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recherche de séquences biologiques divulguées dans les brevets

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Données obtenues à partir de: USPTO Fulltext
164 séquences trouvées dans ce brevet (au total)

Affichage 1 - 10 de 164 séquences

SEQ ID NO
Longueur
Type
Emplacements
Organisms
Occurrence
Outils
SEQ ID NO
1
Longueur
1 886
Type
DNA
Emplacements
Detailed Description

Organisme déclaré:
Mycobacterium tuberculosis

Organisme déterminé:
  • Mycobacterium tuberculosis KZN 4207

    Mycobacterium tuberculosis KZN 4207

    • Accès à la base de données publique
      GI:328456706
      CP001662
    • Longueur du coup
      4 394 985 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      3 203,2 bits
    • Similarité
      99,15%
    • Couverture
      93,74%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      93,74% cov
      CP001662
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 769 bp
    • Chaîne CIGARE
      118H5MDMN21MN99MNMN3MN60MN55MN25MN523MN372M2N168MN92MI24MN305M incompatibilités: 13 - insertions: 1 - suppressions: 1
  • Mycobacterium tuberculosis KZN 1435

    Mycobacterium tuberculosis KZN 1435

    • Accès à la base de données publique
      GI:253318418
      CP001658
    • Longueur du coup
      4 398 250 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      3 203,2 bits
    • Similarité
      99,15%
    • Couverture
      93,74%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      93,74% cov
      CP001658
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 769 bp
    • Chaîne CIGARE
      118H5MDMN21MN99MNMN3MN60MN55MN25MN523MN372M2N168MN92MI24MN305M incompatibilités: 13 - insertions: 1 - suppressions: 1
  • Mycobacterium tuberculosis F11

    Mycobacterium tuberculosis F11

    • Accès à la base de données publique
      GI:148719718
      CP000717
    • Longueur du coup
      4 424 435 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      3 203,2 bits
    • Similarité
      99,15%
    • Couverture
      93,74%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      93,74% cov
      CP000717
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 769 bp
    • Chaîne CIGARE
      118H5MDMN21MN99MNMN3MN60MN55MN25MN523MN372M2N168MN92MI24MN305M incompatibilités: 13 - insertions: 1 - suppressions: 1
  • Mycobacterium tuberculosis H37Ra

    Mycobacterium tuberculosis H37Ra

    • Accès à la base de données publique
      GI:148503909
      CP000611
    • Longueur du coup
      4 419 977 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      3 203,2 bits
    • Similarité
      99,15%
    • Couverture
      93,74%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      93,74% cov
      CP000611
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 769 bp
    • Chaîne CIGARE
      118H5MDMN21MN99MNMN3MN60MN55MN25MN523MN372M2N168MN92MI24MN305M incompatibilités: 13 - insertions: 1 - suppressions: 1
  • Mycobacterium tuberculosis CDC1551

    Mycobacterium tuberculosis CDC1551

    • Accès à la base de données publique
      GI:50952454
      AE000516
    • Longueur du coup
      4 403 837 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      3 203,2 bits
    • Similarité
      99,15%
    • Couverture
      93,74%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      93,74% cov
      AE000516
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 769 bp
    • Chaîne CIGARE
      118H5MDMN21MN99MNMN3MN60MN55MN25MN523MN372M2N168MN92MI24MN305M incompatibilités: 13 - insertions: 1 - suppressions: 1
  • Mycobacterium tuberculosis H37Rv

    Mycobacterium tuberculosis H37Rv

    • Accès à la base de données publique
      GI:41352785
      BX842583
    • Longueur du coup
      349 606 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      3 203,2 bits
    • Similarité
      99,15%
    • Couverture
      93,74%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      93,74% cov
      BX842583
      0,51% cov
    • Longueur d'alignement
      1 769 bp
    • Chaîne CIGARE
      118H5MDMN21MN99MNMN3MN60MN55MN25MN523MN372M2N168MN92MI24MN305M incompatibilités: 13 - insertions: 1 - suppressions: 1
Occurrence
25 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
2
Longueur
2 305
Type
DNA
Emplacements
Detailed Description

Organisme déclaré:
Mycobacterium tuberculosis

Organisme déterminé:
  • Mycobacterium tuberculosis KZN 4207

    Mycobacterium tuberculosis KZN 4207

    • Accès à la base de données publique
      GI:328456706
      CP001662
    • Longueur du coup
      4 394 985 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      2 593,8 bits
    • Similarité
      99,72%
    • Couverture
      61,34%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      61,34% cov
      CP001662
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 414 bp
    • Chaîne CIGARE
      891H359MN855MN15MN61MN120M incompatibilités: 4 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium tuberculosis KZN 1435

    Mycobacterium tuberculosis KZN 1435

    • Accès à la base de données publique
      GI:253318418
      CP001658
    • Longueur du coup
      4 398 250 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      2 593,8 bits
    • Similarité
      99,72%
    • Couverture
      61,34%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      61,34% cov
      CP001658
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 414 bp
    • Chaîne CIGARE
      891H359MN855MN15MN61MN120M incompatibilités: 4 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172

    Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172

    • Accès à la base de données publique
      GI:224771496
      AP010918
    • Longueur du coup
      4 371 711 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      2 593,8 bits
    • Similarité
      99,72%
    • Couverture
      61,34%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      61,34% cov
      AP010918
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 414 bp
    • Chaîne CIGARE
      891H359MN855MN15MN61MN120M incompatibilités: 4 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium tuberculosis F11

    Mycobacterium tuberculosis F11

    • Accès à la base de données publique
      GI:148719718
      CP000717
    • Longueur du coup
      4 424 435 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      2 593,8 bits
    • Similarité
      99,72%
    • Couverture
      61,34%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      61,34% cov
      CP000717
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 414 bp
    • Chaîne CIGARE
      891H359MN855MN15MN61MN120M incompatibilités: 4 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium tuberculosis H37Ra

    Mycobacterium tuberculosis H37Ra

    • Accès à la base de données publique
      GI:148503909
      CP000611
    • Longueur du coup
      4 419 977 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      2 593,8 bits
    • Similarité
      99,72%
    • Couverture
      61,34%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      61,34% cov
      CP000611
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 414 bp
    • Chaîne CIGARE
      891H359MN855MN15MN61MN120M incompatibilités: 4 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2

    Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2

    • Accès à la base de données publique
      GI:121491530
      AM408590
    • Longueur du coup
      4 374 522 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      2 593,8 bits
    • Similarité
      99,72%
    • Couverture
      61,34%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      61,34% cov
      AM408590
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 414 bp
    • Chaîne CIGARE
      891H359MN855MN15MN61MN120M incompatibilités: 4 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium tuberculosis CDC1551

    Mycobacterium tuberculosis CDC1551

    • Accès à la base de données publique
      GI:50952454
      AE000516
    • Longueur du coup
      4 403 837 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      2 593,8 bits
    • Similarité
      99,72%
    • Couverture
      61,34%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      61,34% cov
      AE000516
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 414 bp
    • Chaîne CIGARE
      891H359MN855MN15MN61MN120M incompatibilités: 4 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium tuberculosis H37Rv

    Mycobacterium tuberculosis H37Rv

    • Accès à la base de données publique
      GI:38490250
      BX842576
    • Longueur du coup
      348 264 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      2 593,8 bits
    • Similarité
      99,72%
    • Couverture
      61,34%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      61,34% cov
      BX842576
      0,41% cov
    • Longueur d'alignement
      1 414 bp
    • Chaîne CIGARE
      891H359MN855MN15MN61MN120M incompatibilités: 4 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium bovis AF2122/97

    Mycobacterium bovis AF2122/97

    • Accès à la base de données publique
      GI:31618223
      BX248339
    • Longueur du coup
      300 050 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      2 593,8 bits
    • Similarité
      99,72%
    • Couverture
      61,34%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      61,34% cov
      BX248339
      0,47% cov
    • Longueur d'alignement
      1 414 bp
    • Chaîne CIGARE
      891H359MN855MN15MN61MN120M incompatibilités: 4 - insertions: 0 - suppressions: 0
Occurrence
25 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
3
Longueur
1 742
Type
DNA
Emplacements
Detailed Description

Organisme déclaré:
Mycobacterium tuberculosis

Organisme déterminé:
Occurrence
52 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
4
Longueur
2 836
Type
DNA
Emplacements
Detailed Description

Organisme déclaré:
Mycobacterium tuberculosis

Organisme déterminé:
  • Mycobacterium tuberculosis KZN 4207

    Mycobacterium tuberculosis KZN 4207

    • Accès à la base de données publique
      GI:328456706
      CP001662
    • Longueur du coup
      4 394 985 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      4 955,7 bits
    • Similarité
      99,93%
    • Couverture
      94,85%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      94,85% cov
      CP001662
      0,06% cov
    • Longueur d'alignement
      2 690 bp
    • Chaîne CIGARE
      103MD395MN2190M146H incompatibilités: 1 - insertions: 0 - suppressions: 1
  • Mycobacterium tuberculosis KZN 1435

    Mycobacterium tuberculosis KZN 1435

    • Accès à la base de données publique
      GI:253318418
      CP001658
    • Longueur du coup
      4 398 250 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      4 955,7 bits
    • Similarité
      99,93%
    • Couverture
      94,85%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      94,85% cov
      CP001658
      0,06% cov
    • Longueur d'alignement
      2 690 bp
    • Chaîne CIGARE
      103MD395MN2190M146H incompatibilités: 1 - insertions: 0 - suppressions: 1
  • Mycobacterium tuberculosis H37Ra

    Mycobacterium tuberculosis H37Ra

    • Accès à la base de données publique
      GI:148503909
      CP000611
    • Longueur du coup
      4 419 977 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      4 955,7 bits
    • Similarité
      99,93%
    • Couverture
      94,85%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      94,85% cov
      CP000611
      0,06% cov
    • Longueur d'alignement
      2 690 bp
    • Chaîne CIGARE
      103MD395MN2190M146H incompatibilités: 1 - insertions: 0 - suppressions: 1
  • Mycobacterium tuberculosis H37Rv

    Mycobacterium tuberculosis H37Rv

    • Accès à la base de données publique
      GI:38684030
      BX842577
    • Longueur du coup
      347 496 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      4 955,7 bits
    • Similarité
      99,93%
    • Couverture
      94,85%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      94,85% cov
      BX842577
      0,77% cov
    • Longueur d'alignement
      2 690 bp
    • Chaîne CIGARE
      103MD395MN2190M146H incompatibilités: 1 - insertions: 0 - suppressions: 1
  • Mycobacterium tuberculosis F11

    Mycobacterium tuberculosis F11

    • Accès à la base de données publique
      GI:148719718
      CP000717
    • Longueur du coup
      4 424 435 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      4 939,1 bits
    • Similarité
      99,81%
    • Couverture
      94,85%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      94,85% cov
      CP000717
      0,06% cov
    • Longueur d'alignement
      2 690 bp
    • Chaîne CIGARE
      103MD395MN929MD3MN9MN1246M146H incompatibilités: 3 - insertions: 0 - suppressions: 2
  • Mycobacterium tuberculosis CDC1551

    Mycobacterium tuberculosis CDC1551

    • Accès à la base de données publique
      GI:50952454
      AE000516
    • Longueur du coup
      4 403 837 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      4 939,1 bits
    • Similarité
      99,81%
    • Couverture
      94,85%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      94,85% cov
      AE000516
      0,06% cov
    • Longueur d'alignement
      2 690 bp
    • Chaîne CIGARE
      103MD395MN1443MN6MN79MN659M146H incompatibilités: 4 - insertions: 0 - suppressions: 1
  • Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2

    Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2

    • Accès à la base de données publique
      GI:121491530
      AM408590
    • Longueur du coup
      4 374 522 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      4 928 bits
    • Similarité
      99,74%
    • Couverture
      94,85%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      94,85% cov
      AM408590
      0,06% cov
    • Longueur d'alignement
      2 691 bp
    • Chaîne CIGARE
      103MD395MN900MN174MI2MD31MN654MN425M146H incompatibilités: 4 - insertions: 1 - suppressions: 2
  • Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172

    Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172

    • Accès à la base de données publique
      GI:224771496
      AP010918
    • Longueur du coup
      4 371 711 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      4 922,4 bits
    • Similarité
      99,7%
    • Couverture
      94,85%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      94,85% cov
      AP010918
      0,06% cov
    • Longueur d'alignement
      2 691 bp
    • Chaîne CIGARE
      103MD395MN900MN174MI2MD31MN501MN152MN425M146H incompatibilités: 5 - insertions: 1 - suppressions: 2
  • Mycobacterium bovis AF2122/97

    Mycobacterium bovis AF2122/97

    • Accès à la base de données publique
      GI:31618479
      BX248340
    • Longueur du coup
      291 050 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      4 911,4 bits
    • Similarité
      99,63%
    • Couverture
      94,85%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      94,85% cov
      BX248340
      0,92% cov
    • Longueur d'alignement
      2 691 bp
    • Chaîne CIGARE
      79MN23MD173MN221MN614MN285MN174MI2MD31MN654MN425M146H incompatibilités: 7 - insertions: 1 - suppressions: 2
Occurrence
51 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
5
Longueur
900
Type
DNA
Emplacements
Detailed Description

Organisme déclaré:
Mycobacterium tuberculosis

Organisme déterminé:
  • Mycobacterium tuberculosis F11

    Mycobacterium tuberculosis F11

    • Accès à la base de données publique
      GI:148719718
      CP000717
    • Longueur du coup
      4 424 435 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 626,2 bits
    • Similarité
      99,22%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      CP000717
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      900 bp
    • Chaîne CIGARE
      160MN5MN56MN86MN29MN468MN77MN12M incompatibilités: 7 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium tuberculosis H37Ra

    Mycobacterium tuberculosis H37Ra

    • Accès à la base de données publique
      GI:148503909
      CP000611
    • Longueur du coup
      4 419 977 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 620,6 bits
    • Similarité
      99,11%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      CP000611
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      900 bp
    • Chaîne CIGARE
      160MN5MN56MN86MN29MN420MN47MN77MN12M incompatibilités: 8 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium tuberculosis H37Rv

    Mycobacterium tuberculosis H37Rv

    • Accès à la base de données publique
      GI:41353619
      BX842575
    • Longueur du coup
      349 306 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 620,6 bits
    • Similarité
      99,11%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      BX842575
      0,26% cov
    • Longueur d'alignement
      900 bp
    • Chaîne CIGARE
      160MN5MN56MN86MN29MN420MN47MN77MN12M incompatibilités: 8 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium tuberculosis KZN 4207

    Mycobacterium tuberculosis KZN 4207

    • Accès à la base de données publique
      GI:328456706
      CP001662
    • Longueur du coup
      4 394 985 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 609,6 bits
    • Similarité
      98,89%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      CP001662
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      901 bp
    • Chaîne CIGARE
      53MN106MN5MN56MN13MI3MD69MN29MN468MN77MN12M incompatibilités: 8 - insertions: 1 - suppressions: 1
  • Mycobacterium tuberculosis KZN 1435

    Mycobacterium tuberculosis KZN 1435

    • Accès à la base de données publique
      GI:253318418
      CP001658
    • Longueur du coup
      4 398 250 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 609,6 bits
    • Similarité
      98,89%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      CP001658
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      901 bp
    • Chaîne CIGARE
      53MN106MN5MN56MN13MI3MD69MN29MN468MN77MN12M incompatibilités: 8 - insertions: 1 - suppressions: 1
  • Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172

    Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172

    • Accès à la base de données publique
      GI:224771496
      AP010918
    • Longueur du coup
      4 371 711 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 604 bits
    • Similarité
      98,78%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      AP010918
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      900 bp
    • Chaîne CIGARE
      160MN5MN10MN3MN41MN86MN29MN5MN414MN47MN77MN12M incompatibilités: 11 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2

    Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2

    • Accès à la base de données publique
      GI:121491530
      AM408590
    • Longueur du coup
      4 374 522 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 604 bits
    • Similarité
      98,78%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      AM408590
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      900 bp
    • Chaîne CIGARE
      160MN5MN10MN3MN41MN86MN29MN5MN414MN47MN77MN12M incompatibilités: 11 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium tuberculosis CDC1551

    Mycobacterium tuberculosis CDC1551

    • Accès à la base de données publique
      GI:50952454
      AE000516
    • Longueur du coup
      4 403 837 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 604 bits
    • Similarité
      98,78%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      AE000516
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      900 bp
    • Chaîne CIGARE
      181MN38MN2MN12MN14MN5MN52M2N28MN468MN77MN12M incompatibilités: 11 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium bovis AF2122/97

    Mycobacterium bovis AF2122/97

    • Accès à la base de données publique
      GI:31617962
      BX248338
    • Longueur du coup
      299 450 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 604 bits
    • Similarité
      98,78%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      BX248338
      0,3% cov
    • Longueur d'alignement
      900 bp
    • Chaîne CIGARE
      160MN5MN10MN3MN41MN86MN29MN5MN414MN47MN77MN12M incompatibilités: 11 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mycobacterium bovis

    Mycobacterium bovis

    • Accès à la base de données publique
      GI:673429
      X84741
    • Longueur du coup
      1 902 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 557,8 bits
    • Similarité
      98,74%
    • Couverture
      97,33%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      97,33% cov
      X84741
      46% cov
    • Longueur d'alignement
      876 bp
    • Chaîne CIGARE
      24H136MN5MN10MN3MN41MN86MN28MD6MN414MN47MN77MN12M incompatibilités: 10 - insertions: 0 - suppressions: 1
Occurrence
25 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
6
Longueur
1 905
Type
DNA
Emplacements
Detailed Description

Organisme déclaré:
Mycobacterium tuberculosis

Organisme déterminé:
Occurrence
25 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
7
Longueur
2 921
Type
DNA
Emplacements
Detailed Description

Organisme déclaré:
Mycobacterium tuberculosis

Organisme déterminé:
Occurrence
25 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
8
Longueur
1 704
Type
DNA
Emplacements
Detailed Description

Organisme déclaré:
Mycobacterium tuberculosis

Organisme déterminé:
  • Mycobacterium tuberculosis KZN 4207

    Mycobacterium tuberculosis KZN 4207

    • Accès à la base de données publique
      GI:328456706
      CP001662
    • Longueur du coup
      4 394 985 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      2 462,7 bits
    • Similarité
      98,13%
    • Couverture
      81,57%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      81,57% cov
      CP001662
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 391 bp
    • Chaîne CIGARE
      314H337MN120MN31MN23MN2MN54MN2MN31MN33MN11MN21MN28MN157MN133MN74MN2MN23MN35MN26MNM2NMN25MN18MN70MN96MI11M incompatibilités: 25 - insertions: 1 - suppressions: 0
  • Mycobacterium tuberculosis KZN 1435

    Mycobacterium tuberculosis KZN 1435

    • Accès à la base de données publique
      GI:253318418
      CP001658
    • Longueur du coup
      4 398 250 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      2 462,7 bits
    • Similarité
      98,13%
    • Couverture
      81,57%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      81,57% cov
      CP001658
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 391 bp
    • Chaîne CIGARE
      314H337MN120MN31MN23MN2MN54MN2MN31MN33MN11MN21MN28MN157MN133MN74MN2MN23MN35MN26MNM2NMN25MN18MN70MN96MI11M incompatibilités: 25 - insertions: 1 - suppressions: 0
  • Mycobacterium tuberculosis CDC1551

    Mycobacterium tuberculosis CDC1551

    • Accès à la base de données publique
      GI:50952454
      AE000516
    • Longueur du coup
      4 403 837 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      2 462,7 bits
    • Similarité
      98,13%
    • Couverture
      81,57%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      81,57% cov
      AE000516
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 391 bp
    • Chaîne CIGARE
      314H337MN120MN31MN23MN2MN54MN2MN31MN33MN11MN21MN28MN157MN133MN74MN2MN23MN35MN26MNM2NMN25MN18MN70MN96MI11M incompatibilités: 25 - insertions: 1 - suppressions: 0
  • Mycobacterium tuberculosis F11

    Mycobacterium tuberculosis F11

    • Accès à la base de données publique
      GI:148719718
      CP000717
    • Longueur du coup
      4 424 435 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      2 457,2 bits
    • Similarité
      98,06%
    • Couverture
      81,57%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      81,57% cov
      CP000717
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 391 bp
    • Chaîne CIGARE
      314H337MN120MN31MN23MN2MN54MN2MN31MN33MN11MN21MN28MN34MN122MN133MN74MN2MN23MN35MN26MNM2NMN25MN18MN70MN96MI11M incompatibilités: 26 - insertions: 1 - suppressions: 0
  • Mycobacterium tuberculosis H37Ra

    Mycobacterium tuberculosis H37Ra

    • Accès à la base de données publique
      GI:148503909
      CP000611
    • Longueur du coup
      4 419 977 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      2 435 bits
    • Similarité
      97,77%
    • Couverture
      81,57%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      81,57% cov
      CP000611
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 391 bp
    • Chaîne CIGARE
      314H337MN120MN31MN23MN2MN54MN2MN31MN33MN11MN21MN28MN138MN18M2N8MN100MN22MN74MN2MN23MN35MN26MNM2NMN2MN22MN18MN70MN96MI11M incompatibilités: 30 - insertions: 1 - suppressions: 0
  • Mycobacterium tuberculosis H37Rv

    Mycobacterium tuberculosis H37Rv

    • Accès à la base de données publique
      GI:41352785
      BX842583
    • Longueur du coup
      349 606 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      2 435 bits
    • Similarité
      97,77%
    • Couverture
      81,57%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      81,57% cov
      BX842583
      0,4% cov
    • Longueur d'alignement
      1 391 bp
    • Chaîne CIGARE
      314H337MN120MN31MN23MN2MN54MN2MN31MN33MN11MN21MN28MN138MN18M2N8MN100MN22MN74MN2MN23MN35MN26MNM2NMN2MN22MN18MN70MN96MI11M incompatibilités: 30 - insertions: 1 - suppressions: 0
Occurrence
25 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
9
Longueur
2 286
Type
DNA
Emplacements
Detailed Description

Organisme déclaré:
Mycobacterium tuberculosis

Organisme déterminé:
Occurrence
25 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
10
Longueur
1 136
Type
DNA
Emplacements
Detailed Description

Organisme déclaré:
Mycobacterium tuberculosis

Organisme déterminé:
Occurrence
25 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq

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