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Datos obtenidos de: DDBJ Pat NCBI GenBank USPTO Fulltext EMBL-EBI Pat
28 secuencias encontradas en esta patente (en total)

Mostrando 1 - 10 de 28 secuencias

NÚMERO DE ID DE SEC
Longitud
Tipo
Ubicaciones
Organisms
Ocurrencia
Herramientas
NÚMERO DE ID DE SEC
1
Longitud
25
Tipo
nucleotide
Ubicaciones
Undetermined

Organismo declarado:
Artificial

Organismo determinado:
Ocurrencia
3 veces en PatSeqDB
Herramientas
Buscador de PatSeq
NÚMERO DE ID DE SEC
2
Longitud
21
Tipo
nucleotide
Ubicaciones
Undetermined

Organismo declarado:
Artificial

Organismo determinado:
  • Ustilago maydis 521

    Ustilago maydis 521

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:71023082
      XM_756678
    • Longitud del golpe
      2.934 bp
    • Valor E
      1,01E-1
    • Puntuación BLAST
      40,1 bits
    • Similitud
      100%
    • Cobertura
      95,24%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 2
      95,24% cov
      XM_756678
      0,68% cov
    • Longitud de alineación
      20 bp
    • Cadena de CIGAR
      1H20M desajustes: 0 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
Ocurrencia
3 veces en PatSeqDB
Herramientas
Buscador de PatSeq
NÚMERO DE ID DE SEC
3
Longitud
25
Tipo
nucleotide
Ubicaciones
Undetermined

Organismo declarado:
Artificial

Organismo determinado:
  • Mycobacterium tuberculosis KZN 4207

    Mycobacterium tuberculosis KZN 4207

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:328456706
      CP001662
    • Longitud del golpe
      4.394.985 bp
    • Valor E
      5,09E-2
    • Puntuación BLAST
      42,1 bits
    • Similitud
      96%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 3
      100% cov
      CP001662
      0% cov
    • Longitud de alineación
      25 bp
    • Cadena de CIGAR
      11MN13M desajustes: 1 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • Mycobacterium tuberculosis KZN 1435

    Mycobacterium tuberculosis KZN 1435

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:253318418
      CP001658
    • Longitud del golpe
      4.398.250 bp
    • Valor E
      5,09E-2
    • Puntuación BLAST
      42,1 bits
    • Similitud
      96%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 3
      100% cov
      CP001658
      0% cov
    • Longitud de alineación
      25 bp
    • Cadena de CIGAR
      11MN13M desajustes: 1 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172

    Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:224771496
      AP010918
    • Longitud del golpe
      4.371.711 bp
    • Valor E
      5,09E-2
    • Puntuación BLAST
      42,1 bits
    • Similitud
      96%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 3
      100% cov
      AP010918
      0% cov
    • Longitud de alineación
      25 bp
    • Cadena de CIGAR
      11MN13M desajustes: 1 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • Mycobacterium tuberculosis F11

    Mycobacterium tuberculosis F11

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:148719718
      CP000717
    • Longitud del golpe
      4.424.435 bp
    • Valor E
      5,09E-2
    • Puntuación BLAST
      42,1 bits
    • Similitud
      96%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 3
      100% cov
      CP000717
      0% cov
    • Longitud de alineación
      25 bp
  • Mycobacterium tuberculosis H37Ra

    Mycobacterium tuberculosis H37Ra

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:148503909
      CP000611
    • Longitud del golpe
      4.419.977 bp
    • Valor E
      5,09E-2
    • Puntuación BLAST
      42,1 bits
    • Similitud
      96%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 3
      100% cov
      CP000611
      0% cov
    • Longitud de alineación
      25 bp
  • Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2

    Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:121491530
      AM408590
    • Longitud del golpe
      4.374.522 bp
    • Valor E
      5,09E-2
    • Puntuación BLAST
      42,1 bits
    • Similitud
      96%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 3
      100% cov
      AM408590
      0% cov
    • Longitud de alineación
      25 bp
  • Mycobacterium tuberculosis CDC1551

    Mycobacterium tuberculosis CDC1551

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:50952454
      AE000516
    • Longitud del golpe
      4.403.837 bp
    • Valor E
      5,09E-2
    • Puntuación BLAST
      42,1 bits
    • Similitud
      96%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 3
      100% cov
      AE000516
      0% cov
    • Longitud de alineación
      25 bp
  • Mycobacterium tuberculosis H37Rv

    Mycobacterium tuberculosis H37Rv

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:38490319
      BX842582
      1 de 2 aciertos reportados para Mycobacterium tuberculosis H37Rv.
    • Longitud del golpe
      349.563 bp
    • Valor E
      5,09E-2
    • Puntuación BLAST
      42,1 bits
    • Similitud
      96%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 3
      100% cov
      BX842582
      0,01% cov
    • Longitud de alineación
      25 bp
  • Mycobacterium bovis AF2122/97

    Mycobacterium bovis AF2122/97

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:31619894
      BX248345
    • Longitud del golpe
      308.050 bp
    • Valor E
      5,09E-2
    • Puntuación BLAST
      42,1 bits
    • Similitud
      96%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 3
      100% cov
      BX248345
      0,01% cov
    • Longitud de alineación
      25 bp
  • Mycobacterium bovis

    Mycobacterium bovis

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:25992274
      AF522461
    • Longitud del golpe
      5.906 bp
    • Valor E
      5,09E-2
    • Puntuación BLAST
      42,1 bits
    • Similitud
      96%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 3
      100% cov
      AF522461
      0,42% cov
    • Longitud de alineación
      25 bp
Ocurrencia
3 veces en PatSeqDB
Herramientas
Buscador de PatSeq
NÚMERO DE ID DE SEC
4
Longitud
23
Tipo
nucleotide
Ubicaciones
Undetermined

Organismo declarado:
Artificial

Organismo determinado:
  • Mycobacterium tuberculosis KZN 4207

    Mycobacterium tuberculosis KZN 4207

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:328456706
      CP001662
    • Longitud del golpe
      4.394.985 bp
    • Valor E
      5,3E-1
    • Puntuación BLAST
      38,2 bits
    • Similitud
      95,65%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 4
      100% cov
      CP001662
      0% cov
    • Longitud de alineación
      23 bp
    • Cadena de CIGAR
      7MN15M desajustes: 1 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • Mycobacterium tuberculosis KZN 1435

    Mycobacterium tuberculosis KZN 1435

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:253318418
      CP001658
    • Longitud del golpe
      4.398.250 bp
    • Valor E
      5,3E-1
    • Puntuación BLAST
      38,2 bits
    • Similitud
      95,65%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 4
      100% cov
      CP001658
      0% cov
    • Longitud de alineación
      23 bp
  • Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172

    Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:224771496
      AP010918
    • Longitud del golpe
      4.371.711 bp
    • Valor E
      5,3E-1
    • Puntuación BLAST
      38,2 bits
    • Similitud
      95,65%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 4
      100% cov
      AP010918
      0% cov
    • Longitud de alineación
      23 bp
  • Mycobacterium tuberculosis F11

    Mycobacterium tuberculosis F11

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:148719718
      CP000717
    • Longitud del golpe
      4.424.435 bp
    • Valor E
      5,3E-1
    • Puntuación BLAST
      38,2 bits
    • Similitud
      95,65%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 4
      100% cov
      CP000717
      0% cov
    • Longitud de alineación
      23 bp
  • Mycobacterium tuberculosis H37Ra

    Mycobacterium tuberculosis H37Ra

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:148503909
      CP000611
    • Longitud del golpe
      4.419.977 bp
    • Valor E
      5,3E-1
    • Puntuación BLAST
      38,2 bits
    • Similitud
      95,65%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 4
      100% cov
      CP000611
      0% cov
    • Longitud de alineación
      23 bp
  • Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2

    Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:121491530
      AM408590
    • Longitud del golpe
      4.374.522 bp
    • Valor E
      5,3E-1
    • Puntuación BLAST
      38,2 bits
    • Similitud
      95,65%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 4
      100% cov
      AM408590
      0% cov
    • Longitud de alineación
      23 bp
  • Mycobacterium tuberculosis CDC1551

    Mycobacterium tuberculosis CDC1551

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:50952454
      AE000516
    • Longitud del golpe
      4.403.837 bp
    • Valor E
      5,3E-1
    • Puntuación BLAST
      38,2 bits
    • Similitud
      95,65%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 4
      100% cov
      AE000516
      0% cov
    • Longitud de alineación
      23 bp
  • Mycobacterium tuberculosis H37Rv

    Mycobacterium tuberculosis H37Rv

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:38490319
      BX842582
    • Longitud del golpe
      349.563 bp
    • Valor E
      5,3E-1
    • Puntuación BLAST
      38,2 bits
    • Similitud
      95,65%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 4
      100% cov
      BX842582
      0,01% cov
    • Longitud de alineación
      23 bp
  • Mycobacterium bovis AF2122/97

    Mycobacterium bovis AF2122/97

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:31619894
      BX248345
    • Longitud del golpe
      308.050 bp
    • Valor E
      5,3E-1
    • Puntuación BLAST
      38,2 bits
    • Similitud
      95,65%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 4
      100% cov
      BX248345
      0,01% cov
    • Longitud de alineación
      23 bp
  • Mycobacterium bovis

    Mycobacterium bovis

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:25992274
      AF522461
    • Longitud del golpe
      5.906 bp
    • Valor E
      5,3E-1
    • Puntuación BLAST
      38,2 bits
    • Similitud
      95,65%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 4
      100% cov
      AF522461
      0,39% cov
    • Longitud de alineación
      23 bp
Ocurrencia
6 veces en PatSeqDB
Herramientas
Buscador de PatSeq
NÚMERO DE ID DE SEC
5
Longitud
22
Tipo
nucleotide
Ubicaciones
Undetermined

Organismo declarado:
Artificial

Organismo determinado:
Ocurrencia
3 veces en PatSeqDB
Herramientas
Buscador de PatSeq
NÚMERO DE ID DE SEC
6
Longitud
23
Tipo
nucleotide
Ubicaciones
Undetermined

Organismo declarado:
Artificial

Organismo determinado:
  • Mycobacterium tuberculosis KZN 4207

    Mycobacterium tuberculosis KZN 4207

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:328456706
      CP001662
    • Longitud del golpe
      4.394.985 bp
    • Valor E
      5,3E-1
    • Puntuación BLAST
      38,2 bits
    • Similitud
      95,65%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      CP001662
      0% cov
    • Longitud de alineación
      23 bp
    • Cadena de CIGAR
      7MN15M desajustes: 1 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • Mycobacterium tuberculosis KZN 1435

    Mycobacterium tuberculosis KZN 1435

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:253318418
      CP001658
    • Longitud del golpe
      4.398.250 bp
    • Valor E
      5,3E-1
    • Puntuación BLAST
      38,2 bits
    • Similitud
      95,65%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      CP001658
      0% cov
    • Longitud de alineación
      23 bp
  • Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172

    Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:224771496
      AP010918
    • Longitud del golpe
      4.371.711 bp
    • Valor E
      5,3E-1
    • Puntuación BLAST
      38,2 bits
    • Similitud
      95,65%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      AP010918
      0% cov
    • Longitud de alineación
      23 bp
  • Mycobacterium tuberculosis F11

    Mycobacterium tuberculosis F11

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:148719718
      CP000717
    • Longitud del golpe
      4.424.435 bp
    • Valor E
      5,3E-1
    • Puntuación BLAST
      38,2 bits
    • Similitud
      95,65%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      CP000717
      0% cov
    • Longitud de alineación
      23 bp
  • Mycobacterium tuberculosis H37Ra

    Mycobacterium tuberculosis H37Ra

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:148503909
      CP000611
    • Longitud del golpe
      4.419.977 bp
    • Valor E
      5,3E-1
    • Puntuación BLAST
      38,2 bits
    • Similitud
      95,65%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      CP000611
      0% cov
    • Longitud de alineación
      23 bp
  • Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2

    Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:121491530
      AM408590
    • Longitud del golpe
      4.374.522 bp
    • Valor E
      5,3E-1
    • Puntuación BLAST
      38,2 bits
    • Similitud
      95,65%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      AM408590
      0% cov
    • Longitud de alineación
      23 bp
  • Mycobacterium tuberculosis CDC1551

    Mycobacterium tuberculosis CDC1551

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:50952454
      AE000516
    • Longitud del golpe
      4.403.837 bp
    • Valor E
      5,3E-1
    • Puntuación BLAST
      38,2 bits
    • Similitud
      95,65%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      AE000516
      0% cov
    • Longitud de alineación
      23 bp
  • Mycobacterium tuberculosis H37Rv

    Mycobacterium tuberculosis H37Rv

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:38490319
      BX842582
    • Longitud del golpe
      349.563 bp
    • Valor E
      5,3E-1
    • Puntuación BLAST
      38,2 bits
    • Similitud
      95,65%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      BX842582
      0,01% cov
    • Longitud de alineación
      23 bp
  • Mycobacterium bovis AF2122/97

    Mycobacterium bovis AF2122/97

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:31619894
      BX248345
    • Longitud del golpe
      308.050 bp
    • Valor E
      5,3E-1
    • Puntuación BLAST
      38,2 bits
    • Similitud
      95,65%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      BX248345
      0,01% cov
    • Longitud de alineación
      23 bp
  • Mycobacterium bovis

    Mycobacterium bovis

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:25992274
      AF522461
    • Longitud del golpe
      5.906 bp
    • Valor E
      5,3E-1
    • Puntuación BLAST
      38,2 bits
    • Similitud
      95,65%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      AF522461
      0,39% cov
    • Longitud de alineación
      23 bp
Ocurrencia
6 veces en PatSeqDB
Herramientas
Buscador de PatSeq
NÚMERO DE ID DE SEC
7
Longitud
23
Tipo
nucleotide
Ubicaciones
Undetermined

Organismo declarado:
Artificial

Organismo determinado:
Ocurrencia
3 veces en PatSeqDB
Herramientas
Buscador de PatSeq
NÚMERO DE ID DE SEC
8
Longitud
24
Tipo
nucleotide
Ubicaciones
Undetermined

Organismo declarado:
Artificial

Organismo determinado:
  • Mycobacterium tuberculosis KZN 4207

    Mycobacterium tuberculosis KZN 4207

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:328456706
      CP001662
    • Longitud del golpe
      4.394.985 bp
    • Valor E
      1,68E-1
    • Puntuación BLAST
      40,1 bits
    • Similitud
      95,83%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      CP001662
      0% cov
    • Longitud de alineación
      24 bp
    • Cadena de CIGAR
      9MN14M desajustes: 1 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • Mycobacterium tuberculosis KZN 1435

    Mycobacterium tuberculosis KZN 1435

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:253318418
      CP001658
    • Longitud del golpe
      4.398.250 bp
    • Valor E
      1,68E-1
    • Puntuación BLAST
      40,1 bits
    • Similitud
      95,83%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      CP001658
      0% cov
    • Longitud de alineación
      24 bp
    • Cadena de CIGAR
      9MN14M desajustes: 1 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172

    Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:224771496
      AP010918
    • Longitud del golpe
      4.371.711 bp
    • Valor E
      1,68E-1
    • Puntuación BLAST
      40,1 bits
    • Similitud
      95,83%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      AP010918
      0% cov
    • Longitud de alineación
      24 bp
    • Cadena de CIGAR
      9MN14M desajustes: 1 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • Mycobacterium tuberculosis F11

    Mycobacterium tuberculosis F11

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:148719718
      CP000717
    • Longitud del golpe
      4.424.435 bp
    • Valor E
      1,68E-1
    • Puntuación BLAST
      40,1 bits
    • Similitud
      95,83%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      CP000717
      0% cov
    • Longitud de alineación
      24 bp
  • Mycobacterium tuberculosis H37Ra

    Mycobacterium tuberculosis H37Ra

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:148503909
      CP000611
    • Longitud del golpe
      4.419.977 bp
    • Valor E
      1,68E-1
    • Puntuación BLAST
      40,1 bits
    • Similitud
      95,83%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      CP000611
      0% cov
    • Longitud de alineación
      24 bp
  • Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2

    Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:121491530
      AM408590
    • Longitud del golpe
      4.374.522 bp
    • Valor E
      1,68E-1
    • Puntuación BLAST
      40,1 bits
    • Similitud
      95,83%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      AM408590
      0% cov
    • Longitud de alineación
      24 bp
  • Mycobacterium tuberculosis CDC1551

    Mycobacterium tuberculosis CDC1551

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:50952454
      AE000516
    • Longitud del golpe
      4.403.837 bp
    • Valor E
      1,68E-1
    • Puntuación BLAST
      40,1 bits
    • Similitud
      95,83%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      AE000516
      0% cov
    • Longitud de alineación
      24 bp
  • Mycobacterium tuberculosis H37Rv

    Mycobacterium tuberculosis H37Rv

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:38490288
      BX842578
    • Longitud del golpe
      346.186 bp
    • Valor E
      1,68E-1
    • Puntuación BLAST
      40,1 bits
    • Similitud
      95,83%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      BX842578
      0,01% cov
    • Longitud de alineación
      24 bp
  • Mycobacterium bovis AF2122/97

    Mycobacterium bovis AF2122/97

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:31618753
      BX248341
    • Longitud del golpe
      306.050 bp
    • Valor E
      1,68E-1
    • Puntuación BLAST
      40,1 bits
    • Similitud
      95,83%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      BX248341
      0,01% cov
    • Longitud de alineación
      24 bp
Ocurrencia
3 veces en PatSeqDB
Herramientas
Buscador de PatSeq
NÚMERO DE ID DE SEC
9
Longitud
33
Tipo
nucleotide
Ubicaciones
Undetermined

Organismo declarado:
Artificial

Organismo determinado:
  • Mycobacterium tuberculosis KZN 4207

    Mycobacterium tuberculosis KZN 4207

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:328456706
      CP001662
    • Longitud del golpe
      4.394.985 bp
    • Valor E
      1,86E-6
    • Puntuación BLAST
      58 bits
    • Similitud
      96,97%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      CP001662
      0% cov
    • Longitud de alineación
      33 bp
    • Cadena de CIGAR
      14MN18M desajustes: 1 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • Mycobacterium tuberculosis KZN 1435

    Mycobacterium tuberculosis KZN 1435

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:253318418
      CP001658
    • Longitud del golpe
      4.398.250 bp
    • Valor E
      1,86E-6
    • Puntuación BLAST
      58 bits
    • Similitud
      96,97%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      CP001658
      0% cov
    • Longitud de alineación
      33 bp
    • Cadena de CIGAR
      14MN18M desajustes: 1 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172

    Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:224771496
      AP010918
    • Longitud del golpe
      4.371.711 bp
    • Valor E
      1,86E-6
    • Puntuación BLAST
      58 bits
    • Similitud
      96,97%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      AP010918
      0% cov
    • Longitud de alineación
      33 bp
    • Cadena de CIGAR
      14MN18M desajustes: 1 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • Mycobacterium tuberculosis F11

    Mycobacterium tuberculosis F11

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:148719718
      CP000717
    • Longitud del golpe
      4.424.435 bp
    • Valor E
      1,86E-6
    • Puntuación BLAST
      58 bits
    • Similitud
      96,97%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      CP000717
      0% cov
    • Longitud de alineación
      33 bp
  • Mycobacterium tuberculosis H37Ra

    Mycobacterium tuberculosis H37Ra

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:148503909
      CP000611
    • Longitud del golpe
      4.419.977 bp
    • Valor E
      1,86E-6
    • Puntuación BLAST
      58 bits
    • Similitud
      96,97%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      CP000611
      0% cov
    • Longitud de alineación
      33 bp
  • Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2

    Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:121491530
      AM408590
    • Longitud del golpe
      4.374.522 bp
    • Valor E
      1,86E-6
    • Puntuación BLAST
      58 bits
    • Similitud
      96,97%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      AM408590
      0% cov
    • Longitud de alineación
      33 bp
  • Mycobacterium tuberculosis CDC1551

    Mycobacterium tuberculosis CDC1551

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:50952454
      AE000516
    • Longitud del golpe
      4.403.837 bp
    • Valor E
      1,86E-6
    • Puntuación BLAST
      58 bits
    • Similitud
      96,97%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      AE000516
      0% cov
    • Longitud de alineación
      33 bp
  • Mycobacterium tuberculosis H37Rv

    Mycobacterium tuberculosis H37Rv

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:38490319
      BX842582
      1 de 2 aciertos reportados para Mycobacterium tuberculosis H37Rv.
    • Longitud del golpe
      349.563 bp
    • Valor E
      1,86E-6
    • Puntuación BLAST
      58 bits
    • Similitud
      96,97%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      BX842582
      0,01% cov
    • Longitud de alineación
      33 bp
  • Mycobacterium bovis AF2122/97

    Mycobacterium bovis AF2122/97

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:31619894
      BX248345
    • Longitud del golpe
      308.050 bp
    • Valor E
      1,86E-6
    • Puntuación BLAST
      58 bits
    • Similitud
      96,97%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      BX248345
      0,01% cov
    • Longitud de alineación
      33 bp
  • Mycobacterium bovis

    Mycobacterium bovis

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:25992274
      AF522461
    • Longitud del golpe
      5.906 bp
    • Valor E
      1,86E-6
    • Puntuación BLAST
      58 bits
    • Similitud
      96,97%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      AF522461
      0,56% cov
    • Longitud de alineación
      33 bp
  • Streptomyces griseus subsp. griseus NBRC 13350

    Streptomyces griseus subsp. griseus NBRC 13350

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:178462309
      AP009493
    • Longitud del golpe
      8.545.929 bp
    • Valor E
      1,1E-1
    • Puntuación BLAST
      42,1 bits
    • Similitud
      90,91%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      AP009493
      0% cov
    • Longitud de alineación
      33 bp
  • Frankia sp. EAN1pec

    Frankia sp. EAN1pec

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:158107272
      CP000820
    • Longitud del golpe
      8.982.042 bp
    • Valor E
      1,1E-1
    • Puntuación BLAST
      42,1 bits
    • Similitud
      90,91%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      CP000820
      0% cov
    • Longitud de alineación
      33 bp
  • Frankia sp. CcI3

    Frankia sp. CcI3

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:86565586
      CP000249
    • Longitud del golpe
      5.433.628 bp
    • Valor E
      1,1E-1
    • Puntuación BLAST
      42,1 bits
    • Similitud
      90,91%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      CP000249
      0% cov
    • Longitud de alineación
      33 bp
Ocurrencia
3 veces en PatSeqDB
Herramientas
Buscador de PatSeq
NÚMERO DE ID DE SEC
10
Longitud
33
Tipo
nucleotide
Ubicaciones
Undetermined

Organismo declarado:
Artificial

Organismo determinado:
  • Mycobacterium tuberculosis KZN 4207

    Mycobacterium tuberculosis KZN 4207

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:328456706
      CP001662
    • Longitud del golpe
      4.394.985 bp
    • Valor E
      1,86E-6
    • Puntuación BLAST
      58 bits
    • Similitud
      96,97%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      CP001662
      0% cov
    • Longitud de alineación
      33 bp
    • Cadena de CIGAR
      18MN14M desajustes: 1 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • Mycobacterium tuberculosis KZN 1435

    Mycobacterium tuberculosis KZN 1435

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:253318418
      CP001658
    • Longitud del golpe
      4.398.250 bp
    • Valor E
      1,86E-6
    • Puntuación BLAST
      58 bits
    • Similitud
      96,97%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      CP001658
      0% cov
    • Longitud de alineación
      33 bp
    • Cadena de CIGAR
      18MN14M desajustes: 1 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172

    Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:224771496
      AP010918
    • Longitud del golpe
      4.371.711 bp
    • Valor E
      1,86E-6
    • Puntuación BLAST
      58 bits
    • Similitud
      96,97%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      AP010918
      0% cov
    • Longitud de alineación
      33 bp
    • Cadena de CIGAR
      18MN14M desajustes: 1 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • Mycobacterium tuberculosis F11

    Mycobacterium tuberculosis F11

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:148719718
      CP000717
    • Longitud del golpe
      4.424.435 bp
    • Valor E
      1,86E-6
    • Puntuación BLAST
      58 bits
    • Similitud
      96,97%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      CP000717
      0% cov
    • Longitud de alineación
      33 bp
  • Mycobacterium tuberculosis H37Ra

    Mycobacterium tuberculosis H37Ra

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:148503909
      CP000611
    • Longitud del golpe
      4.419.977 bp
    • Valor E
      1,86E-6
    • Puntuación BLAST
      58 bits
    • Similitud
      96,97%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      CP000611
      0% cov
    • Longitud de alineación
      33 bp
  • Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2

    Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:121491530
      AM408590
    • Longitud del golpe
      4.374.522 bp
    • Valor E
      1,86E-6
    • Puntuación BLAST
      58 bits
    • Similitud
      96,97%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      AM408590
      0% cov
    • Longitud de alineación
      33 bp
  • Mycobacterium tuberculosis CDC1551

    Mycobacterium tuberculosis CDC1551

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:50952454
      AE000516
    • Longitud del golpe
      4.403.837 bp
    • Valor E
      1,86E-6
    • Puntuación BLAST
      58 bits
    • Similitud
      96,97%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      AE000516
      0% cov
    • Longitud de alineación
      33 bp
  • Mycobacterium tuberculosis H37Rv

    Mycobacterium tuberculosis H37Rv

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:38490319
      BX842582
      1 de 2 aciertos reportados para Mycobacterium tuberculosis H37Rv.
    • Longitud del golpe
      349.563 bp
    • Valor E
      1,86E-6
    • Puntuación BLAST
      58 bits
    • Similitud
      96,97%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      BX842582
      0,01% cov
    • Longitud de alineación
      33 bp
  • Mycobacterium bovis AF2122/97

    Mycobacterium bovis AF2122/97

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:31619894
      BX248345
    • Longitud del golpe
      308.050 bp
    • Valor E
      1,86E-6
    • Puntuación BLAST
      58 bits
    • Similitud
      96,97%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      BX248345
      0,01% cov
    • Longitud de alineación
      33 bp
  • Mycobacterium bovis

    Mycobacterium bovis

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:25992274
      AF522461
    • Longitud del golpe
      5.906 bp
    • Valor E
      1,86E-6
    • Puntuación BLAST
      58 bits
    • Similitud
      96,97%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      AF522461
      0,56% cov
    • Longitud de alineación
      33 bp
  • Streptomyces griseus subsp. griseus NBRC 13350

    Streptomyces griseus subsp. griseus NBRC 13350

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:178462309
      AP009493
    • Longitud del golpe
      8.545.929 bp
    • Valor E
      1,1E-1
    • Puntuación BLAST
      42,1 bits
    • Similitud
      90,91%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      AP009493
      0% cov
    • Longitud de alineación
      33 bp
  • Frankia sp. EAN1pec

    Frankia sp. EAN1pec

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:158107272
      CP000820
    • Longitud del golpe
      8.982.042 bp
    • Valor E
      1,1E-1
    • Puntuación BLAST
      42,1 bits
    • Similitud
      90,91%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      CP000820
      0% cov
    • Longitud de alineación
      33 bp
  • Frankia sp. CcI3

    Frankia sp. CcI3

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:86565586
      CP000249
    • Longitud del golpe
      5.433.628 bp
    • Valor E
      1,1E-1
    • Puntuación BLAST
      42,1 bits
    • Similitud
      90,91%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      CP000249
      0% cov
    • Longitud de alineación
      33 bp
Ocurrencia
3 veces en PatSeqDB
Herramientas
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