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recherche de séquences biologiques divulguées dans les brevets

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Données obtenues à partir de: DDBJ Pat NCBI GenBank USPTO Fulltext EMBL-EBI Pat
8 séquences trouvées dans ce brevet (au total)

Affichage de 8 séquences

SEQ ID NO
Longueur
Type
Emplacements
Organisms
Occurrence
Outils
SEQ ID NO
1
Longueur
884
Type
peptide
Emplacements
Detailed Description

Organisme déclaré:
Homo sapiens

Organisme déterminé:
  • Homo sapiens

    Homo sapiens

    • Accès à la base de données publique
      GI:3095032
      AAC15472
      1 de 4 hits signalés pour Homo sapiens.
    • Longueur du coup
      884 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 849,3 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      100% cov
      AAC15472
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      884 aa
    • Chaîne CIGARE
      884M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Macaca mulatta

    Macaca mulatta

    • Accès à la base de données publique
      GI:297265860
      XP_001103468
    • Longueur du coup
      1 066 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 835,8 bits
    • Similarité
      99,66%
    • Couverture
      99,77%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      99,77% cov
      XP_001103468
      82,74% cov
    • Longueur d'alignement
      882 aa
  • Nomascus leucogenys

    Nomascus leucogenys

    • Accès à la base de données publique
      GI:332227269
      XP_003262815
      1 de 2 hits signalés pour Nomascus leucogenys.
    • Longueur du coup
      894 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 835,5 bits
    • Similarité
      99,66%
    • Couverture
      99,77%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      99,77% cov
      XP_003262815
      98,66% cov
    • Longueur d'alignement
      882 aa
  • Pan troglodytes

    Pan troglodytes

    • Accès à la base de données publique
      GI:332813340
      XP_515427
    • Longueur du coup
      890 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 719,1 bits
    • Similarité
      98,53%
    • Couverture
      99,77%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      99,77% cov
      XP_515427
      98,65% cov
    • Longueur d'alignement
      884 aa
  • Canis lupus familiaris

    Canis lupus familiaris

    • Accès à la base de données publique
      GI:73980764
      XP_532943
    • Longueur du coup
      894 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 708 bits
    • Similarité
      98,98%
    • Couverture
      99,77%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      99,77% cov
      XP_532943
      98,66% cov
    • Longueur d'alignement
      882 aa
  • Bos taurus

    Bos taurus

    • Accès à la base de données publique
      GI:300793911
      NP_001178091
    • Longueur du coup
      894 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 704,9 bits
    • Similarité
      98,98%
    • Couverture
      99,77%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      99,77% cov
      NP_001178091
      98,66% cov
    • Longueur d'alignement
      882 aa
  • Callithrix jacchus

    Callithrix jacchus

    • Accès à la base de données publique
      GI:296224030
      XP_002757874
    • Longueur du coup
      893 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 701,8 bits
    • Similarité
      98,64%
    • Couverture
      99,77%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      99,77% cov
      XP_002757874
      98,66% cov
    • Longueur d'alignement
      882 aa
  • Mus musculus

    Mus musculus

    • Accès à la base de données publique
      GI:152031635
      Q99JP0
      1 de 2 hits signalés pour Mus musculus.
    • Longueur du coup
      894 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 687,9 bits
    • Similarité
      97,62%
    • Couverture
      99,77%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      99,77% cov
      Q99JP0
      98,66% cov
    • Longueur d'alignement
      882 aa
  • Monodelphis domestica

    Monodelphis domestica

    • Accès à la base de données publique
      GI:334313091
      XP_001364075
    • Longueur du coup
      894 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 672,5 bits
    • Similarité
      97,73%
    • Couverture
      99,77%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      99,77% cov
      XP_001364075
      98,66% cov
    • Longueur d'alignement
      882 aa
  • Oryctolagus cuniculus

    Oryctolagus cuniculus

    • Accès à la base de données publique
      GI:291386891
      XP_002709795
    • Longueur du coup
      879 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 659,8 bits
    • Similarité
      96,6%
    • Couverture
      99,77%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      99,77% cov
      XP_002709795
      98,63% cov
    • Longueur d'alignement
      882 aa
Occurrence
11 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
2
Longueur
4 380
Type
nucleotide
Emplacements
Detailed Description

Organisme déclaré:
Homo sapiens

Organisme déterminé:
  • Homo sapiens

    Homo sapiens

    • Accès à la base de données publique
      GI:3095031
      AF000145
      1 de 5 hits signalés pour Homo sapiens.
    • Longueur du coup
      4 380 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      8 089,4 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      AF000145
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      4 380 bp
    • Chaîne CIGARE
      4380M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Nomascus leucogenys

    Nomascus leucogenys

    • Accès à la base de données publique
      GI:332227268
      XM_003262767
      1 de 2 hits signalés pour Nomascus leucogenys.
    • Longueur du coup
      4 403 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      7 121,8 bits
    • Similarité
      98,9%
    • Couverture
      91,05%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      91,05% cov
      XM_003262767
      90,57% cov
    • Longueur d'alignement
      3 992 bp
    • Chaîne CIGARE
      364H136MN203MN224MN122MN239MN31MN160MN17MN52MN44MN18MN166MN80MN35MN23MN290MN203MN263MN8MN62MN387MN23MN115MN88MN165MN19MI3M2I160MN102MN11MN18MN10MN53MN27MN30MN76MN53MN83MD76M3D12MI45MN16M28H incompatibilités: 36 - insertions: 4 - suppressions: 4
  • Pan troglodytes

    Pan troglodytes

    • Accès à la base de données publique
      GI:332813339
      XM_515427
    • Longueur du coup
      4 453 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      7 105,2 bits
    • Similarité
      98,9%
    • Couverture
      91%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      91% cov
      XM_515427
      89,2% cov
    • Longueur d'alignement
      3 993 bp
    • Chaîne CIGARE
      364H301MN117MN540MN160MN17MN116MN418MIMIMIMI2MIMIMN38MNM2DMDM3DMDM2DMD2MDM5D2MDNM2D2MI501MN137MN411MN145MN152MDMD386MN132MN292MN64M30H incompatibilités: 16 - insertions: 7 - suppressions: 21
  • Callithrix jacchus

    Callithrix jacchus

    • Accès à la base de données publique
      GI:296224029
      XM_002757828
    • Longueur du coup
      4 431 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      6 787,6 bits
    • Similarité
      97,4%
    • Couverture
      91,05%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      91,05% cov
      XM_002757828
      89,96% cov
    • Longueur d'alignement
      3 993 bp
    • Chaîne CIGARE
      364H211MN83MN5MN71MN137MN149MN26MN20MN29MN172MN15MN11MN19MN88MN40MN17MN5MN6MN17MN52MN23MN11MN8MN18MN13MN18MN18MN2MN3M2N10MN27MN67MN24MN41M3D2MN23MN137MN35MN8MN2MN17MN56MN174MN19MNMN3MN29MN2MN45MNMN119MN9MN22MN11MN80MN17MN62MN5MN41MN35MN53MN89MN40MDM2D36MN84MN4MN18MN91MN34MN149MN113MI3M2I59MN24MN64MN10MN40MN3MNMN35MN25MN5MN18MN23MN36MN3MN6MN45MN55MD2MI10MN13MN35MN52MN23MN70MN27MN17MI62M28H incompatibilités: 92 - insertions: 5 - suppressions: 7
  • Canis lupus familiaris

    Canis lupus familiaris

    • Accès à la base de données publique
      GI:73980763
      XM_532943
    • Longueur du coup
      4 360 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      5 930,7 bits
    • Similarité
      93,52%
    • Couverture
      91,05%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      91,05% cov
      XM_532943
      91,74% cov
    • Longueur d'alignement
      4 029 bp
    • Chaîne CIGARE
      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 incompatibilités: 191 - insertions: 41 - suppressions: 29
  • Equus caballus

    Equus caballus

    • Accès à la base de données publique
      GI:194220785
      XM_001499556
    • Longueur du coup
      4 004 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      5 831 bits
    • Similarité
      93,92%
    • Couverture
      88,38%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      88,38% cov
      XM_001499556
      96,55% cov
    • Longueur d'alignement
      3 900 bp
    • Chaîne CIGARE
      481H3MI55MN44MN47MN5MN5MN8MN38MN11MN2MN41MN98MN26MN5MN11MI7MD7MN8MN8MN26MN11MN20MN11MN74MN29MN17MN5MN3MN10MN5MN7MN6MN17MN14MN32MN29MN32MN31MN6MN3MNMN20MN95MN5MN24MN17MN13MN8MN8MN2MN11MN2MN2MN23MN20MN5MDMI11MN31MN2MN11MN4MIMD6MN10MN5MN28MN12MN8MN2MN29MN5MD3MI8MN12MN3M2N5MN23MN7MN18MN20MN35MN5MN2MN38MN11MN24MN22MN8MN17MN18MNMN44MN11MN26MN77MN51MN8MN28MN5MN17MN14MN20MN2MN20MN53MN8MN38MN38MN29MN2MN55MN36MN41MN14MN5MN47MN5MN50MN50MN35MN35MN11MN24M8DM4DM2D4MN2MN8MN20MNMN32MNMN3MN12MD21MN17MI6MN85MD173MN23M2N3MN66MN34MI3MNI4MDMN7MN10MN11MN3MN3MN36MN5MN3MN12M2IMI2M8I2MI26M2D3M2D3MNMDMD8MN26MN27MD2MI23M2I6MD5MN6MN8MN4MDMI2MIMD5MNMN2MN3MN22M2N2MN19MN6MN10MN6MD2MI6MN11MN23M2N26MN9MN18MN5MN6MN33MN46MN45MN22MDMNI8MI6MN58MN17MI7MN7MD20MN14MN10M28H incompatibilités: 174 - insertions: 29 - suppressions: 34
  • Ailuropoda melanoleuca

    Ailuropoda melanoleuca

    • Accès à la base de données publique
      GI:301777361
      XM_002924054
    • Longueur du coup
      3 977 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      5 681,4 bits
    • Similarité
      92,85%
    • Couverture
      89,61%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      89,61% cov
      XM_002924054
      98,72% cov
    • Longueur d'alignement
      3 956 bp
    • Chaîne CIGARE
      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 incompatibilités: 222 - insertions: 31 - suppressions: 30
  • Macaca mulatta

    Macaca mulatta

    • Accès à la base de données publique
      GI:297265859
      XM_001103468
    • Longueur du coup
      3 476 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      5 225,3 bits
    • Similarité
      98,91%
    • Couverture
      66,78%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      66,78% cov
      XM_001103468
      84,18% cov
    • Longueur d'alignement
      2 926 bp
    • Chaîne CIGARE
      364H193MN143MN56MN233MN59MN20MN29MN74MN113MN31MN160MN17MN31MN20MN44MN18MN163MN2MN77MN131MN38MN89MN131MN116MN47MN101MN132MN100MN311MN54MI21MN23MN117M1091H incompatibilités: 31 - insertions: 1 - suppressions: 0
  • Pongo abelii

    Pongo abelii

    • Accès à la base de données publique
      GI:197097823
      NM_001133761
    • Longueur du coup
      4 008 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      5 214,2 bits
    • Similarité
      98,74%
    • Couverture
      66,92%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      66,92% cov
      NM_001133761
      73,3% cov
    • Longueur d'alignement
      2 938 bp
    • Chaîne CIGARE
      1449H16MN19MN17MN39MN12MN44MN18MN166MN485MN212MN134MN137MN2MN316MN67MN23MN152MN145MN91MI3M2I49M2N109MN114MN18MN64MN131MN2MN58MN35MN80MN54MI62M3I11MN16M incompatibilités: 30 - insertions: 7 - suppressions: 0
  • synthetic construct

    synthetic construct

    • Accès à la base de données publique
      GI:168277523
      AB384884
    • Longueur du coup
      2 699 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      4 874,4 bits
    • Similarité
      99,89%
    • Couverture
      60,46%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      60,46% cov
      AB384884
      98,11% cov
    • Longueur d'alignement
      2 648 bp
    • Chaîne CIGARE
      364H154MN984MN535MN972M1368H incompatibilités: 3 - insertions: 0 - suppressions: 0
Occurrence
11 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
3
Longueur
896
Type
peptide
Emplacements
Detailed Description

Organisme déclaré:
Rattus norvegicus

Occurrence
10 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
4
Longueur
4 109
Type
nucleotide
Emplacements
Detailed Description

Organisme déclaré:
Rattus norvegicus

Occurrence
10 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
5
Longueur
706
Type
peptide
Emplacements
Detailed Description

Organisme déclaré:
Homo sapiens

Organisme déterminé:
  • Homo sapiens

    Homo sapiens

    • Accès à la base de données publique
      GI:5453976
      NP_006248
      1 de 3 hits signalés pour Homo sapiens.
    • Longueur du coup
      706 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 479,5 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      NP_006248
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      706 aa
    • Chaîne CIGARE
      706M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Pan troglodytes

    Pan troglodytes

    • Accès à la base de données publique
      GI:114629237
      XP_001148074
    • Longueur du coup
      706 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 473,4 bits
    • Similarité
      99,72%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      XP_001148074
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      706 aa
    • Chaîne CIGARE
      335MN29MN340M incompatibilités: 2 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Macaca mulatta

    Macaca mulatta

    • Accès à la base de données publique
      GI:297300453
      XP_001118689
    • Longueur du coup
      706 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 471,8 bits
    • Similarité
      99,86%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      XP_001118689
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      706 aa
  • Nomascus leucogenys

    Nomascus leucogenys

    • Accès à la base de données publique
      GI:332217046
      XP_003257664
    • Longueur du coup
      706 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 469,5 bits
    • Similarité
      99,86%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      XP_003257664
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      706 aa
  • Pongo abelii

    Pongo abelii

    • Accès à la base de données publique
      GI:297685983
      XP_002820550
    • Longueur du coup
      706 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 463,7 bits
    • Similarité
      99,29%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      XP_002820550
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      706 aa
  • Callithrix jacchus

    Callithrix jacchus

    • Accès à la base de données publique
      GI:296206119
      XP_002806988
    • Longueur du coup
      706 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 452,2 bits
    • Similarité
      99,01%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      XP_002806988
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      706 aa
  • Canis lupus familiaris

    Canis lupus familiaris

    • Accès à la base de données publique
      GI:73949094
      XP_849292
    • Longueur du coup
      706 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 434,9 bits
    • Similarité
      98,3%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      XP_849292
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      706 aa
  • Equus caballus

    Equus caballus

    • Accès à la base de données publique
      GI:149743729
      XP_001499922
    • Longueur du coup
      717 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 434,5 bits
    • Similarité
      98,3%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      XP_001499922
      98,47% cov
    • Longueur d'alignement
      706 aa
  • Bos taurus

    Bos taurus

    • Accès à la base de données publique
      GI:300797120
      NP_001179006
    • Longueur du coup
      706 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 430,6 bits
    • Similarité
      98,44%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      NP_001179006
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      706 aa
  • Mus musculus

    Mus musculus

    • Accès à la base de données publique
      GI:6679353
      NP_032885
    • Longueur du coup
      707 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 415,6 bits
    • Similarité
      97,73%
    • Couverture
      99,86%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      99,86% cov
      NP_032885
      99,72% cov
    • Longueur d'alignement
      705 aa
  • Rattus norvegicus

    Rattus norvegicus

    • Accès à la base de données publique
      GI:62663808
      XP_341554
      1 de 2 hits signalés pour Rattus norvegicus.
    • Longueur du coup
      707 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 406,3 bits
    • Similarité
      97,16%
    • Couverture
      99,86%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      99,86% cov
      XP_341554
      99,72% cov
    • Longueur d'alignement
      705 aa
Occurrence
238 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
6
Longueur
3 273
Type
nucleotide
Emplacements
Detailed Description

Organisme déclaré:
Homo sapiens

Organisme déterminé:
  • Homo sapiens

    Homo sapiens

    • Accès à la base de données publique
      GI:334848124
      NM_006257
      1 de 9 hits signalés pour Homo sapiens.
    • Longueur du coup
      3 286 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      6 039,7 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      99,91%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      99,91% cov
      NM_006257
      99,51% cov
    • Longueur d'alignement
      3 270 bp
    • Chaîne CIGARE
      3270M3H incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Pan troglodytes

    Pan troglodytes

    • Accès à la base de données publique
      GI:332833550
      XM_001148074
    • Longueur du coup
      3 263 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      5 860,5 bits
    • Similarité
      99,2%
    • Couverture
      99,36%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      99,36% cov
      XM_001148074
      99,6% cov
    • Longueur d'alignement
      3 252 bp
    • Chaîne CIGARE
      9MD667MN68MN74MN29MN35MN193MN89MN615MN245MN168MN64MN53MN235MN56MN229MN67MD13MN33MN10MN6MN18MN30MN3MN124MN51MN42M21H incompatibilités: 24 - insertions: 0 - suppressions: 2
  • Pongo abelii

    Pongo abelii

    • Accès à la base de données publique
      GI:297685982
      XM_002820504
    • Longueur du coup
      3 366 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      5 585,4 bits
    • Similarité
      98,19%
    • Couverture
      97,74%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      97,74% cov
      XM_002820504
      94,98% cov
    • Longueur d'alignement
      3 200 bp
  • Nomascus leucogenys

    Nomascus leucogenys

    • Accès à la base de données publique
      GI:332217045
      XM_003257616
    • Longueur du coup
      3 301 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      5 480,1 bits
    • Similarité
      97,06%
    • Couverture
      99,39%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      99,39% cov
      XM_003257616
      98,7% cov
    • Longueur d'alignement
      3 264 bp
  • Macaca mulatta

    Macaca mulatta

    • Accès à la base de données publique
      GI:297300452
      XM_001118689
    • Longueur du coup
      3 270 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      5 238,2 bits
    • Similarité
      95,69%
    • Couverture
      99,3%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      99,3% cov
      XM_001118689
      99,94% cov
    • Longueur d'alignement
      3 272 bp
  • synthetic construct

    synthetic construct

    • Accès à la base de données publique
      GI:313883505
      HQ258485
      1 de 2 hits signalés pour synthetic construct.
    • Longueur du coup
      2 155 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      3 919,7 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      64,83%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      64,83% cov
      HQ258485
      98,47% cov
    • Longueur d'alignement
      2 122 bp
  • Callithrix jacchus

    Callithrix jacchus

    • Accès à la base de données publique
      GI:296206118
      XM_002806942
    • Longueur du coup
      2 178 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      3 445,1 bits
    • Similarité
      95,22%
    • Couverture
      66,48%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      66,48% cov
      XM_002806942
      99,91% cov
    • Longueur d'alignement
      2 176 bp
Occurrence
85 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
7
Longueur
707
Type
peptide
Emplacements
Detailed Description

Organisme déclaré:
Mus musculus

Organisme déterminé:
  • Mus musculus

    Mus musculus

    • Accès à la base de données publique
      GI:6679353
      NP_032885
    • Longueur du coup
      707 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 484,5 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      100% cov
      NP_032885
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      707 aa
    • Chaîne CIGARE
      707M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Rattus norvegicus

    Rattus norvegicus

    • Accès à la base de données publique
      GI:62663808
      XP_341554
      1 de 2 hits signalés pour Rattus norvegicus.
    • Longueur du coup
      707 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 448,7 bits
    • Similarité
      98,73%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      100% cov
      XP_341554
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      707 aa
    • Chaîne CIGARE
      143MN158MN12MN2M2NMNMNMN12MN5MNMN5M2NMNMN6M3NMN33MN84MN80MN138M incompatibilités: 22 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Macaca mulatta

    Macaca mulatta

    • Accès à la base de données publique
      GI:297300453
      XP_001118689
    • Longueur du coup
      706 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 420,6 bits
    • Similarité
      97,87%
    • Couverture
      99,72%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      99,72% cov
      XP_001118689
      99,86% cov
    • Longueur d'alignement
      705 aa
  • Nomascus leucogenys

    Nomascus leucogenys

    • Accès à la base de données publique
      GI:332217046
      XP_003257664
    • Longueur du coup
      706 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 417,5 bits
    • Similarité
      97,87%
    • Couverture
      99,72%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      99,72% cov
      XP_003257664
      99,86% cov
    • Longueur d'alignement
      705 aa
  • Homo sapiens

    Homo sapiens

    • Accès à la base de données publique
      GI:5453976
      NP_006248
      1 de 3 hits signalés pour Homo sapiens.
    • Longueur du coup
      706 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 415,6 bits
    • Similarité
      97,73%
    • Couverture
      99,72%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      99,72% cov
      NP_006248
      99,86% cov
    • Longueur d'alignement
      705 aa
  • Pongo abelii

    Pongo abelii

    • Accès à la base de données publique
      GI:297685983
      XP_002820550
    • Longueur du coup
      706 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 414,1 bits
    • Similarité
      97,59%
    • Couverture
      99,72%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      99,72% cov
      XP_002820550
      99,86% cov
    • Longueur d'alignement
      705 aa
  • Pan troglodytes

    Pan troglodytes

    • Accès à la base de données publique
      GI:114629237
      XP_001148074
    • Longueur du coup
      706 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 412,5 bits
    • Similarité
      97,73%
    • Couverture
      99,72%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      99,72% cov
      XP_001148074
      99,86% cov
    • Longueur d'alignement
      705 aa
  • Callithrix jacchus

    Callithrix jacchus

    • Accès à la base de données publique
      GI:296206119
      XP_002806988
    • Longueur du coup
      706 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 408,7 bits
    • Similarité
      97,45%
    • Couverture
      99,72%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      99,72% cov
      XP_002806988
      99,86% cov
    • Longueur d'alignement
      705 aa
  • Canis lupus familiaris

    Canis lupus familiaris

    • Accès à la base de données publique
      GI:73949094
      XP_849292
    • Longueur du coup
      706 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 406,3 bits
    • Similarité
      96,88%
    • Couverture
      99,72%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      99,72% cov
      XP_849292
      99,86% cov
    • Longueur d'alignement
      705 aa
  • Equus caballus

    Equus caballus

    • Accès à la base de données publique
      GI:149743729
      XP_001499922
    • Longueur du coup
      717 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 404,4 bits
    • Similarité
      96,61%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      100% cov
      XP_001499922
      98,61% cov
    • Longueur d'alignement
      707 aa
  • Bos taurus

    Bos taurus

    • Accès à la base de données publique
      GI:300797120
      NP_001179006
    • Longueur du coup
      706 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 392,9 bits
    • Similarité
      96,6%
    • Couverture
      99,72%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      99,72% cov
      NP_001179006
      99,86% cov
    • Longueur d'alignement
      705 aa
Occurrence
21 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
8
Longueur
2 150
Type
nucleotide
Emplacements
Detailed Description

Organisme déclaré:
Mus musculus

Occurrence
10 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq

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