

    • Accès à la base de données publique
      GI:226308541
      YP_002768501
    • Longueur du coup
      564 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      989,2 bits
    • Similarité
      93,61%
    • Couverture
      97,07%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      97,07% cov
      YP_002768501
      99,82% cov
    • Longueur d'alignement
      563 aa
  • Nocardia farcinica IFM 10152

    Nocardia farcinica IFM 10152

    • Accès à la base de données publique
      GI:54023141
      YP_117383
    • Longueur du coup
      568 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      987,3 bits
    • Similarité
      93,24%
    • Couverture
      96,9%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      96,9% cov
      YP_117383
      98,94% cov
    • Longueur d'alignement
      562 aa
  • Rhodococcus opacus B4

    Rhodococcus opacus B4

    • Accès à la base de données publique
      GI:226364558
      YP_002782340
    • Longueur du coup
      564 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      987,3 bits
    • Similarité
      93,78%
    • Couverture
      97,07%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      97,07% cov
      YP_002782340
      99,82% cov
    • Longueur d'alignement
      563 aa
  • Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

    Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

    • Accès à la base de données publique
      GI:41409729
      NP_962565
    • Longueur du coup
      575 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      987,3 bits
    • Similarité
      92,99%
    • Couverture
      98,28%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      98,28% cov
      NP_962565
      99,3% cov
    • Longueur d'alignement
      571 aa
  • Mycobacterium avium 104

    Mycobacterium avium 104

    • Accès à la base de données publique
      GI:118466019
      YP_884110
    • Longueur du coup
      575 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      985,7 bits
    • Similarité
      92,82%
    • Couverture
      98,28%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      98,28% cov
      YP_884110
      99,3% cov
    • Longueur d'alignement
      571 aa
Occurrence
48 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
3
Longueur
1 770
Type
DNA
Emplacements
Undetermined

Organisme déclaré:
Mycobacterium gilvum

Organisme déterminé:
  • Mycobacterium gilvum PYR-GCK

    Mycobacterium gilvum PYR-GCK

    • Accès à la base de données publique
      GI:145213092
      CP000656
    • Longueur du coup
      5 619 607 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      3 269,7 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 3
      100% cov
      CP000656
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 770 bp
    • Chaîne CIGARE
      1770M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium gilvum Spyr1

    Mycobacterium gilvum Spyr1

    • Accès à la base de données publique
      GI:315259999
      CP002385
    • Longueur du coup
      5 547 747 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      3 258,6 bits
    • Similarité
      99,89%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 3
      100% cov
      CP002385
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 770 bp
    • Chaîne CIGARE
      1160M2N608M incompatibilités: 2 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium sp. KMS

    Mycobacterium sp. KMS

    • Accès à la base de données publique
      GI:119692146
      CP000518
    • Longueur du coup
      5 737 227 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      2 097,1 bits
    • Similarité
      88,79%
    • Couverture
      97,06%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 3
      97,06% cov
      CP000518
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 730 bp
    • Chaîne CIGARE
      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 incompatibilités: 168 - insertions: 12 - suppressions: 14
  • Mycobacterium sp. MCS

    Mycobacterium sp. MCS

    • Accès à la base de données publique
      GI:108767400
      CP000384
    • Longueur du coup
      5 705 448 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      2 097,1 bits
    • Similarité
      88,79%
    • Couverture
      97,06%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 3
      97,06% cov
      CP000384
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 730 bp
  • Mycobacterium sp. JLS

    Mycobacterium sp. JLS

    • Accès à la base de données publique
      GI:126232413
      CP000580
    • Longueur du coup
      6 048 425 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      2 093,4 bits
    • Similarité
      88,91%
    • Couverture
      96,21%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 3
      96,21% cov
      CP000580
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 713 bp
  • Mycobacterium smegmatis str. MC2 155

    Mycobacterium smegmatis str. MC2 155

    • Accès à la base de données publique
      GI:118168627
      CP000480
    • Longueur du coup
      6 988 209 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 886,5 bits
    • Similarité
      87,06%
    • Couverture
      94,8%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 3
      94,8% cov
      CP000480
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      1 693 bp
  • Mycobacterium abscessus

    Mycobacterium abscessus

    • Accès à la base de données publique
      GI:169239075
      CU458896
    • Longueur du coup
      5 067 172 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 779,4 bits
    • Similarité
      85,64%
    • Couverture
      96,38%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 3
      96,38% cov
      CU458896
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 727 bp
  • Mycobacterium vanbaalenii PYR-1

    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1

    • Accès à la base de données publique
      GI:119953846
      CP000511
    • Longueur du coup
      6 491 865 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 700 bits
    • Similarité
      85,02%
    • Couverture
      95,37%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 3
      95,37% cov
      CP000511
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 709 bp
  • Mycobacterium avium 104

    Mycobacterium avium 104

    • Accès à la base de données publique
      GI:118163506
      CP000479
    • Longueur du coup
      5 475 491 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 626,2 bits
    • Similarité
      84,43%
    • Couverture
      94,8%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 3
      94,8% cov
      CP000479
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 708 bp
  • Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

    Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

    • Accès à la base de données publique
      GI:41400296
      AE016958
    • Longueur du coup
      4 829 781 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 615,1 bits
    • Similarité
      84,32%
    • Couverture
      94,8%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 3
      94,8% cov
      AE016958
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 709 bp
  • Nocardia farcinica IFM 10152

    Nocardia farcinica IFM 10152

    • Accès à la base de données publique
      GI:54013472
      AP006618
    • Longueur du coup
      6 021 225 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 504,3 bits
    • Similarité
      83,15%
    • Couverture
      94,8%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 3
      94,8% cov
      AP006618
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 709 bp
  • Mycobacterium sp. JDM601

    Mycobacterium sp. JDM601

    • Accès à la base de données publique
      GI:333484608
      CP002329
    • Longueur du coup
      4 643 668 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 463,7 bits
    • Similarité
      82,7%
    • Couverture
      94,92%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 3
      94,92% cov
      CP002329
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 711 bp
  • Cellulomonas flavigena DSM 20109

    Cellulomonas flavigena DSM 20109

    • Accès à la base de données publique
      GI:296019684
      CP001964
    • Longueur du coup
      4 123 179 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 452,6 bits
    • Similarité
      83,13%
    • Couverture
      91,86%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 3
      91,86% cov
      CP001964
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 660 bp
  • Rhodococcus opacus B4

    Rhodococcus opacus B4

    • Accès à la base de données publique
      GI:226237899
      AP011115
    • Longueur du coup
      7 913 450 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 452,6 bits
    • Similarité
      82,67%
    • Couverture
      94,41%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 3
      94,41% cov
      AP011115
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      1 702 bp
  • Sanguibacter keddieii DSM 10542

    Sanguibacter keddieii DSM 10542

    • Accès à la base de données publique
      GI:269095543
      CP001819
    • Longueur du coup
      4 253 413 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 395,3 bits
    • Similarité
      82,36%
    • Couverture
      93,16%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 3
      93,16% cov
      CP001819
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 689 bp
  • Cellulomonas fimi ATCC 484

    Cellulomonas fimi ATCC 484

    • Accès à la base de données publique
      GI:332337569
      CP002666
    • Longueur du coup
      4 266 344 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 391,6 bits
    • Similarité
      83,03%
    • Couverture
      88,47%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 3
      88,47% cov
      CP002666
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 597 bp
  • Kineococcus radiotolerans SRS30216 = ATCC BAA-149

    Kineococcus radiotolerans SRS30216 = ATCC BAA-149

    • Accès à la base de données publique
      GI:196121877
      CP000750
    • Longueur du coup
      4 761 183 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 384,3 bits
    • Similarité
      82,09%
    • Couverture
      93,33%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 3
      93,33% cov
      CP000750
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 681 bp
  • Isoptericola variabilis 225

    Isoptericola variabilis 225

    • Accès à la base de données publique
      GI:334105928
      CP002810
    • Longueur du coup
      3 307 740 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 363,9 bits
    • Similarité
      82,21%
    • Couverture
      91,86%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 3
      91,86% cov
      CP002810
      0,05% cov
    • Longueur d'alignement
      1 664 bp
  • [Cellvibrio] gilvus ATCC 13127

    [Cellvibrio] gilvus ATCC 13127

    • Accès à la base de données publique
      GI:336102715
      CP002665
    • Longueur du coup
      3 526 441 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 356,6 bits
    • Similarité
      81,7%
    • Couverture
      94,69%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 3
      94,69% cov
      CP002665
      0,05% cov
    • Longueur d'alignement
      1 716 bp
  • Rhodococcus jostii RHA1

    Rhodococcus jostii RHA1

    • Accès à la base de données publique
      GI:110816552
      CP000431
    • Longueur du coup
      7 804 765 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 349,2 bits
    • Similarité
      81,56%
    • Couverture
      94,46%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 3
      94,46% cov
      CP000431
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      1 703 bp
  • Kribbella flavida DSM 17836

    Kribbella flavida DSM 17836

    • Accès à la base de données publique
      GI:283807292
      CP001736
    • Longueur du coup
      7 579 488 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 347,3 bits
    • Similarité
      83,03%
    • Couverture
      86,38%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 3
      86,38% cov
      CP001736
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      1 556 bp
  • Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894

    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894

    • Accès à la base de données publique
      GI:269303491
      CP001821
    • Longueur du coup
      3 742 776 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 304,9 bits
    • Similarité
      81,45%
    • Couverture
      93,22%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 3
      93,22% cov
      CP001821
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 698 bp
  • Gordonia bronchialis DSM 43247

    Gordonia bronchialis DSM 43247

    • Accès à la base de données publique
      GI:262083393
      CP001802
    • Longueur du coup
      5 208 602 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 290,1 bits
    • Similarité
      81,91%
    • Couverture
      88,25%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 3
      88,25% cov
      CP001802
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 592 bp
  • Mycobacterium tuberculosis KZN 4207

    Mycobacterium tuberculosis KZN 4207

    • Accès à la base de données publique
      GI:328456706
      CP001662
    • Longueur du coup
      4 394 985 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 243,9 bits
    • Similarité
      81,67%
    • Couverture
      86,67%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 3
      86,67% cov
      CP001662
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 566 bp
  • Mycobacterium tuberculosis KZN 1435

    Mycobacterium tuberculosis KZN 1435

    • Accès à la base de données publique
      GI:253318418
      CP001658
    • Longueur du coup
      4 398 250 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 243,9 bits
    • Similarité
      81,67%
    • Couverture
      86,67%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 3
      86,67% cov
      CP001658
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 566 bp
Occurrence
44 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
4
Longueur
589
Type
peptide
Emplacements
Undetermined

Organisme déclaré:
Mycobacterium gilvum

Organisme déterminé:
  • Mycobacterium gilvum PYR-GCK

    Mycobacterium gilvum PYR-GCK

    • Accès à la base de données publique
      GI:145221089
      YP_001131767
    • Longueur du coup
      589 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 189,1 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      100% cov
      YP_001131767
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      589 aa
    • Chaîne CIGARE
      589M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium gilvum Spyr1

    Mycobacterium gilvum Spyr1

    • Accès à la base de données publique
      GI:315441947
      YP_004074826
    • Longueur du coup
      586 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 178,3 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      99,49%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      99,49% cov
      YP_004074826
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      586 aa
    • Chaîne CIGARE
      3H384MN201M incompatibilités: 1 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium sp. JLS

    Mycobacterium sp. JLS

    • Accès à la base de données publique
      GI:126432749
      YP_001068440
    • Longueur du coup
      580 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 101,7 bits
    • Similarité
      98,08%
    • Couverture
      97,45%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      97,45% cov
      YP_001068440
      98,97% cov
    • Longueur d'alignement
      574 aa
    • Chaîne CIGARE
      14HMNM4N4MNM2N14MN12MN30MN6MN3MN72MN17MN72M2N54MNMN3MN4MN14M2N15MN7MN9MN160MN4MN42M1H incompatibilités: 28 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium sp. MCS

    Mycobacterium sp. MCS

    • Accès à la base de données publique
      GI:108797126
      YP_637323
    • Longueur du coup
      580 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 100,9 bits
    • Similarité
      97,41%
    • Couverture
      97,79%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      97,79% cov
      YP_637323
      99,83% cov
    • Longueur d'alignement
      579 aa
  • Mycobacterium abscessus

    Mycobacterium abscessus

    • Accès à la base de données publique
      GI:169631619
      YP_001705268
    • Longueur du coup
      578 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 065,8 bits
    • Similarité
      95,67%
    • Couverture
      97,79%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      97,79% cov
      YP_001705268
      99,83% cov
    • Longueur d'alignement
      577 aa
  • Mycobacterium smegmatis str. MC2 155

    Mycobacterium smegmatis str. MC2 155

    • Accès à la base de données publique
      GI:118471241
      YP_884644
    • Longueur du coup
      571 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 059,7 bits
    • Similarité
      95,15%
    • Couverture
      97,96%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      97,96% cov
      YP_884644
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      577 aa
  • Mycobacterium vanbaalenii PYR-1

    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1

    • Accès à la base de données publique
      GI:120401201
      YP_951030
    • Longueur du coup
      565 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 017,7 bits
    • Similarité
      94,85%
    • Couverture
      95,59%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      95,59% cov
      YP_951030
      99,65% cov
    • Longueur d'alignement
      563 aa
  • Dietzia cinnamea P4

    Dietzia cinnamea P4

    • Accès à la base de données publique
      GI:319949518
      ZP_08023568
    • Longueur du coup
      581 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      996,5 bits
    • Similarité
      93,45%
    • Couverture
      95,93%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      95,93% cov
      ZP_08023568
      97,25% cov
    • Longueur d'alignement
      565 aa
  • Rhodococcus opacus B4

    Rhodococcus opacus B4

    • Accès à la base de données publique
      GI:226364558
      YP_002782340
    • Longueur du coup
      564 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      980,3 bits
    • Similarité
      93,2%
    • Couverture
      94,91%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      94,91% cov
      YP_002782340
      99,11% cov
    • Longueur d'alignement
      559 aa
  • Rhodococcus erythropolis PR4

    Rhodococcus erythropolis PR4

    • Accès à la base de données publique
      GI:226308541
      YP_002768501
    • Longueur du coup
      564 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      975,7 bits
    • Similarité
      93,02%
    • Couverture
      94,91%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      94,91% cov
      YP_002768501
      99,11% cov
    • Longueur d'alignement
      559 aa
  • Nocardia farcinica IFM 10152

    Nocardia farcinica IFM 10152

    • Accès à la base de données publique
      GI:54023141
      YP_117383
    • Longueur du coup
      568 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      975,3 bits
    • Similarité
      93,02%
    • Couverture
      94,91%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      94,91% cov
      YP_117383
      98,42% cov
    • Longueur d'alignement
      559 aa
  • Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

    Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

    • Accès à la base de données publique
      GI:41409729
      NP_962565
    • Longueur du coup
      575 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      972,6 bits
    • Similarité
      92,67%
    • Couverture
      94,91%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      94,91% cov
      NP_962565
      97,22% cov
    • Longueur d'alignement
      559 aa
  • Rhodococcus equi ATCC 33707

    Rhodococcus equi ATCC 33707

    • Accès à la base de données publique
      GI:325677173
      ZP_08156839
    • Longueur du coup
      573 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      972,6 bits
    • Similarité
      92,69%
    • Couverture
      95,25%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      95,25% cov
      ZP_08156839
      97,91% cov
    • Longueur d'alignement
      561 aa
Occurrence
48 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
5
Longueur
1 716
Type
DNA
Emplacements
Undetermined

Organisme déclaré:
Mycobacterium smegmatis

Organisme déterminé:
  • Mycobacterium smegmatis str. MC2 155

    Mycobacterium smegmatis str. MC2 155

    • Accès à la base de données publique
      GI:118168627
      CP000480
    • Longueur du coup
      6 988 209 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      3 170 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      CP000480
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      1 716 bp
    • Chaîne CIGARE
      1716M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium sp. JLS

    Mycobacterium sp. JLS

    • Accès à la base de données publique
      GI:126232413
      CP000580
    • Longueur du coup
      6 048 425 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 934,6 bits
    • Similarité
      87,53%
    • Couverture
      97,73%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      97,73% cov
      CP000580
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 684 bp
    • Chaîne CIGARE
      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 incompatibilités: 196 - insertions: 7 - suppressions: 7
  • Mycobacterium sp. KMS

    Mycobacterium sp. KMS

    • Accès à la base de données publique
      GI:119692146
      CP000518
    • Longueur du coup
      5 737 227 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 912,4 bits
    • Similarité
      87,31%
    • Couverture
      97,73%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      97,73% cov
      CP000518
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 686 bp
    • Chaîne CIGARE
      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 incompatibilités: 196 - insertions: 9 - suppressions: 9
  • Mycobacterium sp. MCS

    Mycobacterium sp. MCS

    • Accès à la base de données publique
      GI:108767400
      CP000384
    • Longueur du coup
      5 705 448 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 912,4 bits
    • Similarité
      87,31%
    • Couverture
      97,73%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      97,73% cov
      CP000384
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 686 bp
  • Mycobacterium gilvum PYR-GCK

    Mycobacterium gilvum PYR-GCK

    • Accès à la base de données publique
      GI:145213092
      CP000656
    • Longueur du coup
      5 619 607 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 886,5 bits
    • Similarité
      87,06%
    • Couverture
      97,79%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      97,79% cov
      CP000656
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 693 bp
  • Mycobacterium gilvum Spyr1

    Mycobacterium gilvum Spyr1

    • Accès à la base de données publique
      GI:315259999
      CP002385
    • Longueur du coup
      5 547 747 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 875,5 bits
    • Similarité
      86,95%
    • Couverture
      97,79%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      97,79% cov
      CP002385
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 693 bp
  • Mycobacterium abscessus

    Mycobacterium abscessus

    • Accès à la base de données publique
      GI:169239075
      CU458896
    • Longueur du coup
      5 067 172 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 812,7 bits
    • Similarité
      86,3%
    • Couverture
      97,55%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      97,55% cov
      CU458896
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 686 bp
  • Mycobacterium avium 104

    Mycobacterium avium 104

    • Accès à la base de données publique
      GI:118163506
      CP000479
    • Longueur du coup
      5 475 491 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 663,1 bits
    • Similarité
      84,91%
    • Couverture
      97,73%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      97,73% cov
      CP000479
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 716 bp
  • Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

    Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

    • Accès à la base de données publique
      GI:41400296
      AE016958
    • Longueur du coup
      4 829 781 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 657,6 bits
    • Similarité
      84,85%
    • Couverture
      97,73%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      97,73% cov
      AE016958
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 716 bp
  • Mycobacterium vanbaalenii PYR-1

    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1

    • Accès à la base de données publique
      GI:119953846
      CP000511
    • Longueur du coup
      6 491 865 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 600,3 bits
    • Similarité
      84,14%
    • Couverture
      97,84%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      97,84% cov
      CP000511
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 709 bp
  • Rhodococcus opacus B4

    Rhodococcus opacus B4

    • Accès à la base de données publique
      GI:226237899
      AP011115
    • Longueur du coup
      7 913 450 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 491,4 bits
    • Similarité
      83,15%
    • Couverture
      97,2%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      97,2% cov
      AP011115
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      1 703 bp
  • Rhodococcus equi 103S

    Rhodococcus equi 103S

    • Accès à la base de données publique
      GI:311886853
      FN563149
    • Longueur du coup
      5 043 170 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 474,7 bits
    • Similarité
      82,92%
    • Couverture
      97,73%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      97,73% cov
      FN563149
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 715 bp
  • Nocardia farcinica IFM 10152

    Nocardia farcinica IFM 10152

    • Accès à la base de données publique
      GI:54013472
      AP006618
    • Longueur du coup
      6 021 225 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 469,2 bits
    • Similarité
      82,84%
    • Couverture
      97,73%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      97,73% cov
      AP006618
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 713 bp
  • Rhodococcus jostii RHA1

    Rhodococcus jostii RHA1

    • Accès à la base de données publique
      GI:110816552
      CP000431
    • Longueur du coup
      7 804 765 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 460 bits
    • Similarité
      82,76%
    • Couverture
      97,44%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      97,44% cov
      CP000431
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      1 705 bp
  • Sanguibacter keddieii DSM 10542

    Sanguibacter keddieii DSM 10542

    • Accès à la base de données publique
      GI:269095543
      CP001819
    • Longueur du coup
      4 253 413 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 439,7 bits
    • Similarité
      82,74%
    • Couverture
      96,62%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      96,62% cov
      CP001819
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 698 bp
  • Isoptericola variabilis 225

    Isoptericola variabilis 225

    • Accès à la base de données publique
      GI:334105928
      CP002810
    • Longueur du coup
      3 307 740 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 437,8 bits
    • Similarité
      82,67%
    • Couverture
      97,09%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      97,09% cov
      CP002810
      0,05% cov
    • Longueur d'alignement
      1 708 bp
  • [Cellvibrio] gilvus ATCC 13127

    [Cellvibrio] gilvus ATCC 13127

    • Accès à la base de données publique
      GI:336102715
      CP002665
    • Longueur du coup
      3 526 441 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 421,2 bits
    • Similarité
      82,32%
    • Couverture
      97,96%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      97,96% cov
      CP002665
      0,05% cov
    • Longueur d'alignement
      1 719 bp
  • Kineococcus radiotolerans SRS30216 = ATCC BAA-149

    Kineococcus radiotolerans SRS30216 = ATCC BAA-149

    • Accès à la base de données publique
      GI:196121877
      CP000750
    • Longueur du coup
      4 761 183 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 413,8 bits
    • Similarité
      82,28%
    • Couverture
      97,73%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      97,73% cov
      CP000750
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 716 bp
  • Mycobacterium sp. JDM601

    Mycobacterium sp. JDM601

    • Accès à la base de données publique
      GI:333484608
      CP002329
    • Longueur du coup
      4 643 668 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 406,4 bits
    • Similarité
      82,1%
    • Couverture
      98,14%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      98,14% cov
      CP002329
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 721 bp
  • Cellulomonas flavigena DSM 20109

    Cellulomonas flavigena DSM 20109

    • Accès à la base de données publique
      GI:296019684
      CP001964
    • Longueur du coup
      4 123 179 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 406,4 bits
    • Similarité
      82,38%
    • Couverture
      96,62%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      96,62% cov
      CP001964
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 697 bp
  • Cellulomonas fimi ATCC 484

    Cellulomonas fimi ATCC 484

    • Accès à la base de données publique
      GI:332337569
      CP002666
    • Longueur du coup
      4 266 344 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 378,7 bits
    • Similarité
      82,98%
    • Couverture
      91,03%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      91,03% cov
      CP002666
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 598 bp
  • Gordonia bronchialis DSM 43247

    Gordonia bronchialis DSM 43247

    • Accès à la base de données publique
      GI:262083393
      CP001802
    • Longueur du coup
      5 208 602 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 352,9 bits
    • Similarité
      81,77%
    • Couverture
      96,15%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      96,15% cov
      CP001802
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 679 bp
  • Mycobacterium marinum M

    Mycobacterium marinum M

    • Accès à la base de données publique
      GI:183173361
      CP000854
    • Longueur du coup
      6 636 827 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 341,8 bits
    • Similarité
      81,48%
    • Couverture
      97,55%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      97,55% cov
      CP000854
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 706 bp
  • Mycobacterium ulcerans Agy99

    Mycobacterium ulcerans Agy99

    • Accès à la base de données publique
      GI:118568029
      CP000325
    • Longueur du coup
      5 631 606 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 330,7 bits
    • Similarité
      81,37%
    • Couverture
      97,55%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      97,55% cov
      CP000325
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 707 bp
  • Kribbella flavida DSM 17836

    Kribbella flavida DSM 17836

    • Accès à la base de données publique
      GI:283807292
      CP001736
    • Longueur du coup
      7 579 488 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 319,6 bits
    • Similarité
      82,72%
    • Couverture
      89,45%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      89,45% cov
      CP001736
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      1 568 bp
Occurrence
44 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
6
Longueur
571
Type
peptide
Emplacements
Undetermined

Organisme déclaré:
Mycobacterium smegmatis

Organisme déterminé:
  • Mycobacterium smegmatis str. MC2 155

    Mycobacterium smegmatis str. MC2 155

    • Accès à la base de données publique
      GI:118471241
      YP_884644
    • Longueur du coup
      571 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 146 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      YP_884644
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      571 aa
    • Chaîne CIGARE
      571M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium sp. JLS

    Mycobacterium sp. JLS

    • Accès à la base de données publique
      GI:126432749
      YP_001068440
    • Longueur du coup
      580 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 062,4 bits
    • Similarité
      96,63%
    • Couverture
      98,77%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      98,77% cov
      YP_001068440
      97,24% cov
    • Longueur d'alignement
      564 aa
    • Chaîne CIGARE
      6HM2N17MN13MN2MN24MN3MN3MN3MN72MN15MNMN14MN40MN17MN9MN41MN2MNMN3MN6MN29MN7M2NMN6MN9MN53MN5MN8M2N85MN4MN3MN10MNMN11MN8M1H incompatibilités: 37 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium sp. MCS

    Mycobacterium sp. MCS

    • Accès à la base de données publique
      GI:108797126
      YP_637323
    • Longueur du coup
      580 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 060,8 bits
    • Similarité
      96,63%
    • Couverture
      98,77%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      98,77% cov
      YP_637323
      97,24% cov
    • Longueur d'alignement
      564 aa
    • Chaîne CIGARE
      6HM3N16MN13MN2MN24MN3MN3MN3MN72MN15MNMN14MN40MN17MN2MN6MN41MN2MNMN3MN6MN29MN8MNMN3MN2MN9MN53MN5MN8M2N85MN4MN3MN10MNMN11MN8M1H incompatibilités: 39 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium gilvum PYR-GCK

    Mycobacterium gilvum PYR-GCK

    • Accès à la base de données publique
      GI:145221089
      YP_001131767
    • Longueur du coup
      589 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 059,7 bits
    • Similarité
      95,15%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      YP_001131767
      97,96% cov
    • Longueur d'alignement
      577 aa
  • Mycobacterium gilvum Spyr1

    Mycobacterium gilvum Spyr1

    • Accès à la base de données publique
      GI:315441947
      YP_004074826
    • Longueur du coup
      586 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 057,7 bits
    • Similarité
      95,15%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      YP_004074826
      98,46% cov
    • Longueur d'alignement
      577 aa
  • Mycobacterium abscessus

    Mycobacterium abscessus

    • Accès à la base de données publique
      GI:169631619
      YP_001705268
    • Longueur du coup
      578 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 057,4 bits
    • Similarité
      96,45%
    • Couverture
      98,6%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      98,6% cov
      YP_001705268
      97,4% cov
    • Longueur d'alignement
      563 aa
  • Mycobacterium vanbaalenii PYR-1

    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1

    • Accès à la base de données publique
      GI:120401201
      YP_951030
    • Longueur du coup
      565 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 003,8 bits
    • Similarité
      94,05%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      YP_951030
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      571 aa
  • Dietzia cinnamea P4

    Dietzia cinnamea P4

    • Accès à la base de données publique
      GI:319949518
      ZP_08023568
    • Longueur du coup
      581 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      994,6 bits
    • Similarité
      94,1%
    • Couverture
      97,9%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      97,9% cov
      ZP_08023568
      96,21% cov
    • Longueur d'alignement
      559 aa
  • Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

    Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

    • Accès à la base de données publique
      GI:41409729
      NP_962565
    • Longueur du coup
      575 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      987,6 bits
    • Similarité
      92,33%
    • Couverture
      99,82%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      99,82% cov
      NP_962565
      99,83% cov
    • Longueur d'alignement
      574 aa
  • Mycobacterium avium 104

    Mycobacterium avium 104

    • Accès à la base de données publique
      GI:118466019
      YP_884110
    • Longueur du coup
      575 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      985,3 bits
    • Similarité
      92,16%
    • Couverture
      99,82%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      99,82% cov
      YP_884110
      99,83% cov
    • Longueur d'alignement
      574 aa
  • Rhodococcus opacus B4

    Rhodococcus opacus B4

    • Accès à la base de données publique
      GI:226364558
      YP_002782340
    • Longueur du coup
      564 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      983,4 bits
    • Similarité
      93,06%
    • Couverture
      98,42%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      98,42% cov
      YP_002782340
      99,65% cov
    • Longueur d'alignement
      562 aa
  • Rhodococcus equi ATCC 33707

    Rhodococcus equi ATCC 33707

    • Accès à la base de données publique
      GI:325677173
      ZP_08156839
    • Longueur du coup
      573 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      981,5 bits
    • Similarité
      93,05%
    • Couverture
      98,25%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      98,25% cov
      ZP_08156839
      97,91% cov
    • Longueur d'alignement
      561 aa
  • Rhodococcus equi 103S

    Rhodococcus equi 103S

    • Accès à la base de données publique
      GI:312141607
      YP_004008943
    • Longueur du coup
      573 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      980,7 bits
    • Similarité
      93,05%
    • Couverture
      98,25%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      98,25% cov
      YP_004008943
      97,91% cov
    • Longueur d'alignement
      561 aa
Occurrence
48 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
7
Longueur
1 698
Type
DNA
Emplacements
Undetermined

Organisme déclaré:
Mycobacterium vanbaalenii

Organisme déterminé:
  • Mycobacterium vanbaalenii PYR-1

    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1

    • Accès à la base de données publique
      GI:119953846
      CP000511
    • Longueur du coup
      6 491 865 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      3 136,7 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      100% cov
      CP000511
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 698 bp
    • Chaîne CIGARE
      1698M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

    Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

    • Accès à la base de données publique
      GI:41400296
      AE016958
    • Longueur du coup
      4 829 781 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 831,2 bits
    • Similarité
      86,59%
    • Couverture
      99%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      99% cov
      AE016958
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 715 bp
    • Chaîne CIGARE
      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 incompatibilités: 162 - insertions: 34 - suppressions: 34
  • Mycobacterium avium 104

    Mycobacterium avium 104

    • Accès à la base de données publique
      GI:118163506
      CP000479
    • Longueur du coup
      5 475 491 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 814,5 bits
    • Similarité
      86,41%
    • Couverture
      99%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      99% cov
      CP000479
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 714 bp
    • Chaîne CIGARE
      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 incompatibilités: 167 - insertions: 33 - suppressions: 33
  • Mycobacterium sp. JLS

    Mycobacterium sp. JLS

    • Accès à la base de données publique
      GI:126232413
      CP000580
    • Longueur du coup
      6 048 425 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 748,1 bits
    • Similarité
      85,55%
    • Couverture
      99,35%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      99,35% cov
      CP000580
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 709 bp
  • Mycobacterium sp. KMS

    Mycobacterium sp. KMS

    • Accès à la base de données publique
      GI:119692146
      CP000518
    • Longueur du coup
      5 737 227 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 737 bits
    • Similarité
      85,45%
    • Couverture
      99,35%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      99,35% cov
      CP000518
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 711 bp
  • Mycobacterium sp. MCS

    Mycobacterium sp. MCS

    • Accès à la base de données publique
      GI:108767400
      CP000384
    • Longueur du coup
      5 705 448 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 737 bits
    • Similarité
      85,45%
    • Couverture
      99,35%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      99,35% cov
      CP000384
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 711 bp
  • Nocardia farcinica IFM 10152

    Nocardia farcinica IFM 10152

    • Accès à la base de données publique
      GI:54013472
      AP006618
    • Longueur du coup
      6 021 225 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 701,9 bits
    • Similarité
      85,23%
    • Couverture
      98,76%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      98,76% cov
      AP006618
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 706 bp
  • Mycobacterium gilvum PYR-GCK

    Mycobacterium gilvum PYR-GCK

    • Accès à la base de données publique
      GI:145213092
      CP000656
    • Longueur du coup
      5 619 607 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 700 bits
    • Similarité
      85,02%
    • Couverture
      99,41%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      99,41% cov
      CP000656
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 709 bp
  • Mycobacterium gilvum Spyr1

    Mycobacterium gilvum Spyr1

    • Accès à la base de données publique
      GI:315259999
      CP002385
    • Longueur du coup
      5 547 747 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 689 bits
    • Similarité
      84,9%
    • Couverture
      99,41%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      99,41% cov
      CP002385
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 709 bp
  • Mycobacterium smegmatis str. MC2 155

    Mycobacterium smegmatis str. MC2 155

    • Accès à la base de données publique
      GI:118168627
      CP000480
    • Longueur du coup
      6 988 209 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 600,3 bits
    • Similarité
      84,14%
    • Couverture
      98,88%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      98,88% cov
      CP000480
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      1 709 bp
  • Mycobacterium sp. JDM601

    Mycobacterium sp. JDM601

    • Accès à la base de données publique
      GI:333484608
      CP002329
    • Longueur du coup
      4 643 668 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 580 bits
    • Similarité
      83,91%
    • Couverture
      98,76%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      98,76% cov
      CP002329
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 703 bp
  • Rhodococcus equi 103S

    Rhodococcus equi 103S

    • Accès à la base de données publique
      GI:311886853
      FN563149
    • Longueur du coup
      5 043 170 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 557,8 bits
    • Similarité
      83,71%
    • Couverture
      98,76%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      98,76% cov
      FN563149
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 707 bp
  • Rhodococcus opacus B4

    Rhodococcus opacus B4

    • Accès à la base de données publique
      GI:226237899
      AP011115
    • Longueur du coup
      7 913 450 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 557,8 bits
    • Similarité
      83,78%
    • Couverture
      98,23%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      98,23% cov
      AP011115
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      1 695 bp
  • Mycobacterium abscessus

    Mycobacterium abscessus

    • Accès à la base de données publique
      GI:169239075
      CU458896
    • Longueur du coup
      5 067 172 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 548,6 bits
    • Similarité
      83,55%
    • Couverture
      99%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      99% cov
      CU458896
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 708 bp
  • Rhodococcus jostii RHA1

    Rhodococcus jostii RHA1

    • Accès à la base de données publique
      GI:110816552
      CP000431
    • Longueur du coup
      7 804 765 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 543,1 bits
    • Similarité
      83,59%
    • Couverture
      98,47%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      98,47% cov
      CP000431
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      1 700 bp
  • Mycobacterium tuberculosis KZN 4207

    Mycobacterium tuberculosis KZN 4207

    • Accès à la base de données publique
      GI:328456706
      CP001662
    • Longueur du coup
      4 394 985 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 434,1 bits
    • Similarité
      82,38%
    • Couverture
      99,12%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      99,12% cov
      CP001662
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 714 bp
  • Mycobacterium tuberculosis KZN 1435

    Mycobacterium tuberculosis KZN 1435

    • Accès à la base de données publique
      GI:253318418
      CP001658
    • Longueur du coup
      4 398 250 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 434,1 bits
    • Similarité
      82,38%
    • Couverture
      99,12%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      99,12% cov
      CP001658
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 714 bp
  • Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172

    Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172

    • Accès à la base de données publique
      GI:224771496
      AP010918
    • Longueur du coup
      4 371 711 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 434,1 bits
    • Similarité
      82,38%
    • Couverture
      99,12%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      99,12% cov
      AP010918
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 714 bp
  • Mycobacterium tuberculosis F11

    Mycobacterium tuberculosis F11

    • Accès à la base de données publique
      GI:148719718
      CP000717
    • Longueur du coup
      4 424 435 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 434,1 bits
    • Similarité
      82,38%
    • Couverture
      99,12%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      99,12% cov
      CP000717
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 714 bp
  • Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2

    Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2

    • Accès à la base de données publique
      GI:121491530
      AM408590
    • Longueur du coup
      4 374 522 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 434,1 bits
    • Similarité
      82,38%
    • Couverture
      99,12%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      99,12% cov
      AM408590
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 714 bp
  • Expression vector mce1

    Expression vector mce1

    • Accès à la base de données publique
      GI:110348056
      DQ823230
    • Longueur du coup
      45 971 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 434,1 bits
    • Similarité
      82,38%
    • Couverture
      99,12%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      99,12% cov
      DQ823230
      3,66% cov
    • Longueur d'alignement
      1 714 bp
  • Mycobacterium tuberculosis H37Rv

    Mycobacterium tuberculosis H37Rv

    • Accès à la base de données publique
      GI:41352722
      BX842572
    • Longueur du coup
      341 957 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 434,1 bits
    • Similarité
      82,38%
    • Couverture
      99,12%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      99,12% cov
      BX842572
      0,49% cov
    • Longueur d'alignement
      1 714 bp
  • Mycobacterium bovis AF2122/97

    Mycobacterium bovis AF2122/97

    • Accès à la base de données publique
      GI:31616762
      BX248334
    • Longueur du coup
      343 050 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 434,1 bits
    • Similarité
      82,38%
    • Couverture
      99,12%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      99,12% cov
      BX248334
      0,49% cov
    • Longueur d'alignement
      1 714 bp
  • Mycobacterium tuberculosis H37Ra

    Mycobacterium tuberculosis H37Ra

    • Accès à la base de données publique
      GI:148503909
      CP000611
    • Longueur du coup
      4 419 977 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 428,6 bits
    • Similarité
      82,33%
    • Couverture
      99,12%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      99,12% cov
      CP000611
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 715 bp
  • Mycobacterium tuberculosis CDC1551

    Mycobacterium tuberculosis CDC1551

    • Accès à la base de données publique
      GI:50952454
      AE000516
    • Longueur du coup
      4 403 837 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 428,6 bits
    • Similarité
      82,32%
    • Couverture
      99,12%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      99,12% cov
      AE000516
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 714 bp
Occurrence
44 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
8
Longueur
565
Type
peptide
Emplacements
Undetermined

Organisme déclaré:
Mycobacterium vanbaalenii

Organisme déterminé:
  • Mycobacterium vanbaalenii PYR-1

    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1

    • Accès à la base de données publique
      GI:120401201
      YP_951030
    • Longueur du coup
      565 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 124,4 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      YP_951030
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      565 aa
    • Chaîne CIGARE
      565M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium sp. MCS

    Mycobacterium sp. MCS

    • Accès à la base de données publique
      GI:108797126
      YP_637323
    • Longueur du coup
      580 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 024,6 bits
    • Similarité
      95,55%
    • Couverture
      99,47%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      99,47% cov
      YP_637323
      96,9% cov
    • Longueur d'alignement
      562 aa
    • Chaîne CIGARE
      2H18MN13MNM2N17MN2MN3M2N2MN2M2N5MN26MN8MN7MN9MN18MN3MN2M2N2MN4M2N18MN5MN36MNMNMNMN3M2N5MN4MN40MN15MN12M2N2M2N2MN23MN2MN9MN11M3N124M2N3MN11M2N2M2N3MN2MN25MN4M1H incompatibilités: 56 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium sp. JLS

    Mycobacterium sp. JLS

    • Accès à la base de données publique
      GI:126432749
      YP_001068440
    • Longueur du coup
      580 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 023,1 bits
    • Similarité
      95,55%
    • Couverture
      99,47%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      99,47% cov
      YP_001068440
      96,9% cov
    • Longueur d'alignement
      562 aa
    • Chaîne CIGARE
      2HMN16MN13MNM2N17MN2MN3M2N2MN2M2N5MN26MN8MN7MN9MN18MN3MN2M2N2MN4M2N18MN5MN36MNMNMNMN3M2N2MN2MN4MN40MN15MN12M2N2M2N2MN16MN9MN9MN11M3N124M2N3MN11M2N2M2N3MN2MN25MN4M1H incompatibilités: 58 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium gilvum PYR-GCK

    Mycobacterium gilvum PYR-GCK

    • Accès à la base de données publique
      GI:145221089
      YP_001131767
    • Longueur du coup
      589 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 017,7 bits
    • Similarité
      94,85%
    • Couverture
      99,65%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      99,65% cov
      YP_001131767
      95,59% cov
    • Longueur d'alignement
      563 aa
  • Mycobacterium gilvum Spyr1

    Mycobacterium gilvum Spyr1

    • Accès à la base de données publique
      GI:315441947
      YP_004074826
    • Longueur du coup
      586 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 015,4 bits
    • Similarité
      94,85%
    • Couverture
      99,65%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      99,65% cov
      YP_004074826
      96,08% cov
    • Longueur d'alignement
      563 aa
  • Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

    Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

    • Accès à la base de données publique
      GI:41409729
      NP_962565
    • Longueur du coup
      575 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 006,1 bits
    • Similarité
      94,65%
    • Couverture
      99,29%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      99,29% cov
      NP_962565
      97,57% cov
    • Longueur d'alignement
      561 aa
  • Mycobacterium avium 104

    Mycobacterium avium 104

    • Accès à la base de données publique
      GI:118466019
      YP_884110
    • Longueur du coup
      575 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 005,4 bits
    • Similarité
      94,47%
    • Couverture
      99,29%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      99,29% cov
      YP_884110
      97,57% cov
    • Longueur d'alignement
      561 aa
  • Mycobacterium smegmatis str. MC2 155

    Mycobacterium smegmatis str. MC2 155

    • Accès à la base de données publique
      GI:118471241
      YP_884644
    • Longueur du coup
      571 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 003,8 bits
    • Similarité
      94,05%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      YP_884644
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      571 aa
  • Mycobacterium abscessus

    Mycobacterium abscessus

    • Accès à la base de données publique
      GI:169631619
      YP_001705268
    • Longueur du coup
      578 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 003 bits
    • Similarité
      94,13%
    • Couverture
      99,47%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      99,47% cov
      YP_001705268
      97,23% cov
    • Longueur d'alignement
      562 aa
  • Rhodococcus erythropolis PR4

    Rhodococcus erythropolis PR4

    • Accès à la base de données publique
      GI:226308541
      YP_002768501
    • Longueur du coup
      564 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      994,6 bits
    • Similarité
      93,95%
    • Couverture
      99,47%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      99,47% cov
      YP_002768501
      99,65% cov
    • Longueur d'alignement
      562 aa
  • Mycobacterium tuberculosis H37Rv

    Mycobacterium tuberculosis H37Rv

    • Accès à la base de données publique
      GI:15607330
      NP_214703
    • Longueur du coup
      575 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      994,2 bits
    • Similarité
      93,56%
    • Couverture
      98,94%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      98,94% cov
      NP_214703
      97,22% cov
    • Longueur d'alignement
      559 aa
  • Mycobacterium kansasii ATCC 12478

    Mycobacterium kansasii ATCC 12478

    • Accès à la base de données publique
      GI:240172069
      ZP_04750728
    • Longueur du coup
      564 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      994,2 bits
    • Similarité
      93,44%
    • Couverture
      99,82%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      99,82% cov
      ZP_04750728
      99,82% cov
    • Longueur d'alignement
      564 aa
  • Rhodococcus equi 103S

    Rhodococcus equi 103S

    • Accès à la base de données publique
      GI:312141607
      YP_004008943
    • Longueur du coup
      573 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      993,8 bits
    • Similarité
      93,94%
    • Couverture
      99,29%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      99,29% cov
      YP_004008943
      97,91% cov
    • Longueur d'alignement
      561 aa
Occurrence
48 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
9
Longueur
1 707
Type
DNA
Emplacements
Undetermined

Organisme déclaré:
Nocardia farcinica

Organisme déterminé:
  • Nocardia farcinica IFM 10152

    Nocardia farcinica IFM 10152

    • Accès à la base de données publique
      GI:54013472
      AP006618
    • Longueur du coup
      6 021 225 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      3 153,4 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      AP006618
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 707 bp
    • Chaîne CIGARE
      1707M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

    Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

    • Accès à la base de données publique
      GI:41400296
      AE016958
    • Longueur du coup
      4 829 781 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 809 bits
    • Similarité
      86,31%
    • Couverture
      98,48%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      98,48% cov
      AE016958
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 709 bp
    • Chaîne CIGARE
      21H6MN7MN5MN2MN14MN5MIMNMDN10MN2MN8MN5MN14MN4M2NM2N14MN2MN2MN2MN17MN26MN2MD2MN3MNMI6MN5MN8MN2MN4MN4MN2MN19MN48MND2MI4MN17MN23MN2MN23MN44MN9MND2MI13MN17M2NMN8MN10MN36MN5MN21M2D3MN2MNIMI16MN2MN2MN38MN8MN11MN14MN11MN8MN2MN5MN23MNMN6MN8MN8MN65MN17MN11MN18MN4MN2MN5MN8MD2MNI4MN3M2NMN8MN3MI2MD3MNMI3MIMDM2N2MD32MD2MI2MN11MN7MN28MNMN5MN15MN4MN8MN2MN2MN5MNI2MD2MN2MN3MN7MN3MIMND30MN4MN2MN2MNMN7MNMN2MD3MI21MDMI3MN13MND3MI8MN2MN8MN5M4N5MN3MIMND5MN2MN5MN5MD2MI3MN2MN6MN10MN18MND3MI5MN6MN5MN20MN5MN14MN10MN3MN11MI4MD4MN12MNMN23MN2MN2MN2MN14MN3MN21M2N2MN8MN2MIMDMN20MN2MN5MN3MNIMI3M2NM2D5MNMN2MN2MN2MN2MN6MN4MNIM2I4MD2MD4M2NM2NMND4MN6MN7MN2I3MD2MD5MN9M2N6MN8MN2M2N2MN7MN7M5H incompatibilités: 178 - insertions: 28 - suppressions: 28
  • Mycobacterium avium 104

    Mycobacterium avium 104

    • Accès à la base de données publique
      GI:118163506
      CP000479
    • Longueur du coup
      5 475 491 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 803,5 bits
    • Similarité
      86,27%
    • Couverture
      98,48%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      98,48% cov
      CP000479
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 711 bp
    • Chaîne CIGARE
      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 incompatibilités: 175 - insertions: 30 - suppressions: 30
  • Rhodococcus opacus B4

    Rhodococcus opacus B4

    • Accès à la base de données publique
      GI:226237899
      AP011115
    • Longueur du coup
      7 913 450 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 799,8 bits
    • Similarité
      86,12%
    • Couverture
      98,89%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      98,89% cov
      AP011115
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      1 715 bp
  • Mycobacterium vanbaalenii PYR-1

    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1

    • Accès à la base de données publique
      GI:119953846
      CP000511
    • Longueur du coup
      6 491 865 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 701,9 bits
    • Similarité
      85,22%
    • Couverture
      98,24%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      98,24% cov
      CP000511
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 705 bp
  • Rhodococcus equi 103S

    Rhodococcus equi 103S

    • Accès à la base de données publique
      GI:311886853
      FN563149
    • Longueur du coup
      5 043 170 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 689 bits
    • Similarité
      85,03%
    • Couverture
      98,54%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      98,54% cov
      FN563149
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 710 bp
  • Rhodococcus jostii RHA1

    Rhodococcus jostii RHA1

    • Accès à la base de données publique
      GI:110816552
      CP000431
    • Longueur du coup
      7 804 765 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 676 bits
    • Similarité
      84,84%
    • Couverture
      98,65%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      98,65% cov
      CP000431
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      1 709 bp
  • Mycobacterium sp. KMS

    Mycobacterium sp. KMS

    • Accès à la base de données publique
      GI:119692146
      CP000518
    • Longueur du coup
      5 737 227 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 570,8 bits
    • Similarité
      83,82%
    • Couverture
      98,3%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      98,3% cov
      CP000518
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 706 bp
  • Mycobacterium sp. MCS

    Mycobacterium sp. MCS

    • Accès à la base de données publique
      GI:108767400
      CP000384
    • Longueur du coup
      5 705 448 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 570,8 bits
    • Similarité
      83,82%
    • Couverture
      98,3%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      98,3% cov
      CP000384
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 706 bp
  • Mycobacterium sp. JLS

    Mycobacterium sp. JLS

    • Accès à la base de données publique
      GI:126232413
      CP000580
    • Longueur du coup
      6 048 425 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 559,7 bits
    • Similarité
      83,69%
    • Couverture
      98,3%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      98,3% cov
      CP000580
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 704 bp
  • Mycobacterium sp. JDM601

    Mycobacterium sp. JDM601

    • Accès à la base de données publique
      GI:333484608
      CP002329
    • Longueur du coup
      4 643 668 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 522,8 bits
    • Similarité
      83,37%
    • Couverture
      98,36%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      98,36% cov
      CP002329
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 714 bp
  • [Cellvibrio] gilvus ATCC 13127

    [Cellvibrio] gilvus ATCC 13127

    • Accès à la base de données publique
      GI:336102715
      CP002665
    • Longueur du coup
      3 526 441 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 513,5 bits
    • Similarité
      83,54%
    • Couverture
      96,66%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      96,66% cov
      CP002665
      0,05% cov
    • Longueur d'alignement
      1 683 bp
  • Mycobacterium marinum M

    Mycobacterium marinum M

    • Accès à la base de données publique
      GI:183173361
      CP000854
    • Longueur du coup
      6 636 827 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 508 bits
    • Similarité
      83,24%
    • Couverture
      98,07%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      98,07% cov
      CP000854
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 706 bp
  • Mycobacterium gilvum PYR-GCK

    Mycobacterium gilvum PYR-GCK

    • Accès à la base de données publique
      GI:145213092
      CP000656
    • Longueur du coup
      5 619 607 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 504,3 bits
    • Similarité
      83,15%
    • Couverture
      98,3%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      98,3% cov
      CP000656
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 709 bp
  • Isoptericola variabilis 225

    Isoptericola variabilis 225

    • Accès à la base de données publique
      GI:334105928
      CP002810
    • Longueur du coup
      3 307 740 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 502,4 bits
    • Similarité
      83,65%
    • Couverture
      95,78%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      95,78% cov
      CP002810
      0,05% cov
    • Longueur d'alignement
      1 676 bp
  • Mycobacterium ulcerans Agy99

    Mycobacterium ulcerans Agy99

    • Accès à la base de données publique
      GI:118568029
      CP000325
    • Longueur du coup
      5 631 606 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 496,9 bits
    • Similarité
      83,12%
    • Couverture
      98,07%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      98,07% cov
      CP000325
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 706 bp
  • Mycobacterium gilvum Spyr1

    Mycobacterium gilvum Spyr1

    • Accès à la base de données publique
      GI:315259999
      CP002385
    • Longueur du coup
      5 547 747 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 493,2 bits
    • Similarité
      83,03%
    • Couverture
      98,3%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      98,3% cov
      CP002385
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 709 bp
  • Mycobacterium smegmatis str. MC2 155

    Mycobacterium smegmatis str. MC2 155

    • Accès à la base de données publique
      GI:118168627
      CP000480
    • Longueur du coup
      6 988 209 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 469,2 bits
    • Similarité
      82,84%
    • Couverture
      98,24%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      98,24% cov
      CP000480
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      1 713 bp
  • Kineococcus radiotolerans SRS30216 = ATCC BAA-149

    Kineococcus radiotolerans SRS30216 = ATCC BAA-149

    • Accès à la base de données publique
      GI:196121877
      CP000750
    • Longueur du coup
      4 761 183 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 448,9 bits
    • Similarité
      82,6%
    • Couverture
      98,3%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      98,3% cov
      CP000750
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 713 bp
  • Sanguibacter keddieii DSM 10542

    Sanguibacter keddieii DSM 10542

    • Accès à la base de données publique
      GI:269095543
      CP001819
    • Longueur du coup
      4 253 413 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 432,3 bits
    • Similarité
      82,73%
    • Couverture
      96,72%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      96,72% cov
      CP001819
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 691 bp
  • Cellulomonas flavigena DSM 20109

    Cellulomonas flavigena DSM 20109

    • Accès à la base de données publique
      GI:296019684
      CP001964
    • Longueur du coup
      4 123 179 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 419,3 bits
    • Similarité
      82,92%
    • Couverture
      94,38%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      94,38% cov
      CP001964
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 645 bp
  • Mycobacterium abscessus

    Mycobacterium abscessus

    • Accès à la base de données publique
      GI:169239075
      CU458896
    • Longueur du coup
      5 067 172 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 393,5 bits
    • Similarité
      82,02%
    • Couverture
      98,48%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      98,48% cov
      CU458896
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 719 bp
  • Cellulomonas fimi ATCC 484

    Cellulomonas fimi ATCC 484

    • Accès à la base de données publique
      GI:332337569
      CP002666
    • Longueur du coup
      4 266 344 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 382,4 bits
    • Similarité
      82,36%
    • Couverture
      96,02%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      96,02% cov
      CP002666
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 684 bp
  • Mycobacterium tuberculosis KZN 4207

    Mycobacterium tuberculosis KZN 4207

    • Accès à la base de données publique
      GI:328456706
      CP001662
    • Longueur du coup
      4 394 985 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 375 bits
    • Similarité
      81,75%
    • Couverture
      98,42%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      98,42% cov
      CP001662
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 710 bp
  • Mycobacterium tuberculosis KZN 1435

    Mycobacterium tuberculosis KZN 1435

    • Accès à la base de données publique
      GI:253318418
      CP001658
    • Longueur du coup
      4 398 250 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 375 bits
    • Similarité
      81,75%
    • Couverture
      98,42%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      98,42% cov
      CP001658
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 710 bp
Occurrence
46 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
10
Longueur
568
Type
peptide
Emplacements
Undetermined

Organisme déclaré:
Nocardia farcinica

Organisme déterminé:
  • Nocardia farcinica IFM 10152

    Nocardia farcinica IFM 10152

    • Accès à la base de données publique
      GI:54023141
      YP_117383
    • Longueur du coup
      568 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 131,3 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      YP_117383
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      568 aa
    • Chaîne CIGARE
      568M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Rhodococcus equi ATCC 33707

    Rhodococcus equi ATCC 33707

    • Accès à la base de données publique
      GI:325677173
      ZP_08156839
    • Longueur du coup
      573 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 032,3 bits
    • Similarité
      93,71%
    • Couverture
      99,82%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 10
      99,82% cov
      ZP_08156839
      99,83% cov
    • Longueur d'alignement
      572 aa
    • Chaîne CIGARE
      M4N3M5IMN12MN23M2N17M2N10MNM2N63MN2MN20MN14MN6MN26MN35MN6M2N35MNMN10MN12MN3MN10MN2MN18MN5MN10MN3M2N11MN16M2N2MN85MN17MNMN5M3N2M2NM3NMN22MN4M1H incompatibilités: 51 - insertions: 5 - suppressions: 0
  • Rhodococcus equi 103S

    Rhodococcus equi 103S

    • Accès à la base de données publique
      GI:312141607
      YP_004008943
    • Longueur du coup
      573 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 031,6 bits
    • Similarité
      93,71%
    • Couverture
      99,82%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 10
      99,82% cov
      YP_004008943
      99,83% cov
    • Longueur d'alignement
      572 aa
    • Chaîne CIGARE
      M4N3M5IMN12MN23M2N17M2N10MNM2N63MN2MN20MN14MN6MN26MN35MN6M2N35MNMN10MN12MN3MN10MN2MN18MN5MN10MN3M2N11MN16M2N2MN85MN10MN6MNMN5M3N2M2NM3NMN22MN4M1H incompatibilités: 52 - insertions: 5 - suppressions: 0
  • Rhodococcus erythropolis PR4

    Rhodococcus erythropolis PR4

    • Accès à la base de données publique
      GI:226308541
      YP_002768501
    • Longueur du coup
      564 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 013,1 bits
    • Similarité
      94,64%
    • Couverture
      98,59%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 10
      98,59% cov
      YP_002768501
      99,29% cov
    • Longueur d'alignement
      560 aa
  • Rhodococcus opacus B4

    Rhodococcus opacus B4

    • Accès à la base de données publique
      GI:226364558
      YP_002782340
    • Longueur du coup
      564 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 010,4 bits
    • Similarité
      94,13%
    • Couverture
      98,94%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 10
      98,94% cov
      YP_002782340
      99,65% cov
    • Longueur d'alignement
      562 aa
  • Rhodococcus jostii RHA1

    Rhodococcus jostii RHA1

    • Accès à la base de données publique
      GI:111022054
      YP_705026
    • Longueur du coup
      564 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      999,6 bits
    • Similarité
      94,66%
    • Couverture
      98,94%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 10
      98,94% cov
      YP_705026
      99,65% cov
    • Longueur d'alignement
      562 aa
  • Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1

    Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1

    • Accès à la base de données publique
      GI:333917733
      YP_004491314
    • Longueur du coup
      568 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      996,5 bits
    • Similarité
      93,65%
    • Couverture
      99,82%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 10
      99,82% cov
      YP_004491314
      99,82% cov
    • Longueur d'alignement
      567 aa
  • Dietzia cinnamea P4

    Dietzia cinnamea P4

    • Accès à la base de données publique
      GI:319949518
      ZP_08023568
    • Longueur du coup
      581 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      995,7 bits
    • Similarité
      94,28%
    • Couverture
      98,42%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 10
      98,42% cov
      ZP_08023568
      96,21% cov
    • Longueur d'alignement
      559 aa
  • Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

    Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

    • Accès à la base de données publique
      GI:41409729
      NP_962565
    • Longueur du coup
      575 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      993,8 bits
    • Similarité
      92,93%
    • Couverture
      99,65%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 10
      99,65% cov
      NP_962565
      98,43% cov
    • Longueur d'alignement
      566 aa
  • Mycobacterium avium 104

    Mycobacterium avium 104

    • Accès à la base de données publique
      GI:118466019
      YP_884110
    • Longueur du coup
      575 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      993 bits
    • Similarité
      92,93%
    • Couverture
      99,65%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 10
      99,65% cov
      YP_884110
      98,43% cov
    • Longueur d'alignement
      566 aa
  • Mycobacterium vanbaalenii PYR-1

    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1

    • Accès à la base de données publique
      GI:120401201
      YP_951030
    • Longueur du coup
      565 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      991,5 bits
    • Similarité
      93,95%
    • Couverture
      98,94%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 10
      98,94% cov
      YP_951030
      99,47% cov
    • Longueur d'alignement
      562 aa
  • Mycobacterium sp. JLS

    Mycobacterium sp. JLS

    • Accès à la base de données publique
      GI:126432749
      YP_001068440
    • Longueur du coup
      580 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      989,2 bits
    • Similarité
      93,24%
    • Couverture
      98,94%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 10
      98,94% cov
      YP_001068440
      96,9% cov
    • Longueur d'alignement
      562 aa
  • Mycobacterium sp. MCS

    Mycobacterium sp. MCS

    • Accès à la base de données publique
      GI:108797126
      YP_637323
    • Longueur du coup
      580 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      987,3 bits
    • Similarité
      93,24%
    • Couverture
      98,94%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 10
      98,94% cov
      YP_637323
      96,9% cov
    • Longueur d'alignement
      562 aa
Occurrence
50 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq

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