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recherche de séquences biologiques divulguées dans les brevets

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Données obtenues à partir de: DDBJ Pat NCBI GenBank USPTO Fulltext EMBL-EBI Pat
26 séquences trouvées dans ce brevet (au total)

Affichage 1 - 10 de 26 séquences

SEQ ID NO
Longueur
Type
Emplacements
Organisms
Occurrence
Outils
SEQ ID NO
1
Longueur
519
Type
nucleotide
Emplacements
Claims, Detailed Description, Summary

Organisme déclaré:
Vibrio harveyi

Organisme déterminé:
  • Vibrio campbellii ATCC BAA-1116

    Vibrio campbellii ATCC BAA-1116

    • Accès à la base de données publique
      GI:156523975
      CP000789
    • Longueur du coup
      3 765 351 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      959,5 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      100% cov
      CP000789
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      519 bp
    • Chaîne CIGARE
      519M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Vibrio harveyi

    Vibrio harveyi

    • Accès à la base de données publique
      GI:4325174
      AF120098
      1 de 5 hits signalés pour Vibrio harveyi.
    • Longueur du coup
      519 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      959,5 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      100% cov
      AF120098
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      519 bp
    • Chaîne CIGARE
      519M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Aliivibrio logei

    Aliivibrio logei

    • Accès à la base de données publique
      GI:328963100
      HQ400993
    • Longueur du coup
      473 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      780,4 bits
    • Similarité
      97,19%
    • Couverture
      88,82%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      88,82% cov
      HQ400993
      97,46% cov
    • Longueur d'alignement
      462 bp
  • uncultured bacterium

    uncultured bacterium

    • Accès à la base de données publique
      GI:329763901
      HM117052
      1 de 17 hits signalés pour uncultured bacterium.
    • Longueur du coup
      393 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      654,8 bits
    • Similarité
      97,4%
    • Couverture
      73,99%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      73,99% cov
      HM117052
      97,71% cov
    • Longueur d'alignement
      384 bp
  • Vibrio campbellii

    Vibrio campbellii

    • Accès à la base de données publique
      GI:328963120
      HQ401003
    • Longueur du coup
      473 bp
    • Valeur E
      5,58E-149
    • Score BLAST
      536,6 bits
    • Similarité
      87,21%
    • Couverture
      91,14%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      91,14% cov
      HQ401003
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      477 bp
Occurrence
28 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
2
Longueur
516
Type
nucleotide
Emplacements
Claims, Detailed Description, Summary

Organisme déclaré:
Escherichia coli

Organisme déterminé:
  • Escherichia coli BL21(DE3)

    Escherichia coli BL21(DE3)

    • Accès à la base de données publique
      GI:313848522
      AM946981
      1 de 2 hits signalés pour Escherichia coli BL21(DE3).
    • Longueur du coup
      4 558 947 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      954 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      AM946981
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      516 bp
    • Chaîne CIGARE
      516M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Escherichia coli ETEC H10407

    Escherichia coli ETEC H10407

    • Accès à la base de données publique
      GI:309700213
      FN649414
    • Longueur du coup
      5 153 435 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      954 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      FN649414
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      516 bp
    • Chaîne CIGARE
      516M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Escherichia coli B str. REL606

    Escherichia coli B str. REL606

    • Accès à la base de données publique
      GI:253972022
      CP000819
    • Longueur du coup
      4 629 812 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      954 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      CP000819
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      516 bp
  • Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG'

    Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG'

    • Accès à la base de données publique
      GI:253322479
      CP001665
    • Longueur du coup
      4 570 938 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      954 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      CP001665
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      516 bp
  • Escherichia coli BW2952

    Escherichia coli BW2952

    • Accès à la base de données publique
      GI:238859724
      CP001396
    • Longueur du coup
      4 578 159 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      954 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      CP001396
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      516 bp
  • Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B

    Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B

    • Accès à la base de données publique
      GI:169887498
      CP000948
    • Longueur du coup
      4 686 137 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      954 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      CP000948
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      516 bp
  • Escherichia coli ATCC 8739

    Escherichia coli ATCC 8739

    • Accès à la base de données publique
      GI:169752989
      CP000946
    • Longueur du coup
      4 746 218 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      954 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      CP000946
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      516 bp
  • Escherichia coli E24377A

    Escherichia coli E24377A

    • Accès à la base de données publique
      GI:157076741
      CP000800
    • Longueur du coup
      4 979 619 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      954 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      CP000800
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      516 bp
  • Escherichia coli HS

    Escherichia coli HS

    • Accès à la base de données publique
      GI:157065147
      CP000802
    • Longueur du coup
      4 643 538 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      954 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      CP000802
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      516 bp
  • Escherichia coli str. K-12 substr. W3110

    Escherichia coli str. K-12 substr. W3110

    • Accès à la base de données publique
      GI:85674274
      AP009048
    • Longueur du coup
      4 646 332 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      954 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      AP009048
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      516 bp
  • Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655

    Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655

    • Accès à la base de données publique
      GI:48994873
      U00096
    • Longueur du coup
      4 639 675 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      954 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      U00096
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      516 bp
  • Shigella sonnei Ss046

    Shigella sonnei Ss046

    • Accès à la base de données publique
      GI:73854091
      CP000038
    • Longueur du coup
      4 825 265 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      954 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      CP000038
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      516 bp
  • Escherichia coli UMNK88

    Escherichia coli UMNK88

    • Accès à la base de données publique
      GI:332341332
      CP002729
    • Longueur du coup
      5 186 416 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      948,5 bits
    • Similarité
      99,81%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      CP002729
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      516 bp
  • Escherichia coli

    Escherichia coli

    • Accès à la base de données publique
      GI:326583188
      HQ538844
    • Longueur du coup
      516 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      948,5 bits
    • Similarité
      99,81%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      HQ538844
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      516 bp
  • Escherichia coli KO11FL

    Escherichia coli KO11FL

    • Accès à la base de données publique
      GI:323376397
      CP002516
    • Longueur du coup
      4 920 168 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      948,5 bits
    • Similarité
      99,81%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      CP002516
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      516 bp
  • Escherichia coli W

    Escherichia coli W

    • Accès à la base de données publique
      GI:315059226
      CP002185
    • Longueur du coup
      4 900 968 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      948,5 bits
    • Similarité
      99,81%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      CP002185
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      516 bp
  • Shigella flexneri 2002017

    Shigella flexneri 2002017

    • Accès à la base de données publique
      GI:281599365
      CP001383
    • Longueur du coup
      4 650 856 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      948,5 bits
    • Similarité
      99,81%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      CP001383
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      516 bp
  • Escherichia coli O111:H- str. 11128

    Escherichia coli O111:H- str. 11128

    • Accès à la base de données publique
      GI:257762509
      AP010960
    • Longueur du coup
      5 371 077 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      948,5 bits
    • Similarité
      99,81%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      AP010960
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      516 bp
  • Escherichia coli O26:H11 str. 11368

    Escherichia coli O26:H11 str. 11368

    • Accès à la base de données publique
      GI:257751862
      AP010953
    • Longueur du coup
      5 697 240 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      948,5 bits
    • Similarité
      99,81%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      AP010953
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      516 bp
  • Shigella flexneri 5 str. 8401

    Shigella flexneri 5 str. 8401

    • Accès à la base de données publique
      GI:110613622
      CP000266
    • Longueur du coup
      4 574 284 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      948,5 bits
    • Similarité
      99,81%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      CP000266
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      516 bp
  • Shigella flexneri 2a str. 301

    Shigella flexneri 2a str. 301

    • Accès à la base de données publique
      GI:24080789
      AE005674
    • Longueur du coup
      4 607 203 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      948,5 bits
    • Similarité
      99,81%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      AE005674
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      516 bp
  • Shigella flexneri 2a str. 2457T

    Shigella flexneri 2a str. 2457T

    • Accès à la base de données publique
      GI:30043918
      AE014073
    • Longueur du coup
      4 599 354 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      948,5 bits
    • Similarité
      99,81%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      AE014073
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      516 bp
  • Escherichia coli DH1

    Escherichia coli DH1

    • Accès à la base de données publique
      GI:315134697
      AP012030
      1 de 2 hits signalés pour Escherichia coli DH1.
    • Longueur du coup
      4 621 430 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      941,1 bits
    • Similarité
      99,61%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      AP012030
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      516 bp
Occurrence
46 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
3
Longueur
110
Type
nucleotide
Emplacements
Claims, Detailed Description, Summary

Organisme déclaré:
Salmonella

Organisme déterminé:
Occurrence
28 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
4
Longueur
492
Type
nucleotide
Emplacements
Claims, Detailed Description, Summary

Organisme déclaré:
Salmonella

Organisme déterminé:
Occurrence
29 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
5
Longueur
504
Type
nucleotide
Emplacements
Claims, Detailed Description, Summary

Organisme déclaré:
Haemophilus influenzae

Organisme déterminé:
  • Haemophilus influenzae Rd KW20

    Haemophilus influenzae Rd KW20

    • Accès à la base de données publique
      GI:6626252
      L42023
    • Longueur du coup
      1 830 138 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      931,8 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      L42023
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      504 bp
    • Chaîne CIGARE
      504M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Haemophilus influenzae 10810

    Haemophilus influenzae 10810

    • Accès à la base de données publique
      GI:301168602
      FQ312006
    • Longueur du coup
      1 981 535 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      915,2 bits
    • Similarité
      99,4%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      FQ312006
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      504 bp
    • Chaîne CIGARE
      200MN93MN67MN141M incompatibilités: 3 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Haemophilus influenzae R2866

    Haemophilus influenzae R2866

    • Accès à la base de données publique
      GI:309750011
      CP002277
    • Longueur du coup
      1 932 306 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      909,7 bits
    • Similarité
      99,21%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      CP002277
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      504 bp
    • Chaîne CIGARE
      93MN106MN93MN67MN141M incompatibilités: 4 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Haemophilus influenzae 86-028NP

    Haemophilus influenzae 86-028NP

    • Accès à la base de données publique
      GI:156617157
      CP000057
    • Longueur du coup
      1 914 490 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      909,7 bits
    • Similarité
      99,21%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      CP000057
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      505 bp
  • Haemophilus influenzae PittGG

    Haemophilus influenzae PittGG

    • Accès à la base de données publique
      GI:148717999
      CP000672
    • Longueur du coup
      1 887 192 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      909,7 bits
    • Similarité
      99,21%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      CP000672
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      504 bp
  • Haemophilus influenzae F3031

    Haemophilus influenzae F3031

    • Accès à la base de données publique
      GI:317431924
      FQ670178
    • Longueur du coup
      1 985 832 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      904,1 bits
    • Similarité
      99,01%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      FQ670178
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      505 bp
  • Haemophilus influenzae R2846

    Haemophilus influenzae R2846

    • Accès à la base de données publique
      GI:309972265
      CP002276
    • Longueur du coup
      1 819 370 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      904,1 bits
    • Similarité
      99,01%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      CP002276
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      504 bp
  • Haemophilus influenzae PittEE

    Haemophilus influenzae PittEE

    • Accès à la base de données publique
      GI:148715293
      CP000671
    • Longueur du coup
      1 813 033 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      904,1 bits
    • Similarité
      99,01%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      CP000671
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      504 bp
  • Haemophilus influenzae F3047

    Haemophilus influenzae F3047

    • Accès à la base de données publique
      GI:317449542
      FQ670204
    • Longueur du coup
      2 007 018 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      898,6 bits
    • Similarité
      98,81%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      FQ670204
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      504 bp
  • Aggregatibacter actinomycetemcomitans D11S-1

    Aggregatibacter actinomycetemcomitans D11S-1

    • Accès à la base de données publique
      GI:261412053
      CP001733
    • Longueur du coup
      2 105 764 bp
    • Valeur E
      5,97E-79
    • Score BLAST
      304 bits
    • Similarité
      78,9%
    • Couverture
      94,44%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      94,44% cov
      CP001733
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      493 bp
  • Aggregatibacter aphrophilus NJ8700

    Aggregatibacter aphrophilus NJ8700

    • Accès à la base de données publique
      GI:247533203
      CP001607
    • Longueur du coup
      2 313 035 bp
    • Valeur E
      7,73E-78
    • Score BLAST
      300,3 bits
    • Similarité
      78,66%
    • Couverture
      94,64%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      94,64% cov
      CP001607
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      492 bp
Occurrence
33 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
6
Longueur
468
Type
nucleotide
Emplacements
Claims, Detailed Description, Summary

Organisme déclaré:
Helicobacter pylori

Organisme déterminé:
  • Helicobacter pylori 26695

    Helicobacter pylori 26695

    • Accès à la base de données publique
      GI:6626253
      AE000511
    • Longueur du coup
      1 667 867 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      865,4 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      AE000511
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      468 bp
    • Chaîne CIGARE
      468M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Helicobacter pylori P12

    Helicobacter pylori P12

    • Accès à la base de données publique
      GI:210132169
      CP001217
    • Longueur du coup
      1 673 813 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      793,3 bits
    • Similarité
      97,22%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      CP001217
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      468 bp
    • Chaîne CIGARE
      105MN67MN23MN2MN14MNMN51MN27MN22MN35MN50MN3MN34MN21M incompatibilités: 13 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Helicobacter pylori HPAG1

    Helicobacter pylori HPAG1

    • Accès à la base de données publique
      GI:107836197
      CP000241
    • Longueur du coup
      1 596 366 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      773 bits
    • Similarité
      96,57%
    • Couverture
      99,57%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      99,57% cov
      CP000241
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      467 bp
    • Chaîne CIGARE
      8MN17MN67MN10MN58MN8MN95MN50MN22MN60MN2MDMI2MN7MN3MN22MN19M2H incompatibilités: 14 - insertions: 1 - suppressions: 1
  • Helicobacter pylori 52

    Helicobacter pylori 52

    • Accès à la base de données publique
      GI:261838873
      CP001680
    • Longueur du coup
      1 568 826 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      771,2 bits
    • Similarité
      96,38%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      CP001680
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      469 bp
  • Helicobacter pylori 51

    Helicobacter pylori 51

    • Accès à la base de données publique
      GI:261837457
      CP000012
    • Longueur du coup
      1 589 954 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      771,2 bits
    • Similarité
      96,37%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      CP000012
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      468 bp
  • Helicobacter pylori F32

    Helicobacter pylori F32

    • Accès à la base de données publique
      GI:317179796
      AP011943
    • Longueur du coup
      1 578 824 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      765,6 bits
    • Similarité
      96,15%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      AP011943
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      468 bp
  • Helicobacter pylori B8

    Helicobacter pylori B8

    • Accès à la base de données publique
      GI:298354685
      FN598874
    • Longueur du coup
      1 673 997 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      765,6 bits
    • Similarité
      96,16%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      FN598874
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      469 bp
  • Helicobacter pylori F16

    Helicobacter pylori F16

    • Accès à la base de données publique
      GI:317176808
      AP011940
    • Longueur du coup
      1 575 399 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      760,1 bits
    • Similarité
      95,95%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      AP011940
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      469 bp
  • Helicobacter pylori Sat464

    Helicobacter pylori Sat464

    • Accès à la base de données publique
      GI:308062870
      CP002071
    • Longueur du coup
      1 560 342 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      760,1 bits
    • Similarité
      95,94%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      CP002071
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      468 bp
  • Helicobacter pylori G27

    Helicobacter pylori G27

    • Accès à la base de données publique
      GI:208431905
      CP001173
    • Longueur du coup
      1 652 982 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      760,1 bits
    • Similarité
      95,94%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      CP001173
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      468 bp
  • Helicobacter pylori Lithuania75

    Helicobacter pylori Lithuania75

    • Accès à la base de données publique
      GI:317011857
      CP002334
    • Longueur du coup
      1 624 644 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      754,6 bits
    • Similarité
      96,5%
    • Couverture
      97,44%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      97,44% cov
      CP002334
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      457 bp
  • Helicobacter pylori India7

    Helicobacter pylori India7

    • Accès à la base de données publique
      GI:317008680
      CP002331
    • Longueur du coup
      1 675 918 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      754,6 bits
    • Similarité
      95,74%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      CP002331
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      470 bp
  • Helicobacter pylori 35A

    Helicobacter pylori 35A

    • Accès à la base de données publique
      GI:315585794
      CP002096
    • Longueur du coup
      1 566 655 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      754,6 bits
    • Similarité
      95,74%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      CP002096
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      469 bp
  • Helicobacter pylori Shi470

    Helicobacter pylori Shi470

    • Accès à la base de données publique
      GI:189491895
      CP001072
    • Longueur du coup
      1 608 548 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      754,6 bits
    • Similarité
      95,73%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      CP001072
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      468 bp
  • Helicobacter pylori

    Helicobacter pylori

    • Accès à la base de données publique
      GI:110559658
      DQ777750
    • Longueur du coup
      520 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      754,6 bits
    • Similarité
      95,74%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      DQ777750
      90% cov
    • Longueur d'alignement
      469 bp
  • Helicobacter pylori F30

    Helicobacter pylori F30

    • Accès à la base de données publique
      GI:317178309
      AP011941
    • Longueur du coup
      1 570 564 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      749 bits
    • Similarité
      95,52%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      AP011941
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      469 bp
  • Helicobacter pylori SJM180

    Helicobacter pylori SJM180

    • Accès à la base de données publique
      GI:308059716
      CP002073
    • Longueur du coup
      1 658 051 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      749 bits
    • Similarité
      96,27%
    • Couverture
      97,44%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      97,44% cov
      CP002073
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      456 bp
  • Helicobacter pylori v225d

    Helicobacter pylori v225d

    • Accès à la base de données publique
      GI:297379223
      CP001582
    • Longueur du coup
      1 588 278 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      749 bits
    • Similarité
      95,51%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      CP001582
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      468 bp
  • Helicobacter pylori 83

    Helicobacter pylori 83

    • Accès à la base de données publique
      GI:332672788
      CP002605
    • Longueur du coup
      1 617 426 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      743,5 bits
    • Similarité
      95,32%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      CP002605
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      470 bp
  • Helicobacter pylori Gambia94/24

    Helicobacter pylori Gambia94/24

    • Accès à la base de données publique
      GI:317013424
      CP002332
    • Longueur du coup
      1 709 911 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      743,5 bits
    • Similarité
      96,07%
    • Couverture
      97,44%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      97,44% cov
      CP002332
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      458 bp
  • Helicobacter pylori Cuz20

    Helicobacter pylori Cuz20

    • Accès à la base de données publique
      GI:308061305
      CP002076
    • Longueur du coup
      1 635 449 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      743,5 bits
    • Similarité
      95,31%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      CP002076
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      469 bp
  • Helicobacter pylori F57

    Helicobacter pylori F57

    • Accès à la base de données publique
      GI:317181290
      AP011945
    • Longueur du coup
      1 609 006 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      737,9 bits
    • Similarité
      95,1%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      AP011945
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      469 bp
  • Helicobacter pylori PeCan4

    Helicobacter pylori PeCan4

    • Accès à la base de données publique
      GI:308064373
      CP002074
    • Longueur du coup
      1 629 557 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      737,9 bits
    • Similarité
      95,09%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      CP002074
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      468 bp
  • Helicobacter pylori J99

    Helicobacter pylori J99

    • Accès à la base de données publique
      GI:12057207
      AE001439
    • Longueur du coup
      1 643 831 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      732,4 bits
    • Similarité
      95,63%
    • Couverture
      97,44%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      97,44% cov
      AE001439
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      458 bp
  • Helicobacter pylori 2017

    Helicobacter pylori 2017

    • Accès à la base de données publique
      GI:325996870
      CP002571
    • Longueur du coup
      1 548 238 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      715,8 bits
    • Similarité
      94,98%
    • Couverture
      97,44%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      97,44% cov
      CP002571
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      458 bp
Occurrence
32 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
7
Longueur
482
Type
nucleotide
Emplacements
Claims, Detailed Description, Summary

Organisme déclaré:
Bacillus subtilis

Organisme déterminé:
  • Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168

    Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168

    • Accès à la base de données publique
      GI:225184640
      AL009126
    • Longueur du coup
      4 215 606 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      891,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      100% cov
      AL009126
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      482 bp
    • Chaîne CIGARE
      482M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Bacillus subtilis

    Bacillus subtilis

    • Accès à la base de données publique
      GI:2293135
      AF008220
    • Longueur du coup
      220 060 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      891,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      100% cov
      AF008220
      0,22% cov
    • Longueur d'alignement
      482 bp
    • Chaîne CIGARE
      482M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Bacillus subtilis BSn5

    Bacillus subtilis BSn5

    • Accès à la base de données publique
      GI:320017650
      CP002468
    • Longueur du coup
      4 093 599 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      880,1 bits
    • Similarité
      99,59%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      100% cov
      CP002468
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      482 bp
    • Chaîne CIGARE
      98MN59MN323M incompatibilités: 2 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Bacillus thuringiensis serovar japonensis

    Bacillus thuringiensis serovar japonensis

    • Accès à la base de données publique
      GI:38230175
      AY438565
    • Longueur du coup
      474 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      848,7 bits
    • Similarité
      98,95%
    • Couverture
      98,34%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      98,34% cov
      AY438565
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      474 bp
  • Bacillus subtilis subsp. spizizenii str. W23

    Bacillus subtilis subsp. spizizenii str. W23

    • Accès à la base de données publique
      GI:305410941
      CP002183
    • Longueur du coup
      4 027 676 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      795,2 bits
    • Similarité
      96,47%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      100% cov
      CP002183
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      482 bp
  • Bacillus atrophaeus 1942

    Bacillus atrophaeus 1942

    • Accès à la base de données publique
      GI:310867486
      CP002207
    • Longueur du coup
      4 168 266 bp
    • Valeur E
      1,11E-150
    • Score BLAST
      542,2 bits
    • Similarité
      87,24%
    • Couverture
      98,76%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      98,76% cov
      CP002207
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      478 bp
  • Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum str. FZB42

    Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum str. FZB42

    • Accès à la base de données publique
      GI:154350369
      CP000560
    • Longueur du coup
      3 918 589 bp
    • Valeur E
      2,45E-132
    • Score BLAST
      481,2 bits
    • Similarité
      84,91%
    • Couverture
      98,76%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      98,76% cov
      CP000560
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      477 bp
  • Bacillus amyloliquefaciens LL3

    Bacillus amyloliquefaciens LL3

    • Accès à la base de données publique
      GI:328909959
      CP002634
    • Longueur du coup
      3 995 227 bp
    • Valeur E
      1,14E-130
    • Score BLAST
      475,7 bits
    • Similarité
      84,7%
    • Couverture
      98,76%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      98,76% cov
      CP002634
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      477 bp
  • Bacillus amyloliquefaciens TA208

    Bacillus amyloliquefaciens TA208

    • Accès à la base de données publique
      GI:328551700
      CP002627
    • Longueur du coup
      3 937 511 bp
    • Valeur E
      1,14E-130
    • Score BLAST
      475,7 bits
    • Similarité
      84,7%
    • Couverture
      98,76%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      98,76% cov
      CP002627
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      477 bp
  • Bacillus amyloliquefaciens DSM 7

    Bacillus amyloliquefaciens DSM 7

    • Accès à la base de données publique
      GI:307604755
      FN597644
    • Longueur du coup
      3 980 199 bp
    • Valeur E
      1,14E-130
    • Score BLAST
      475,7 bits
    • Similarité
      84,7%
    • Couverture
      98,76%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      98,76% cov
      FN597644
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      477 bp
  • Bacillus pumilus SAFR-032

    Bacillus pumilus SAFR-032

    • Accès à la base de données publique
      GI:157679556
      CP000813
    • Longueur du coup
      3 704 465 bp
    • Valeur E
      3,31E-101
    • Score BLAST
      377,8 bits
    • Similarité
      81,21%
    • Couverture
      98,34%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      98,34% cov
      CP000813
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      479 bp
Occurrence
28 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
8
Longueur
537
Type
nucleotide
Emplacements
Claims, Detailed Description, Summary

Organisme déclaré:
Borrelia burgdorferi

Organisme déterminé:
  • Borrelia burgdorferi B31

    Borrelia burgdorferi B31

    • Accès à la base de données publique
      GI:6626249
      AE000783
    • Longueur du coup
      910 724 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      992,8 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      AE000783
      0,06% cov
    • Longueur d'alignement
      537 bp
    • Chaîne CIGARE
      537M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Borrelia burgdorferi N40

    Borrelia burgdorferi N40

    • Accès à la base de données publique
      GI:312148964
      CP002228
    • Longueur du coup
      902 191 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      987,2 bits
    • Similarité
      99,81%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      CP002228
      0,06% cov
    • Longueur d'alignement
      537 bp
    • Chaîne CIGARE
      49MN487M incompatibilités: 1 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Borrelia burgdorferi JD1

    Borrelia burgdorferi JD1

    • Accès à la base de données publique
      GI:312147736
      CP002312
    • Longueur du coup
      922 801 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      987,2 bits
    • Similarité
      99,81%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      CP002312
      0,06% cov
    • Longueur d'alignement
      537 bp
    • Chaîne CIGARE
      363MN173M incompatibilités: 1 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Borrelia burgdorferi ZS7

    Borrelia burgdorferi ZS7

    • Accès à la base de données publique
      GI:218164353
      CP001205
    • Longueur du coup
      906 707 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      987,2 bits
    • Similarité
      99,81%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      CP001205
      0,06% cov
    • Longueur d'alignement
      537 bp
  • Borrelia afzelii PKo

    Borrelia afzelii PKo

    • Accès à la base de données publique
      GI:110890097
      CP000395
    • Longueur du coup
      905 394 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      832,1 bits
    • Similarité
      94,63%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      CP000395
      0,06% cov
    • Longueur d'alignement
      540 bp
  • Borrelia garinii PBi

    Borrelia garinii PBi

    • Accès à la base de données publique
      GI:51572834
      CP000013
    • Longueur du coup
      904 246 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      826,6 bits
    • Similarité
      94,42%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      CP000013
      0,06% cov
    • Longueur d'alignement
      538 bp
Occurrence
28 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
9
Longueur
519
Type
nucleotide
Emplacements
Claims, Detailed Description, Summary

Organisme déclaré:
Vibrio cholerae

Organisme déterminé:
  • Vibrio cholerae MJ-1236

    Vibrio cholerae MJ-1236

    • Accès à la base de données publique
      GI:229368777
      CP001485
    • Longueur du coup
      3 149 584 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      959,5 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      CP001485
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      519 bp
    • Chaîne CIGARE
      519M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Vibrio cholerae O395

    Vibrio cholerae O395

    • Accès à la base de données publique
      GI:227011820
      CP001235
      1 de 2 hits signalés pour Vibrio cholerae O395.
    • Longueur du coup
      3 024 078 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      959,5 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      CP001235
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      519 bp
    • Chaîne CIGARE
      519M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Vibrio cholerae M66-2

    Vibrio cholerae M66-2

    • Accès à la base de données publique
      GI:227008125
      CP001233
    • Longueur du coup
      2 892 523 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      959,5 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      CP001233
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      519 bp
    • Chaîne CIGARE
      519M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961

    Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961

    • Accès à la base de données publique
      GI:12057212
      AE003852
    • Longueur du coup
      2 961 149 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      959,5 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      AE003852
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      519 bp
  • synthetic construct

    synthetic construct

    • Accès à la base de données publique
      GI:109703608
      DQ773259
    • Longueur du coup
      519 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      955,8 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      99,61%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      99,61% cov
      DQ773259
      99,61% cov
    • Longueur d'alignement
      517 bp
  • Vibrio cholerae LMA3984-4

    Vibrio cholerae LMA3984-4

    • Accès à la base de données publique
      GI:327482915
      CP002555
    • Longueur du coup
      2 791 729 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      937,4 bits
    • Similarité
      99,23%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      CP002555
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      519 bp
  • Vibrio albensis

    Vibrio albensis

    • Accès à la base de données publique
      GI:90074873
      AB114425
    • Longueur du coup
      698 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      931,8 bits
    • Similarité
      99,04%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      AB114425
      74,36% cov
    • Longueur d'alignement
      519 bp
  • Vibrio mimicus

    Vibrio mimicus

    • Accès à la base de données publique
      GI:73611165
      AB232376
      1 de 2 hits signalés pour Vibrio mimicus.
    • Longueur du coup
      815 bp
    • Valeur E
      3,24E-171
    • Score BLAST
      610,5 bits
    • Similarité
      87,91%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      AB232376
      63,68% cov
    • Longueur d'alignement
      521 bp
  • Vibrio furnissii NCTC 11218

    Vibrio furnissii NCTC 11218

    • Accès à la base de données publique
      GI:315178329
      CP002377
    • Longueur du coup
      3 294 546 bp
    • Valeur E
      7,48E-123
    • Score BLAST
      449,9 bits
    • Similarité
      82,58%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      CP002377
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      528 bp
  • Vibrio furnissii

    Vibrio furnissii

    • Accès à la base de données publique
      GI:328963104
      HQ400995
    • Longueur du coup
      473 bp
    • Valeur E
      3,61E-96
    • Score BLAST
      361,2 bits
    • Similarité
      81,1%
    • Couverture
      89,02%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      89,02% cov
      HQ400995
      97,67% cov
    • Longueur d'alignement
      471 bp
  • Vibrio diazotrophicus

    Vibrio diazotrophicus

    • Accès à la base de données publique
      GI:328963092
      HQ400989
    • Longueur du coup
      473 bp
    • Valeur E
      1,31E-90
    • Score BLAST
      342,8 bits
    • Similarité
      80,08%
    • Couverture
      91,14%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      91,14% cov
      HQ400989
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      482 bp
  • Vibrio campbellii

    Vibrio campbellii

    • Accès à la base de données publique
      GI:328963120
      HQ401003
    • Longueur du coup
      473 bp
    • Valeur E
      3,66E-86
    • Score BLAST
      328 bits
    • Similarité
      80,99%
    • Couverture
      80,92%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      80,92% cov
      HQ401003
      88,79% cov
    • Longueur d'alignement
      426 bp
  • Sodalis glossinidius str. 'morsitans'

    Sodalis glossinidius str. 'morsitans'

    • Accès à la base de données publique
      GI:84778498
      AP008232
    • Longueur du coup
      4 171 146 bp
    • Valeur E
      2,99E-47
    • Score BLAST
      198,7 bits
    • Similarité
      76,62%
    • Couverture
      74,95%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      74,95% cov
      AP008232
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      402 bp
Occurrence
33 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
10
Longueur
172
Type
peptide
Emplacements
Detailed Description, Drawings, Summary

Organisme déclaré:
Vibrio harveyi

Organisme déterminé:
  • Vibrio campbellii ATCC BAA-1116

    Vibrio campbellii ATCC BAA-1116

    • Accès à la base de données publique
      GI:229220837
      YP_001446656
      1 de 2 hits signalés pour Vibrio campbellii ATCC BAA-1116.
    • Longueur du coup
      172 aa
    • Valeur E
      3,98E-97
    • Score BLAST
      357,8 bits
    • Similarité
      99,42%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      YP_001446656
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      172 aa
    • Chaîne CIGARE
      112MN59M incompatibilités: 1 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Vibrio campbellii HY01

    Vibrio campbellii HY01

    • Accès à la base de données publique
      GI:153835744
      ZP_01988411
    • Longueur du coup
      172 aa
    • Valeur E
      9,16E-96
    • Score BLAST
      353,2 bits
    • Similarité
      98,84%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      ZP_01988411
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      172 aa
    • Chaîne CIGARE
      112MN2MN32MN17MN5M incompatibilités: 4 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Vibrio harveyi 1DA3

    Vibrio harveyi 1DA3

    • Accès à la base de données publique
      GI:269961273
      ZP_06175640
    • Longueur du coup
      172 aa
    • Valeur E
      1,99E-95
    • Score BLAST
      352,1 bits
    • Similarité
      98,84%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      ZP_06175640
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      172 aa
    • Chaîne CIGARE
      70MN41MN35MN2MN14MN5M incompatibilités: 5 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Vibrio alginolyticus

    Vibrio alginolyticus

    • Accès à la base de données publique
      GI:56749061
      Q6TP45
    • Longueur du coup
      172 aa
    • Valeur E
      8,51E-94
    • Score BLAST
      346,7 bits
    • Similarité
      98,26%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      Q6TP45
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      172 aa
  • Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633

    Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633

    • Accès à la base de données publique
      GI:28899311
      NP_798916
    • Longueur du coup
      172 aa
    • Valeur E
      4,63E-93
    • Score BLAST
      344,4 bits
    • Similarité
      98,26%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      NP_798916
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      172 aa
  • Vibrio sp. Ex25

    Vibrio sp. Ex25

    • Accès à la base de données publique
      GI:262393305
      YP_003285159
    • Longueur du coup
      172 aa
    • Valeur E
      6,57E-93
    • Score BLAST
      344 bits
    • Similarité
      98,26%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      YP_003285159
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      172 aa
  • Vibrio alginolyticus 12G01

    Vibrio alginolyticus 12G01

    • Accès à la base de données publique
      GI:91228769
      ZP_01262679
    • Longueur du coup
      172 aa
    • Valeur E
      6,85E-93
    • Score BLAST
      344 bits
    • Similarité
      97,67%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      ZP_01262679
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      172 aa
  • Vibrio brasiliensis LMG 20546

    Vibrio brasiliensis LMG 20546

    • Accès à la base de données publique
      GI:323491142
      ZP_08096330
    • Longueur du coup
      172 aa
    • Valeur E
      2,13E-90
    • Score BLAST
      335,5 bits
    • Similarité
      96,51%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      ZP_08096330
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      172 aa
  • Vibrio orientalis CIP 102891 = ATCC 33934

    Vibrio orientalis CIP 102891 = ATCC 33934

    • Accès à la base de données publique
      GI:261253936
      ZP_05946509
    • Longueur du coup
      172 aa
    • Valeur E
      1,3E-89
    • Score BLAST
      332,8 bits
    • Similarité
      97,09%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      ZP_05946509
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      172 aa
  • Vibrio sp. AND4

    Vibrio sp. AND4

    • Accès à la base de données publique
      GI:163803803
      ZP_02197656
    • Longueur du coup
      172 aa
    • Valeur E
      2,01E-89
    • Score BLAST
      332,4 bits
    • Similarité
      95,35%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      ZP_02197656
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      172 aa
  • Vibrio sp. MED222

    Vibrio sp. MED222

    • Accès à la base de données publique
      GI:86146315
      ZP_01064639
    • Longueur du coup
      172 aa
    • Valeur E
      4,3E-89
    • Score BLAST
      331,3 bits
    • Similarité
      95,93%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      ZP_01064639
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      172 aa
  • Vibrio sp. 16

    Vibrio sp. 16

    • Accès à la base de données publique
      GI:254508758
      ZP_05120871
    • Longueur du coup
      172 aa
    • Valeur E
      1,72E-88
    • Score BLAST
      329,3 bits
    • Similarité
      96,51%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      ZP_05120871
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      172 aa
  • Vibrio vulnificus CMCP6

    Vibrio vulnificus CMCP6

    • Accès à la base de données publique
      GI:27364974
      NP_760502
    • Longueur du coup
      172 aa
    • Valeur E
      2,26E-88
    • Score BLAST
      328,9 bits
    • Similarité
      94,77%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      NP_760502
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      172 aa
Occurrence
19 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq

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