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Datos obtenidos de: DDBJ Pat NCBI GenBank USPTO Fulltext EMBL-EBI Pat
140 secuencias encontradas en esta patente (en total)

Mostrando 1 - 10 de 140 secuencias

NÚMERO DE ID DE SEC
Longitud
Tipo
Ubicaciones
Organisms
Ocurrencia
Herramientas
NÚMERO DE ID DE SEC
1
Longitud
1.164
Tipo
nucleotide
Ubicaciones
Detailed Description, Summary

Organismo declarado:
Ricinus communis

Organismo determinado:
  • Ricinus communis

    Ricinus communis

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:255574427
      XM_002528081
      1 de 3 aciertos reportados para Ricinus communis.
    • Longitud del golpe
      1.897 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      2.145,1 bits
    • Similitud
      99,91%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 1
      100% cov
      XM_002528081
      61,36% cov
    • Longitud de alineación
      1.164 bp
    • Cadena de CIGAR
      1037MN126M desajustes: 1 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • Caragana korshinskii

    Caragana korshinskii

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:168014137
      EU433557
    • Longitud del golpe
      1.143 bp
    • Valor E
      1,04E-124
    • Puntuación BLAST
      457,2 bits
    • Similitud
      75,27%
    • Cobertura
      92,1%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 1
      92,1% cov
      EU433557
      93,79% cov
    • Longitud de alineación
      1.112 bp
  • Gossypium hirsutum

    Gossypium hirsutum

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:310657310
      HQ259410
      1 de 2 aciertos reportados para Gossypium hirsutum.
    • Longitud del golpe
      1.362 bp
    • Valor E
      3,03E-90
    • Puntuación BLAST
      342,8 bits
    • Similitud
      75,03%
    • Cobertura
      72,85%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 1
      72,85% cov
      HQ259410
      62,26% cov
    • Longitud de alineación
      885 bp
Ocurrencia
21 veces en PatSeqDB
Herramientas
Buscador de PatSeq
NÚMERO DE ID DE SEC
2
Longitud
1.155
Tipo
nucleotide
Ubicaciones
Detailed Description, Summary

Organismo declarado:
Physaria fendleri

Organismo determinado:
  • Physaria fendleri

    Physaria fendleri

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:3452128
      AF016103
      1 de 3 aciertos reportados para Physaria fendleri.
    • Longitud del golpe
      3.670 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      2.073,1 bits
    • Similitud
      99,05%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      AF016103
      31,47% cov
    • Longitud de alineación
      1.156 bp
    • Cadena de CIGAR
      131MD4MI160MN288MN76MN5MN176MN65MN14MN2MN200MN24M desajustes: 9 - inserciones: 1 - eliminaciones: 1
  • Physaria lindheimeri

    Physaria lindheimeri

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:146141440
      EF432246
    • Longitud del golpe
      1.152 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.587,4 bits
    • Similitud
      91,55%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      EF432246
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.160 bp
  • Camelina hispida

    Camelina hispida

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:306976239
      GU929426
    • Longitud del golpe
      1.155 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.175,6 bits
    • Similitud
      85,24%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      GU929426
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.172 bp
  • Arabidopsis thaliana

    Arabidopsis thaliana

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:21403255
      AY084545
      1 de 11 aciertos reportados para Arabidopsis thaliana.
    • Longitud del golpe
      1.451 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.146 bits
    • Similitud
      84,77%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      AY084545
      79,39% cov
    • Longitud de alineación
      1.169 bp
  • Camelina rumelica

    Camelina rumelica

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:306976249
      GU929438
    • Longitud del golpe
      1.155 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.142,3 bits
    • Similitud
      84,74%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      GU929438
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.173 bp
  • Camelina microcarpa

    Camelina microcarpa

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:306976247
      GU929434
    • Longitud del golpe
      1.155 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.136,8 bits
    • Similitud
      84,69%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      GU929434
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.176 bp
  • Camelina sativa

    Camelina sativa

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:306976233
      GU929419
      1 de 4 aciertos reportados para Camelina sativa.
    • Longitud del golpe
      2.725 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.136,8 bits
    • Similitud
      84,69%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      GU929419
      42,39% cov
    • Longitud de alineación
      1.176 bp
  • Camelina laxa

    Camelina laxa

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:306976241
      GU929429
    • Longitud del golpe
      1.158 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.127,6 bits
    • Similitud
      85,06%
    • Cobertura
      97,14%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 2
      97,14% cov
      GU929429
      96,63% cov
    • Longitud de alineación
      1.138 bp
  • Arabidopsis lyrata

    Arabidopsis lyrata

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:306976237
      GU929424
    • Longitud del golpe
      1.152 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.122 bits
    • Similitud
      84,46%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      GU929424
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.171 bp
  • Arabidopsis lyrata subsp. lyrata

    Arabidopsis lyrata subsp. lyrata

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:297834001
      XM_002884837
    • Longitud del golpe
      1.566 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.116,5 bits
    • Similitud
      84,37%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      XM_002884837
      73,56% cov
    • Longitud de alineación
      1.171 bp
Ocurrencia
16 veces en PatSeqDB
Herramientas
Buscador de PatSeq
NÚMERO DE ID DE SEC
3
Longitud
1.152
Tipo
nucleotide
Ubicaciones
Detailed Description, Summary

Organismo declarado:
Physaria lindheimeri

Organismo determinado:
  • Physaria lindheimeri

    Physaria lindheimeri

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:146141440
      EF432246
    • Longitud del golpe
      1.152 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      2.062 bits
    • Similitud
      98,96%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 3
      100% cov
      EF432246
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.152 bp
    • Cadena de CIGAR
      344MN51MN31MN152MN35MN50MN91MN3MN13MN129MN50MN167MN24M desajustes: 12 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • Physaria fendleri

    Physaria fendleri

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:228481016
      FJ904269
      1 de 4 aciertos reportados para Physaria fendleri.
    • Longitud del golpe
      1.330 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.637,3 bits
    • Similitud
      92,32%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 3
      100% cov
      FJ904269
      86,84% cov
    • Longitud de alineación
      1.159 bp
    • Cadena de CIGAR
      47MI4MD12MN6MN3MN23MN7MI2MD14MN12MN14MN11MN16MN5MN18MN5MN11MN8MN18MNMN45MNMN29MN5MN15MN23MN5MN4MN2MN3MN19MN2MN18MN4MN8MN7MN24MN23MN28MNMN9MN3MN6MN7MN5MN5MN11MN12MD2MI29MN8MN5MN2MN11MN5MN9MN46MN3MN2MN10MN20MN5MNMNMN2MN52MN29MN14M2N25MN20MN32MI3MD5MN50MN2MN2MN8MN14MN11MN18MN18MN6MN3M2NIM2I11MN24M desajustes: 78 - inserciones: 7 - eliminaciones: 4
  • Arabidopsis thaliana

    Arabidopsis thaliana

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:21403255
      AY084545
      1 de 12 aciertos reportados para Arabidopsis thaliana.
    • Longitud del golpe
      1.451 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.083,3 bits
    • Similitud
      83,8%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 3
      100% cov
      AY084545
      79,39% cov
    • Longitud de alineación
      1.167 bp
  • Arabidopsis lyrata subsp. lyrata

    Arabidopsis lyrata subsp. lyrata

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:297834001
      XM_002884837
      1 de 2 aciertos reportados para Arabidopsis lyrata subsp. lyrata.
    • Longitud del golpe
      1.566 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.064,8 bits
    • Similitud
      83,56%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 3
      100% cov
      XM_002884837
      73,56% cov
    • Longitud de alineación
      1.168 bp
  • Arabidopsis lyrata

    Arabidopsis lyrata

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:306976237
      GU929424
    • Longitud del golpe
      1.152 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.064,8 bits
    • Similitud
      83,56%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 3
      100% cov
      GU929424
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.168 bp
  • Capsella rubella

    Capsella rubella

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:306976235
      GU929423
    • Longitud del golpe
      1.152 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.048,2 bits
    • Similitud
      83,35%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 3
      100% cov
      GU929423
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.171 bp
  • Descurainia sophia

    Descurainia sophia

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:315936310
      EF524190
    • Longitud del golpe
      1.152 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      992,8 bits
    • Similitud
      82,51%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 3
      100% cov
      EF524190
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.172 bp
  • Rorippa indica

    Rorippa indica

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:102230696
      DQ518318
      1 de 2 aciertos reportados para Rorippa indica.
    • Longitud del golpe
      780 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      669,6 bits
    • Similitud
      82,47%
    • Cobertura
      67,8%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 3
      67,8% cov
      DQ518318
      99,74% cov
    • Longitud de alineación
      793 bp
Ocurrencia
16 veces en PatSeqDB
Herramientas
Buscador de PatSeq
NÚMERO DE ID DE SEC
4
Longitud
1.155
Tipo
nucleotide
Ubicaciones
Detailed Description, Summary

Organismo declarado:
Lesquerella gracilis A

Organismo determinado:
  • Physaria lindheimeri

    Physaria lindheimeri

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:146141440
      EF432246
    • Longitud del golpe
      1.152 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.725,9 bits
    • Similitud
      93,69%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 4
      100% cov
      EF432246
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.156 bp
    • Cadena de CIGAR
      26MN11MN15MN16MN3MN23MN7MD2MI14MN27MN8MN2MN12MN5MN25MN2MN11MN5MN9MN6MN4MNMN18MN58MN5MN5MN39MN10MN23MN8MN9MN4MN8MN7MN15MN5MN26MN2MN56MN5MN30MN22MN5MN2MN16MN6MN68MN3MN24MN3MN2MN2MN5MN3MN2MNMN2MN11MN2MN62MN15MN76M2N91MN11MN5MN12MN29M2NDM2D11MN24M desajustes: 68 - inserciones: 1 - eliminaciones: 4
  • Physaria fendleri

    Physaria fendleri

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:228481016
      FJ904269
      1 de 3 aciertos reportados para Physaria fendleri.
    • Longitud del golpe
      1.330 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.724 bits
    • Similitud
      93,61%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 4
      100% cov
      FJ904269
      86,84% cov
    • Longitud de alineación
      1.158 bp
    • Cadena de CIGAR
      26MN11MN8MI4MD2MN9MN59MN12MN14MN8MN15MN3MI2MD3MN18MN2MN20MN2MN6MN6MN6MN18MN26MNMN51MN23MN10MN2MN2MN20MN35MN23MN5MN2MN26MN25MNMN9MN3MN6MN31MN14MN8MN11MN5MN11MN5MNM2N5MN11MN9MN53MN10MN17MN17MN2MN11MN2MN32MN44MN47MN30MNMI3MD5MN50MN2MN2MN8MN32MN31MN6MN20MN24M desajustes: 68 - inserciones: 3 - eliminaciones: 3
  • Camelina hispida

    Camelina hispida

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:306976239
      GU929426
    • Longitud del golpe
      1.155 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.149,7 bits
    • Similitud
      85,36%
    • Cobertura
      97,14%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 4
      97,14% cov
      GU929426
      96,88% cov
    • Longitud de alineación
      1.134 bp
  • Camelina rumelica

    Camelina rumelica

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:306976249
      GU929438
    • Longitud del golpe
      1.155 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.122 bits
    • Similitud
      84,92%
    • Cobertura
      97,14%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 4
      97,14% cov
      GU929438
      96,88% cov
    • Longitud de alineación
      1.134 bp
  • Camelina sativa

    Camelina sativa

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:306976231
      GU929418
      1 de 5 aciertos reportados para Camelina sativa.
    • Longitud del golpe
      3.875 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.122 bits
    • Similitud
      84,96%
    • Cobertura
      97,14%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 4
      97,14% cov
      GU929418
      28,88% cov
    • Longitud de alineación
      1.137 bp
  • Arabidopsis thaliana

    Arabidopsis thaliana

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:21403255
      AY084545
      1 de 11 aciertos reportados para Arabidopsis thaliana.
    • Longitud del golpe
      1.451 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.118,3 bits
    • Similitud
      84,32%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 4
      100% cov
      AY084545
      79,39% cov
    • Longitud de alineación
      1.167 bp
  • Camelina laxa

    Camelina laxa

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:306976241
      GU929429
    • Longitud del golpe
      1.158 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.111 bits
    • Similitud
      84,76%
    • Cobertura
      97,14%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 4
      97,14% cov
      GU929429
      96,63% cov
    • Longitud de alineación
      1.135 bp
  • Camelina microcarpa

    Camelina microcarpa

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:306976243
      GU929432
      1 de 2 aciertos reportados para Camelina microcarpa.
    • Longitud del golpe
      1.155 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.099,9 bits
    • Similitud
      84,61%
    • Cobertura
      97,14%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 4
      97,14% cov
      GU929432
      96,88% cov
    • Longitud de alineación
      1.137 bp
Ocurrencia
16 veces en PatSeqDB
Herramientas
Buscador de PatSeq
NÚMERO DE ID DE SEC
5
Longitud
1.155
Tipo
nucleotide
Ubicaciones
Detailed Description, Summary

Organismo declarado:
Lesquerella gracilis B

Organismo determinado:
  • Physaria fendleri

    Physaria fendleri

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:3452128
      AF016103
      1 de 3 aciertos reportados para Physaria fendleri.
    • Longitud del golpe
      3.670 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      2.017,7 bits
    • Similitud
      98,18%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      AF016103
      31,47% cov
    • Longitud de alineación
      1.157 bp
    • Cadena de CIGAR
      32MN98MD6MI153MN4MN12MN44MN34MN166MN105MN5MN80MN95MN59MN5MN14MN2MN32MI3MD71MN26MN90M desajustes: 17 - inserciones: 2 - eliminaciones: 2
  • Physaria lindheimeri

    Physaria lindheimeri

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:146141440
      EF432246
    • Longitud del golpe
      1.152 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.592,9 bits
    • Similitud
      91,63%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      EF432246
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.159 bp
  • Arabidopsis thaliana

    Arabidopsis thaliana

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:21403255
      AY084545
      1 de 11 aciertos reportados para Arabidopsis thaliana.
    • Longitud del golpe
      1.451 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.162,7 bits
    • Similitud
      85,02%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      AY084545
      79,39% cov
    • Longitud de alineación
      1.168 bp
  • Camelina sativa

    Camelina sativa

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:315435717
      HQ008322
    • Longitud del golpe
      2.755 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.142,3 bits
    • Similitud
      84,74%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      HQ008322
      41,92% cov
    • Longitud de alineación
      1.173 bp
  • Camelina laxa

    Camelina laxa

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:306976241
      GU929429
    • Longitud del golpe
      1.158 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.136,8 bits
    • Similitud
      85,15%
    • Cobertura
      97,32%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 5
      97,32% cov
      GU929429
      96,8% cov
    • Longitud de alineación
      1.138 bp
  • Arabidopsis lyrata subsp. lyrata

    Arabidopsis lyrata subsp. lyrata

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:297834001
      XM_002884837
      1 de 2 aciertos reportados para Arabidopsis lyrata subsp. lyrata.
    • Longitud del golpe
      1.566 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.133,1 bits
    • Similitud
      84,6%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      XM_002884837
      73,56% cov
    • Longitud de alineación
      1.169 bp
  • Arabidopsis lyrata

    Arabidopsis lyrata

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:306976237
      GU929424
    • Longitud del golpe
      1.152 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.133,1 bits
    • Similitud
      84,6%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      GU929424
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.169 bp
  • Camelina rumelica

    Camelina rumelica

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:306976251
      GU929439
    • Longitud del golpe
      1.155 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.125,7 bits
    • Similitud
      84,5%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      GU929439
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.174 bp
  • Camelina microcarpa

    Camelina microcarpa

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:306976245
      GU929433
    • Longitud del golpe
      1.158 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.105,4 bits
    • Similitud
      84,17%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      GU929433
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.175 bp
  • Capsella rubella

    Capsella rubella

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:306976235
      GU929423
    • Longitud del golpe
      1.152 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.105,4 bits
    • Similitud
      84,15%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      GU929423
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.167 bp
  • Brassica juncea

    Brassica juncea

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:299929219
      HM138373
    • Longitud del golpe
      2.734 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      780,4 bits
    • Similitud
      79,23%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      HM138373
      42,17% cov
    • Longitud de alineación
      1.175 bp
Ocurrencia
16 veces en PatSeqDB
Herramientas
Buscador de PatSeq
NÚMERO DE ID DE SEC
6
Longitud
1.125
Tipo
nucleotide
Ubicaciones
Detailed Description, Summary

Organismo declarado:
Crepis biennis

Organismo determinado:
  • Crepis palaestina

    Crepis palaestina

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:3135017
      Y16283
    • Longitud del golpe
      1.358 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.568,9 bits
    • Similitud
      91,84%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      Y16283
      82,84% cov
    • Longitud de alineación
      1.127 bp
    • Cadena de CIGAR
      9M2N3MNMN6MN6MN25MN12MN7MN2MN5MN2MN30MN7MN5MN14MN5MN36MNMNMN6MN2MNMN3MN3MN2M2N22MN23MN10MN14MN2MN5MN18MNMN2MD2MI4MN22M2N31MN7MN19MN13MN2MN46MN2MN21MN8MN5MN3MN2MN58MN47MN23MN14MN8MN32MN11MN5MN5MN15MNM2N14MN8MNMN5MNMN24MN11MN29MN26MN3MN34MN12MN28MD4MI19M2N5MNMN7MN12MN14MN6MN12MN2MN3MN28MN9MN8MN12M desajustes: 88 - inserciones: 2 - eliminaciones: 2
  • Crepis alpina

    Crepis alpina

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:83272390
      DQ289485
      1 de 2 aciertos reportados para Crepis alpina.
    • Longitud del golpe
      1.131 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.277,2 bits
    • Similitud
      87,49%
    • Cobertura
      98,93%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 6
      98,93% cov
      DQ289485
      98,67% cov
    • Longitud de alineación
      1.127 bp
    • Cadena de CIGAR
      12H4MN6MN2MN3MN5MNM2N16MN8M3D7MIN2MDMN6MNMN27MN10MN8MN8M2N4MN6MI2MD5MN26MN5MN17MN12MNMN41MN2MN6MN2MN7MN20MN5MN5MN26M2N7MN6MNMN14MN11MN8MN16MN3MIMNMD2MN17MN2MN9MN5MN8MI2MD6MN4MN3MN4MN5MN8MIMD5MD2MI4M2N11MN2MN3MN10MN2MN20MN2MN14MN17MN8MN2MN23MN24MN4MN3MN5MN4MN6M2N6MN2MN2MN6MN4MN2MN2MN3MN4MIMNMND7MN4MNMN16MN19MN5MDMI11MN3MN14MN10MN6MN23MN10M2N25MN9MN31MN20MN3MN2MNMN7MN5MN19MN8MN25MNMN12MNM2IM2N2MNM3IMN4MI13MN7MN3M desajustes: 116 - inserciones: 14 - eliminaciones: 11
  • Helianthus annuus

    Helianthus annuus

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:31322134
      AY166773
      1 de 2 aciertos reportados para Helianthus annuus.
    • Longitud del golpe
      1.419 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      758,2 bits
    • Similitud
      79,82%
    • Cobertura
      95,82%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 6
      95,82% cov
      AY166773
      76,18% cov
    • Longitud de alineación
      1.105 bp
Ocurrencia
16 veces en PatSeqDB
Herramientas
Buscador de PatSeq
NÚMERO DE ID DE SEC
7
Longitud
1.152
Tipo
nucleotide
Ubicaciones
Detailed Description, Summary

Organismo declarado:
Ricinus communis

Organismo determinado:
  • Ricinus communis

    Ricinus communis

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:255574427
      XM_002528081
      1 de 3 aciertos reportados para Ricinus communis.
    • Longitud del golpe
      1.897 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.919,8 bits
    • Similitud
      98,97%
    • Cobertura
      93,06%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 7
      93,06% cov
      XM_002528081
      56,51% cov
    • Longitud de alineación
      1.072 bp
    • Cadena de CIGAR
      80H3MN2MN6MNM2NMN2MN2MN2MN4MN912MN126M desajustes: 11 - inserciones: 0 - eliminaciones: 0
  • Caragana korshinskii

    Caragana korshinskii

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:168014137
      EU433557
    • Longitud del golpe
      1.143 bp
    • Valor E
      1,03E-119
    • Puntuación BLAST
      440,6 bits
    • Similitud
      75,25%
    • Cobertura
      90,19%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 7
      90,19% cov
      EU433557
      90,9% cov
    • Longitud de alineación
      1.079 bp
  • Gossypium hirsutum

    Gossypium hirsutum

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:310657310
      HQ259410
      1 de 2 aciertos reportados para Gossypium hirsutum.
    • Longitud del golpe
      1.362 bp
    • Valor E
      3E-90
    • Puntuación BLAST
      342,8 bits
    • Similitud
      75,03%
    • Cobertura
      73,61%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 7
      73,61% cov
      HQ259410
      62,26% cov
    • Longitud de alineación
      885 bp
Ocurrencia
16 veces en PatSeqDB
Herramientas
Buscador de PatSeq
NÚMERO DE ID DE SEC
8
Longitud
1.155
Tipo
nucleotide
Ubicaciones
Detailed Description, Summary

Organismo declarado:
Physaria fendleri

Organismo determinado:
  • Physaria fendleri

    Physaria fendleri

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:3452128
      AF016103
      1 de 3 aciertos reportados para Physaria fendleri.
    • Longitud del golpe
      3.670 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.929 bits
    • Similitud
      96,81%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      AF016103
      31,47% cov
    • Longitud de alineación
      1.160 bp
    • Cadena de CIGAR
      8MN11M3N4MI2MDNMN14MN5MN2MDMI2MDMI3MN4MDMI2MN2MN8MN2MN3MNMN2M3N30MD4MI160MN288MN76MN5MN176MN65MN14MN2MN200MN24M desajustes: 27 - inserciones: 5 - eliminaciones: 5
  • Physaria lindheimeri

    Physaria lindheimeri

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:146141440
      EF432246
    • Longitud del golpe
      1.152 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.476,6 bits
    • Similitud
      89,86%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      EF432246
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.164 bp
  • Arabidopsis thaliana

    Arabidopsis thaliana

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:21403255
      AY084545
      1 de 11 aciertos reportados para Arabidopsis thaliana.
    • Longitud del golpe
      1.451 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.290,1 bits
    • Similitud
      86,95%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      AY084545
      79,39% cov
    • Longitud de alineación
      1.165 bp
  • Arabidopsis lyrata

    Arabidopsis lyrata

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:306976237
      GU929424
    • Longitud del golpe
      1.152 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.255 bits
    • Similitud
      86,47%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      GU929424
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.168 bp
  • Arabidopsis lyrata subsp. lyrata

    Arabidopsis lyrata subsp. lyrata

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:297834001
      XM_002884837
    • Longitud del golpe
      1.566 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.249,5 bits
    • Similitud
      86,39%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      XM_002884837
      73,56% cov
    • Longitud de alineación
      1.168 bp
  • Camelina hispida

    Camelina hispida

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:306976239
      GU929426
    • Longitud del golpe
      1.155 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.247,6 bits
    • Similitud
      86,31%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      GU929426
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.169 bp
  • Camelina rumelica

    Camelina rumelica

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:306976249
      GU929438
    • Longitud del golpe
      1.155 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.208,8 bits
    • Similitud
      85,74%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      GU929438
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.171 bp
  • Camelina microcarpa

    Camelina microcarpa

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:306976247
      GU929434
    • Longitud del golpe
      1.155 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.203,3 bits
    • Similitud
      85,68%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      GU929434
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.173 bp
  • Camelina sativa

    Camelina sativa

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:306976233
      GU929419
      1 de 4 aciertos reportados para Camelina sativa.
    • Longitud del golpe
      2.725 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.203,3 bits
    • Similitud
      85,68%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      GU929419
      42,39% cov
    • Longitud de alineación
      1.173 bp
Ocurrencia
16 veces en PatSeqDB
Herramientas
Buscador de PatSeq
NÚMERO DE ID DE SEC
9
Longitud
1.152
Tipo
nucleotide
Ubicaciones
Detailed Description, Summary

Organismo declarado:
Physaria lindheimeri

Organismo determinado:
  • Physaria lindheimeri

    Physaria lindheimeri

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:146141440
      EF432246
    • Longitud del golpe
      1.152 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.917,9 bits
    • Similitud
      96,72%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      EF432246
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.157 bp
    • Cadena de CIGAR
      8MN11M3N4MI2MDNMN14MD6MI2MDMI2MDMN3MI4MN3MIMDMN8MN2MN3MNMN2M3N243MN51MN31MN152MN35MN50MN91MN3MN13MN129MN50MN167MN24M desajustes: 28 - inserciones: 5 - eliminaciones: 5
  • Physaria fendleri

    Physaria fendleri

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:228481016
      FJ904269
      1 de 3 aciertos reportados para Physaria fendleri.
    • Longitud del golpe
      1.330 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.526,5 bits
    • Similitud
      90,62%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      FJ904269
      86,84% cov
    • Longitud de alineación
      1.162 bp
    • Cadena de CIGAR
      8MN11M3N4MI2MDNMN14MN5MN2MDMI2MDMI3MN4MDMI2MN2MN8MN2MN3MNMN2M3N6MI2MD14MN12MN14MN11MN16MN5MN18MN5MN11MN8MN18MNMN45MNMN29MN5MN15MN23MN5MN4MN2MN3MN19MN2MN18MN4MN8MN7MN24MN23MN28MNMN9MN3MN6MN7MN5MN5MN11MN12MD2MI29MN8MN5MN2MN11MN5MN9MN46MN3MN2MN10MN20MN5MNMNMN2MN52MN29MN14M2N25MN20MN32MI3MD5MN50MN2MN2MN8MN14MN11MN18MN18MN6MN3M2NIM2I11MN24M desajustes: 92 - inserciones: 10 - eliminaciones: 7
  • Arabidopsis thaliana

    Arabidopsis thaliana

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:21403255
      AY084545
      1 de 11 aciertos reportados para Arabidopsis thaliana.
    • Longitud del golpe
      1.451 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.227,3 bits
    • Similitud
      85,97%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      AY084545
      79,39% cov
    • Longitud de alineación
      1.162 bp
  • Arabidopsis lyrata subsp. lyrata

    Arabidopsis lyrata subsp. lyrata

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:297834001
      XM_002884837
      1 de 2 aciertos reportados para Arabidopsis lyrata subsp. lyrata.
    • Longitud del golpe
      1.566 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.203,3 bits
    • Similitud
      85,64%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      XM_002884837
      73,56% cov
    • Longitud de alineación
      1.163 bp
  • Arabidopsis lyrata

    Arabidopsis lyrata

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:306976237
      GU929424
    • Longitud del golpe
      1.152 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.203,3 bits
    • Similitud
      85,64%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      GU929424
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.163 bp
  • Camelina microcarpa

    Camelina microcarpa

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:306976247
      GU929434
      1 de 2 aciertos reportados para Camelina microcarpa.
    • Longitud del golpe
      1.155 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.144,2 bits
    • Similitud
      84,83%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      GU929434
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.173 bp
  • Camelina sativa

    Camelina sativa

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:306976233
      GU929419
      1 de 2 aciertos reportados para Camelina sativa.
    • Longitud del golpe
      2.725 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.144,2 bits
    • Similitud
      84,83%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      GU929419
      42,39% cov
    • Longitud de alineación
      1.173 bp
  • Capsella rubella

    Capsella rubella

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:306976235
      GU929423
    • Longitud del golpe
      1.152 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.136,8 bits
    • Similitud
      84,66%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      GU929423
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.167 bp
  • Camelina rumelica

    Camelina rumelica

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:306976251
      GU929439
    • Longitud del golpe
      1.155 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.105,4 bits
    • Similitud
      84,19%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      GU929439
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.170 bp
  • Descurainia sophia

    Descurainia sophia

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:315936310
      EF524190
    • Longitud del golpe
      1.152 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.098 bits
    • Similitud
      84,06%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      EF524190
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.167 bp
Ocurrencia
16 veces en PatSeqDB
Herramientas
Buscador de PatSeq
NÚMERO DE ID DE SEC
10
Longitud
1.155
Tipo
nucleotide
Ubicaciones
Detailed Description, Summary

Organismo declarado:
Lesquerella gracilis A

Organismo determinado:
  • Physaria lindheimeri

    Physaria lindheimeri

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:146141440
      EF432246
    • Longitud del golpe
      1.152 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.615,1 bits
    • Similitud
      91,99%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      EF432246
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.161 bp
    • Cadena de CIGAR
      8MN11M3N4MI2MDNMN14MD6MI2MDMI2MDMN3MI4MN3MIMDMN8MN2MN3MNMN2M3N6MD2MI14MN27MN8MN2MN12MN5MN25MN2MN11MN5MN9MN6MN4MNMN18MN58MN5MN5MN39MN10MN23MN8MN9MN4MN8MN7MN15MN5MN26MN2MN56MN5MN30MN22MN5MN2MN16MN6MN68MN3MN24MN3MN2MN2MN5MN3MN2MNMN2MN11MN2MN62MN15MN76M2N91MN11MN5MN12MN29M2NDM2D11MN24M desajustes: 78 - inserciones: 6 - eliminaciones: 9
  • Physaria fendleri

    Physaria fendleri

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:228481016
      FJ904269
      1 de 3 aciertos reportados para Physaria fendleri.
    • Longitud del golpe
      1.330 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.613,2 bits
    • Similitud
      91,9%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      FJ904269
      86,84% cov
    • Longitud de alineación
      1.161 bp
    • Cadena de CIGAR
      8MN11M3N4MI2MDNMN14MN5MN2MDMI2MDMI3MN4MDMI2MN2MN8MN2MN3MNMN2M3N23MN12MN14MN8MN15MN3MI2MD3MN18MN2MN20MN2MN6MN6MN6MN18MN26MNMN51MN23MN10MN2MN2MN20MN35MN23MN5MN2MN26MN25MNMN9MN3MN6MN31MN14MN8MN11MN5MN11MN5MNM2N5MN11MN9MN53MN10MN17MN17MN2MN11MN2MN32MN44MN47MN30MNMI3MD5MN50MN2MN2MN8MN32MN31MN6MN20MN24M desajustes: 82 - inserciones: 6 - eliminaciones: 6
  • Arabidopsis thaliana

    Arabidopsis thaliana

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:21403255
      AY084545
      1 de 11 aciertos reportados para Arabidopsis thaliana.
    • Longitud del golpe
      1.451 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.279 bits
    • Similitud
      86,75%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      AY084545
      79,39% cov
    • Longitud de alineación
      1.162 bp
  • Arabidopsis lyrata subsp. lyrata

    Arabidopsis lyrata subsp. lyrata

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:297834001
      XM_002884837
      1 de 2 aciertos reportados para Arabidopsis lyrata subsp. lyrata.
    • Longitud del golpe
      1.566 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.243,9 bits
    • Similitud
      86,24%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      XM_002884837
      73,56% cov
    • Longitud de alineación
      1.163 bp
  • Arabidopsis lyrata

    Arabidopsis lyrata

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:306976237
      GU929424
    • Longitud del golpe
      1.152 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.243,9 bits
    • Similitud
      86,24%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      GU929424
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.163 bp
  • Camelina hispida

    Camelina hispida

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:306976239
      GU929426
    • Longitud del golpe
      1.155 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.236,5 bits
    • Similitud
      86,11%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      GU929426
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.166 bp
  • Camelina rumelica

    Camelina rumelica

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:306976249
      GU929438
    • Longitud del golpe
      1.155 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.208,8 bits
    • Similitud
      85,69%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      GU929438
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.167 bp
  • Camelina sativa

    Camelina sativa

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:306976231
      GU929418
      1 de 4 aciertos reportados para Camelina sativa.
    • Longitud del golpe
      3.875 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.203,3 bits
    • Similitud
      85,63%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      GU929418
      29,81% cov
    • Longitud de alineación
      1.169 bp
  • Camelina microcarpa

    Camelina microcarpa

    • Coincidencia de base de datos pública
      GI:306976247
      GU929434
    • Longitud del golpe
      1.155 bp
    • Valor E
      0E0
    • Puntuación BLAST
      1.192,2 bits
    • Similitud
      85,52%
    • Cobertura
      100%
    • Alineación (esquema)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      GU929434
      100% cov
    • Longitud de alineación
      1.174 bp
Ocurrencia
16 veces en PatSeqDB
Herramientas
Buscador de PatSeq

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