Загрузка...

поиск биологических последовательностей, раскрытых в патентах

Discover Patseq Finder: поиск и анализ аналогичных совпадений последовательностей в базе данных Lens Patseq без усилий с использованием Patseq Finder. Сканирование 480m+ биологические последовательности, раскрытые в патентах на платформу, затраченной на конфиденциальность, и придают вашей стратегии IP преимущество.

view patseq Увольнять
Данные получены из: DDBJ Pat NCBI GenBank EMBL-EBI Pat USPTO Fulltext
12 последовательностей, найденных в этом патенте (всего)

Отображение 1 - 10 из 12 последовательностей

SEQ ID NO
Длина
Тип
Местоположения
Organisms
Вхождение
Инструменты
SEQ ID NO
1
Длина
2 068
Тип
DNA
Местоположения
Detailed Description

Объявленный организм:
not provided

Определенный организм:
  • Homo sapiens

    Homo sapiens

    • Общедоступная БД
      GI:1458109
      U62431
      1 из 5 попадания зарегистрированы для Homo sapiens.
    • Длина попадания
      2 664 bp
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      3 762,7 биты
    • Сходство
      99,47%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 1
      100% cov
      U62431
      77,67% cov
    • Длина выравнивания
      2 072 bp
    • Строка СИГАРЫ
      47MI2MD564M3IM2N601MN776MN23MD25MD22M несоответствия: 4 - вставки: 4 - удаления: 3
  • Pongo abelii

    Pongo abelii

    • Общедоступная БД
      GI:297682551
      XM_002818935
    • Длина попадания
      2 391 bp
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      3 011,2 биты
    • Сходство
      97,51%
    • Покрытие
      85,06%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 1
      85,06% cov
      XM_002818935
      73,69% cov
    • Длина выравнивания
      1 764 bp
    • Строка СИГАРЫ
      24H4MN3MN14MI2MD23MN84MN13MN31MN62MN19MN2MN41MN3MN55MN35MN173MN11M3IM2N201MN13MN15MN50MN29MN8MN14MN152MN68MN42MN33MN67MN14MI4MD51MN16MN95MN50MN21MN38MN29MN121MN7MN6M285H несоответствия: 37 - вставки: 5 - удаления: 2
  • Nomascus leucogenys

    Nomascus leucogenys

    • Общедоступная БД
      GI:332247608
      XM_003272904
      1 из 2 попадания зарегистрированы для Nomascus leucogenys.
    • Длина попадания
      2 242 bp
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      2 959,5 биты
    • Сходство
      96,79%
    • Покрытие
      85,59%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 1
      85,59% cov
      XM_003272904
      79,08% cov
    • Длина выравнивания
      1 774 bp
    • Строка СИГАРЫ
      13H6MN12MN14MI2MD14MN8MN36MN78MN4MN141MN55MN26MN8MN107MN56MN8MN11M3IM2N201MN47MN29MN32MN80MN44MN50MN92MN18MN22MN8MNMN67MN12MN5MN18MN20MN2MN8MN5MN49M2N38MN30MN2MN33MN21MN14MN23MN20MN8MN14MN68MN3MN29MN3MN14M285H несоответствия: 52 - вставки: 4 - удаления: 1
  • Pan troglodytes

    Pan troglodytes

    • Общедоступная БД
      GI:76677946
      NM_001033935
    • Длина попадания
      1 590 bp
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      2 839,4 биты
    • Сходство
      98,93%
    • Покрытие
      76,64%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 1
      76,64% cov
      NM_001033935
      99,87% cov
    • Длина выравнивания
      1 588 bp
    • Строка СИГАРЫ
      165H263MN164MN20M3IM2N96MN225MN95MN154MN27MN47MN53MN21MN273MN113MN19M318H несоответствия: 14 - вставки: 3 - удаления: 0
  • Macaca mulatta

    Macaca mulatta

    • Общедоступная БД
      GI:297299132
      XM_001109335
      1 из 2 попадания зарегистрированы для Macaca mulatta.
    • Длина попадания
      2 127 bp
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      2 660,3 биты
    • Сходство
      95,65%
    • Покрытие
      79,93%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 1
      79,93% cov
      XM_001109335
      77,86% cov
    • Длина выравнивания
      1 656 bp
    • Строка СИГАРЫ
      130H28MN18MN6MN24MN41MN32MN23MN14MN2MN6MN2MN91MN26MN83MN5MN5MN12MN37MN11M3IM2N147MN53MN29MN11MN38MN5MN14MN2MN14MN17MN17MN14MN20MN23MN29MN14MN26MN74MN36MN33MN59M2N3MN2MN18MNMN7MN17MN10MN4MN49MN11MN6MN40MN2MN24MN25MN7MN21MN2MN26MN8MN29MN2MN11MN68MN3MN30MN2MN14M285H несоответствия: 69 - вставки: 3 - удаления: 0
  • Callithrix jacchus

    Callithrix jacchus

    • Общедоступная БД
      GI:296221689
      XM_002756815
      1 из 2 попадания зарегистрированы для Callithrix jacchus.
    • Длина попадания
      1 590 bp
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      2 377,8 биты
    • Сходство
      93,66%
    • Покрытие
      76,74%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 1
      76,74% cov
      XM_002756815
      100% cov
    • Длина выравнивания
      1 593 bp
    • Строка СИГАРЫ
      165H19MNMI2MDN9M2N5MN22MN21MN2MNMN7MN10MNMN6MN14MN14MN5MN5MN2MN3MN2MN28MN26MN11MN2MN2MN8MN8MN26MN32MN11MN11MN3MN22MN5MN14MN3MN10MN17MN8MN11M3IM2N147MN11MN2MN38MN11MN14MN26MN23MN35MN5MN71MN44MN8MN2MN11MN12MN13MN38MN53MN11MN2MN3MN33MN7MN7MN46MDMI3MN18MNMN14MNMN19MN3MN8MN6MI3MD13MN15MNMN11M2N10MN20MN11MN2MN50MN2MN44MN14MN38MN2MN47MN14MN8MN30M316H несоответствия: 92 - вставки: 6 - удаления: 3
  • Saimiri boliviensis

    Saimiri boliviensis

    • Общедоступная БД
      GI:56122235
      AY665231
    • Длина попадания
      1 542 bp
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      2 300,2 биты
    • Сходство
      93,53%
    • Покрытие
      74,42%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 1
      74,42% cov
      AY665231
      100% cov
    • Длина выравнивания
      1 545 bp
    • Строка СИГАРЫ
      165H19MNMI2MDN10MN11MN9MN6MN21MN4MN2MN4MN10MNMN6MN14MN5MN2MN17MN2MN3MN2MN55MN11MN2MN11MN8MN2MN23MN17MN14MN11MN5MN5MN3MN19MN2MN5MN14MN3MN10MN17MN8MN11M3IM2N147MN11MN2MN38MN11MN120MN4MN53MN53MN2MN11MN26MN11MN26MN65MN2MN3MNMN31MN6M2N55MN3MN13MI5MDMN16MN19MN3MN7M2N6MI3MD10MN32M2N10M2N7MN12M2N12MN9MN13MN22MN6MN29MN14MN14MN38MN2MN47MN6M364H несоответствия: 91 - вставки: 6 - удаления: 3
Вхождение
5 количество раз в PatSeqDB
Инструменты
Поиск Patseqfinder
SEQ ID NO
2
Длина
528
Тип
peptide
Местоположения
Detailed Description

Объявленный организм:
not provided

Определенный организм:
  • Homo sapiens

    Homo sapiens

    • Общедоступная БД
      GI:1458110
      AAB40109
      1 из 4 попадания зарегистрированы для Homo sapiens.
    • Длина попадания
      529 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      1 020,8 биты
    • Сходство
      99,24%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      AAB40109
      100% cov
    • Длина выравнивания
      529 aa
    • Строка СИГАРЫ
      149M2NI200MN176M несоответствия: 3 - вставки: 1 - удаления: 0
  • Pan troglodytes

    Pan troglodytes

    • Общедоступная БД
      GI:76677947
      NP_001029107
    • Длина попадания
      529 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      1 012,7 биты
    • Сходство
      98,87%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      NP_001029107
      100% cov
    • Длина выравнивания
      529 aa
  • Pongo abelii

    Pongo abelii

    • Общедоступная БД
      GI:297682552
      XP_002818981
    • Длина попадания
      529 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      1 002,7 биты
    • Сходство
      97,16%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      XP_002818981
      100% cov
    • Длина выравнивания
      529 aa
  • Nomascus leucogenys

    Nomascus leucogenys

    • Общедоступная БД
      GI:332247609
      XP_003272952
      1 из 2 попадания зарегистрированы для Nomascus leucogenys.
    • Длина попадания
      529 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      1 001,5 биты
    • Сходство
      97,92%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      XP_003272952
      100% cov
    • Длина выравнивания
      529 aa
  • Macaca mulatta

    Macaca mulatta

    • Общедоступная БД
      GI:109085980
      XP_001109335
      1 из 2 попадания зарегистрированы для Macaca mulatta.
    • Длина попадания
      529 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      1 000 биты
    • Сходство
      97,35%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      XP_001109335
      100% cov
    • Длина выравнивания
      529 aa
  • Callithrix jacchus

    Callithrix jacchus

    • Общедоступная БД
      GI:296221690
      XP_002756861
      1 из 2 попадания зарегистрированы для Callithrix jacchus.
    • Длина попадания
      529 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      993,8 биты
    • Сходство
      96,79%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      XP_002756861
      100% cov
    • Длина выравнивания
      529 aa
  • Saimiri boliviensis

    Saimiri boliviensis

    • Общедоступная БД
      GI:56122236
      AAV74269
    • Длина попадания
      514 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      948,7 биты
    • Сходство
      96,11%
    • Покрытие
      97,16%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 2
      97,16% cov
      AAV74269
      100% cov
    • Длина выравнивания
      514 aa
  • Ailuropoda melanoleuca

    Ailuropoda melanoleuca

    • Общедоступная БД
      GI:301757232
      XP_002914481
    • Длина попадания
      505 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      849 биты
    • Сходство
      86,77%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      XP_002914481
      100% cov
    • Длина выравнивания
      529 aa
  • Canis lupus familiaris

    Canis lupus familiaris

    • Общедоступная БД
      GI:73993952
      XP_543227
    • Длина попадания
      490 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      840,5 биты
    • Сходство
      90,97%
    • Покрытие
      91,67%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 2
      91,67% cov
      XP_543227
      99,39% cov
    • Длина выравнивания
      487 aa
Вхождение
6 количество раз в PatSeqDB
Инструменты
Поиск Patseqfinder
SEQ ID NO
3
Длина
1 756
Тип
DNA
Местоположения
Detailed Description

Объявленный организм:
not provided

Определенный организм:
  • Homo sapiens

    Homo sapiens

    • Общедоступная БД
      GI:68534212
      BC098443
      1 из 12 попадания зарегистрированы для Homo sapiens.
    • Длина попадания
      3 220 bp
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      3 064,7 биты
    • Сходство
      98,07%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 3
      100% cov
      BC098443
      54,57% cov
    • Длина выравнивания
      1 759 bp
    • Строка СИГАРЫ
      193MN114MN289MN77MN2MN2MN57MIMD9MN3MNMN16MN15MN3MN11MN8MN177MN206MN264MN43MN58MN3MN8MN4MN8MNMN2MI3MD101M3NM2N3MI42M несоответствия: 29 - вставки: 3 - удаления: 2
  • Pan troglodytes

    Pan troglodytes

    • Общедоступная БД
      GI:332844472
      XM_003314809
    • Длина попадания
      3 588 bp
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      2 976,1 биты
    • Сходство
      97,22%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 3
      100% cov
      XM_003314809
      48,8% cov
    • Длина выравнивания
      1 760 bp
    • Строка СИГАРЫ
      17MN66MDM2D37MN182MN202MN86MN77MN2MN2MN23MN33MDMI9MN3MNMN16MN15MN3MN11MN8MN167MN9MN206MN67MN196MN43MN58MN3MN8MN4MN8MNMN2MI3MD64MN7MD2MD2M2D21M3NM2N3MN2I41M несоответствия: 36 - вставки: 4 - удаления: 9
  • Pongo abelii

    Pongo abelii

    • Общедоступная БД
      GI:297697237
      XM_002825726
    • Длина попадания
      2 537 bp
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      2 939,1 биты
    • Сходство
      96,76%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 3
      100% cov
      XM_002825726
      69,33% cov
    • Длина выравнивания
      1 761 bp
    • Строка СИГАРЫ
      65MN13MN9M3I116MN102MN34MN8MN44MN113MN83MN2MN77MN2MN2MN56MD2MI9MN3MNMN8MN7MN15MN3MN11MN8MN19MN8MN41MN59MN29MN5MN10MN72MN133MN264MN43MN58MN3MN8MN4MN8MNMN2MI3MD4MN11MN2MN63MN17M3NM2N21M2N22M несоответствия: 50 - вставки: 5 - удаления: 2
  • Nomascus leucogenys

    Nomascus leucogenys

    • Общедоступная БД
      GI:332252737
      XM_003275465
    • Длина попадания
      3 310 bp
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      2 859,7 биты
    • Сходство
      96,02%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 3
      100% cov
      XM_003275465
      52,87% cov
    • Длина выравнивания
      1 759 bp
    • Строка СИГАРЫ
      63MN20MDM2D117MN102MN43MN20MN137MN8MN32MN29MN14MN17MN29MN29MN2MN2MN38MN18MDMI9MN3MNMN16MN15MN3MN11MN8MN28MN23MN50MN11MN14MN29MN16MN6MN14MN44MN54MN73MN2MN7MN27MN182MN53MN43MN58MN3MN8MNMN2MN8MNMN2MI3MD16MN55MD2MD2M2D3MN17M3NM2N3MI18M2N22M несоответствия: 58 - вставки: 3 - удаления: 9
  • synthetic construct

    synthetic construct

    • Общедоступная БД
      GI:60656064
      AY889805
      1 из 4 попадания зарегистрированы для synthetic construct.
    • Длина попадания
      1 518 bp
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      2 676,9 биты
    • Сходство
      98,48%
    • Покрытие
      86,22%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 3
      86,22% cov
      AY889805
      99,93% cov
    • Длина выравнивания
      1 518 bp
    • Строка СИГАРЫ
      38H46MIM2I108MN114MN289MN77MN2MN2MN57MIMD9MN3MNMN16MN15MN3MN11MN8MN177MN206MN264MN43MN42M204H несоответствия: 18 - вставки: 4 - удаления: 1
  • Macaca mulatta

    Macaca mulatta

    • Общедоступная БД
      GI:297297039
      XR_092234
    • Длина попадания
      2 261 bp
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      2 632,6 биты
    • Сходство
      94,82%
    • Покрытие
      96,64%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 3
      96,64% cov
      XR_092234
      74,13% cov
    • Длина выравнивания
      1 700 bp
    • Строка СИГАРЫ
      43M2D2M5DM3DM2DMDM2D2M3DN14MDM2D48MN68MN97MN4MN41MN85MN47MN5MN20MN5MN5MN29MN29MN14MN5MN11MN20MN35MN2MN2MN2MN2MN54MDMI9MN3MNMN16MN15MN3MN11MN8MN52MN8MN8MN44MN44MN6MN9MN6MN35MN29MN74MN10MDMI35MN10MN31MN61MN170MN41MNMN47MN10MN3MN8MN4MN8MNMN2MI3MD8MNMN5MN35MN30MN9M59H несоответствия: 61 - вставки: 3 - удаления: 24
Вхождение
5 количество раз в PatSeqDB
Инструменты
Поиск Patseqfinder
SEQ ID NO
4
Длина
504
Тип
peptide
Местоположения
Detailed Description

Объявленный организм:
not provided

Определенный организм:
  • Pongo abelii

    Pongo abelii

    • Общедоступная БД
      GI:297697238
      XP_002825772
    • Длина попадания
      505 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      971,5 биты
    • Сходство
      97,23%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 4
      100% cov
      XP_002825772
      100% cov
    • Длина выравнивания
      505 aa
    • Строка СИГАРЫ
      9MN12M2NMNI64MN123MN19MN4MN5MN4MNMN3MN2MN58MN68MN98MN3MN13M несоответствия: 17 - вставки: 1 - удаления: 0
  • Homo sapiens

    Homo sapiens

    • Общедоступная БД
      GI:1458112
      AAB40110
      1 из 8 попадания зарегистрированы для Homo sapiens.
    • Длина попадания
      504 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      969,1 биты
    • Сходство
      98,02%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 4
      100% cov
      AAB40110
      100% cov
    • Длина выравнивания
      504 aa
    • Строка СИГАРЫ
      90MN123MN19MN4MN5MN4MNMN3MN2MN58MN68MN98MN3MN13M несоответствия: 13 - вставки: 0 - удаления: 0
  • synthetic construct

    synthetic construct

    • Общедоступная БД
      GI:30584045
      AAP36271
    • Длина попадания
      506 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      963,8 биты
    • Сходство
      97,23%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 4
      100% cov
      AAP36271
      99,8% cov
    • Длина выравнивания
      505 aa
  • Nomascus leucogenys

    Nomascus leucogenys

    • Общедоступная БД
      GI:332252738
      XP_003275513
    • Длина попадания
      503 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      960,7 биты
    • Сходство
      97,7%
    • Покрытие
      94,84%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 4
      94,84% cov
      XP_003275513
      95,03% cov
    • Длина выравнивания
      478 aa
  • Pan troglodytes

    Pan troglodytes

    • Общедоступная БД
      GI:332844473
      XP_003314857
    • Длина попадания
      568 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      960,3 биты
    • Сходство
      97,02%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 4
      100% cov
      XP_003314857
      88,56% cov
    • Длина выравнивания
      504 aa
  • Bos taurus

    Bos taurus

    • Общедоступная БД
      GI:27807295
      NP_777144
      1 из 3 попадания зарегистрированы для Bos taurus.
    • Длина попадания
      495 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      927,9 биты
    • Сходство
      95,2%
    • Покрытие
      95,04%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 4
      95,04% cov
      NP_777144
      96,77% cov
    • Длина выравнивания
      479 aa
  • Sus scrofa

    Sus scrofa

    • Общедоступная БД
      GI:335292251
      XP_001925795
    • Длина попадания
      505 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      922,2 биты
    • Сходство
      95,39%
    • Покрытие
      94,64%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 4
      94,64% cov
      XP_001925795
      94,46% cov
    • Длина выравнивания
      477 aa
  • Equus caballus

    Equus caballus

    • Общедоступная БД
      GI:194206424
      XP_001492753
    • Длина попадания
      488 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      919,8 биты
    • Сходство
      94,39%
    • Покрытие
      95,44%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 4
      95,44% cov
      XP_001492753
      98,57% cov
    • Длина выравнивания
      481 aa
Вхождение
6 количество раз в PatSeqDB
Инструменты
Поиск Patseqfinder
SEQ ID NO
5
Длина
2 374
Тип
DNA
Местоположения
Claims, Detailed Description

Объявленный организм:
not provided

Определенный организм:
  • Homo sapiens

    Homo sapiens

    • Общедоступная БД
      GI:1458113
      U62433
      1 из 10 попадания зарегистрированы для Homo sapiens.
    • Длина попадания
      3 343 bp
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      4 159,8 биты
    • Сходство
      98,19%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      U62433
      71,01% cov
    • Длина выравнивания
      2 375 bp
    • Строка СИГАРЫ
      5MD2MI9MN4MN13MN6MN12MN3MN382MN109MN32MN46MN176MN6MN8MN65MN2MN23MN24MN22MN56MN17MN31MN72MN72MN180MN77MN21MN199MN24MN88MN31MN28MN226MN84MN3MN36MN48MNMN7MN6MN18MN11MN47M несоответствия: 41 - вставки: 1 - удаления: 1
  • synthetic construct

    synthetic construct

    • Общедоступная БД
      GI:307685564
      AB590558
    • Длина попадания
      1 898 bp
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      3 338 биты
    • Сходство
      98,57%
    • Покрытие
      79,4%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 5
      79,4% cov
      AB590558
      99,32% cov
    • Длина выравнивания
      1 885 bp
    • Строка СИГАРЫ
      179H264MN109MN32MN46MN176MN6MN8MN65MN2MN23MN24MN22MN56MN17MN31MN72MN72MN180MN77MN21MN199MN24MN84MN3MN25MN5MN28MN187M310H несоответствия: 27 - вставки: 0 - удаления: 0
  • Pan troglodytes

    Pan troglodytes

    • Общедоступная БД
      GI:77628020
      NM_001034114
    • Длина попадания
      1 884 bp
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      3 203,2 биты
    • Сходство
      97,29%
    • Покрытие
      79,36%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 5
      79,36% cov
      NM_001034114
      100% cov
    • Длина выравнивания
      1 885 bp
    • Строка СИГАРЫ
      183H161MN98MN14MN68MN23MNMN32MN46MN176MN6MN8MN65MN2MN23MN24MN22MN56MN17MN4MN26MN19MN15MN36MN72MN20MN68MN80MN9MN8MN46MN15MN5MN21MN10MN100MN12MN50MN2MN9MN10MNMN22MN29MN21MN36MN8MN22MD3MI14MN10MN15MN174M307H несоответствия: 49 - вставки: 1 - удаления: 1
  • Nomascus leucogenys

    Nomascus leucogenys

    • Общедоступная БД
      GI:332262299
      XM_003280151
    • Длина попадания
      2 128 bp
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      3 101,6 биты
    • Сходство
      93,19%
    • Покрытие
      88,75%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 5
      88,75% cov
      XM_003280151
      99,44% cov
    • Длина выравнивания
      2 128 bp
    • Строка СИГАРЫ
      162H29MN11MN155MN32MN20MN29MN20MN2MN29MN47MN7MN15MN11MN4MN46MN19MN90MD3MIMIMNM2N2MNM2I2MNMINMIMNMN2MI2MDN2MDMD2NMIMNMI3MNMI2MI2M2I2MNMI2MD2MIMNMN3MD3MDMI6MD2MDN3MNMI3NMI4M2N19MNMN5MN2MN9MN4MN4MN2MN18MN4MN24MN22MN27MN28MN17MN31MN7MN11MN52MN21MN23MN26MN20MN8MN23MN35MN17MN20MN11MN12MN6MN2MN6MN9MN37MN3MN6MN22MN3MNMN6MN14MN40MN67MN90MN22MNMN27MN11MN11MN29MN6MN8MN16MN5MD2MI26MN15MN131MN36MN23MNM2N12MN10MN4MN7MN23MN14MN18MN3MI3MNMD17MN16MI2MD13MN6MN5MN12M105H несоответствия: 112 - вставки: 21 - удаления: 12
  • Macaca mulatta

    Macaca mulatta

    • Общедоступная БД
      GI:297259376
      XM_001114265
    • Длина попадания
      2 118 bp
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      2 789,6 биты
    • Сходство
      94,12%
    • Покрытие
      77,21%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 5
      77,21% cov
      XM_001114265
      86,4% cov
    • Длина выравнивания
      1 836 bp
    • Строка СИГАРЫ
      258H62MN50MN12MN7MN20MN29MN20MN32MN5MN49MN18MN11MNMN46MN4MN11MN23MN74MN53MN6MN6MN8MN33MN2MN11MN11MN4MN2MN23MN18MN5MN22MN56MN17MN31MN19MN50MNMN12MN11MN14MN18MN13MN20MN23MN26MN5MN11MN35MN2MN8MIN2MD5MN16MN6MN4M3D4MNMN3MN24MN8MN10MN17MDMI3MNMN6MN14MN3MN22MN6MN6MN64MN14MN2MN45MN16MN2MNMN7MN22MNMN18MN21MN10MN3M2N10MN4MN5MN9MNM2N5MN16MN5MD2MI26MN15MN11MN2MN21MN79MN14MN51MN14M283H несоответствия: 99 - вставки: 3 - удаления: 6
Вхождение
5 количество раз в PatSeqDB
Инструменты
Поиск Patseqfinder
SEQ ID NO
6
Длина
627
Тип
peptide
Местоположения
Claims, Detailed Description

Объявленный организм:
not provided

Определенный организм:
  • Homo sapiens

    Homo sapiens

    • Общедоступная БД
      GI:854159
      CAA60959
      1 из 5 попадания зарегистрированы для Homo sapiens.
    • Длина попадания
      602 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      1 173,7 биты
    • Сходство
      97,01%
    • Покрытие
      96,01%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      96,01% cov
      CAA60959
      100% cov
    • Длина выравнивания
      602 aa
    • Строка СИГАРЫ
      25H98MN10MN15MN58MNMN2MN21M2N7MN7MN7MN18MN5MN10MN23MN23MN60MN25MN6MN66MN7MN29MN19MN62M несоответствия: 23 - вставки: 0 - удаления: 0
  • Pan troglodytes

    Pan troglodytes

    • Общедоступная БД
      GI:77628021
      NP_001029286
    • Длина попадания
      627 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      1 136,7 биты
    • Сходство
      96,01%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      NP_001029286
      100% cov
    • Длина выравнивания
      627 aa
  • Macaca mulatta

    Macaca mulatta

    • Общедоступная БД
      GI:297259377
      XP_001114265
    • Длина попадания
      697 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      1 123,6 биты
    • Сходство
      93,43%
    • Покрытие
      97,13%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      97,13% cov
      XP_001114265
      87,23% cov
    • Длина выравнивания
      609 aa
  • Nomascus leucogenys

    Nomascus leucogenys

    • Общедоступная БД
      GI:332262300
      XP_003280199
    • Длина попадания
      630 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      1 072 биты
    • Сходство
      91,59%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      XP_003280199
      100% cov
    • Длина выравнивания
      630 aa
  • Callithrix jacchus

    Callithrix jacchus

    • Общедоступная БД
      GI:296200891
      XP_002747818
    • Длина попадания
      591 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      1 015,4 биты
    • Сходство
      91,16%
    • Покрытие
      93,78%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      93,78% cov
      XP_002747818
      99,49% cov
    • Длина выравнивания
      588 aa
  • Ailuropoda melanoleuca

    Ailuropoda melanoleuca

    • Общедоступная БД
      GI:281343225
      EFB18809
    • Длина попадания
      599 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      1 005 биты
    • Сходство
      87,87%
    • Покрытие
      95,85%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      95,85% cov
      EFB18809
      100% cov
    • Длина выравнивания
      602 aa
  • Canis lupus familiaris

    Canis lupus familiaris

    • Общедоступная БД
      GI:73992736
      XP_543097
    • Длина попадания
      681 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      993,4 биты
    • Сходство
      85,9%
    • Покрытие
      97,45%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      97,45% cov
      XP_543097
      88,99% cov
    • Длина выравнивания
      617 aa
  • Mus musculus

    Mus musculus

    • Общедоступная БД
      GI:31542393
      NP_056545
      1 из 4 попадания зарегистрированы для Mus musculus.
    • Длина попадания
      629 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      988 биты
    • Сходство
      85,1%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      NP_056545
      100% cov
    • Длина выравнивания
      631 aa
  • Bos taurus

    Bos taurus

    • Общедоступная БД
      GI:300798278
      NP_001179829
    • Длина попадания
      614 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      973 биты
    • Сходство
      85,67%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      NP_001179829
      100% cov
    • Длина выравнивания
      628 aa
  • Mustela putorius furo

    Mustela putorius furo

    • Общедоступная БД
      GI:122142601
      Q19AE6
    • Длина попадания
      627 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      961,1 биты
    • Сходство
      85,9%
    • Покрытие
      96,01%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      96,01% cov
      Q19AE6
      95,69% cov
    • Длина выравнивания
      603 aa
Вхождение
6 количество раз в PatSeqDB
Инструменты
Поиск Patseqfinder
SEQ ID NO
7
Длина
1 876
Тип
DNA
Местоположения
Detailed Description

Объявленный организм:
not provided

Определенный организм:
  • Homo sapiens

    Homo sapiens

    • Общедоступная БД
      GI:158257569
      AK292069
      1 из 13 попадания зарегистрированы для Homo sapiens.
    • Длина попадания
      2 018 bp
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      3 461,7 биты
    • Сходство
      99,95%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 7
      100% cov
      AK292069
      92,96% cov
    • Длина выравнивания
      1 876 bp
    • Строка СИГАРЫ
      1100MN775M несоответствия: 1 - вставки: 0 - удаления: 0
  • Pan troglodytes

    Pan troglodytes

    • Общедоступная БД
      GI:114656110
      XM_001164138
      1 из 2 попадания зарегистрированы для Pan troglodytes.
    • Длина попадания
      4 744 bp
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      3 373,1 биты
    • Сходство
      99,09%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 7
      100% cov
      XM_001164138
      39,54% cov
    • Длина выравнивания
      1 876 bp
    • Строка СИГАРЫ
      12MN3MN23MN21MN128MN29MN254MN413MN209MN221MN17MN5MN21MN37MN59MN107MN257MN43M несоответствия: 17 - вставки: 0 - удаления: 0
  • Pongo abelii

    Pongo abelii

    • Общедоступная БД
      GI:297696181
      XM_002825240
      1 из 2 попадания зарегистрированы для Pongo abelii.
    • Длина попадания
      3 813 bp
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      3 179,2 биты
    • Сходство
      97,23%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 7
      100% cov
      XM_002825240
      49,2% cov
    • Длина выравнивания
      1 876 bp
    • Строка СИГАРЫ
      18MN9MN9MN146MN35MN254MN83MN116MN16MN111MN80MN2MN14MN2MN2MN33MN46MN11MN35MN50MN8MN74MN15MN22MN35MN3MN7M3N3MN11MN5MN2MN29MN2MN15MNMN5MN21MN31MN5MN59MN137MN67MN51MN19MN24MN39M2N21MN19MN3MN19M несоответствия: 52 - вставки: 0 - удаления: 0
  • Macaca mulatta

    Macaca mulatta

    • Общедоступная БД
      GI:74136320
      NM_001032883
    • Длина попадания
      2 107 bp
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      3 044,4 биты
    • Сходство
      96%
    • Покрытие
      99,84%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 7
      99,84% cov
      NM_001032883
      88,85% cov
    • Длина выравнивания
      1 876 bp
    • Строка СИГАРЫ
      31MN4MD2MI10MN3MN31MN18MN20MN59MN35MN203MN29MN77MN26MN17MN11MN58MN24MN19MN66MN8MN35MN5MN74MN2MN41MN5MN53MN107MN2MN11MD3MI5MN32MN17MN78MN4MN2MNMN15MN5MN5MN29MN17MN5MN21MN31MN5MN5MN32MN20MN171MN7MN19MN5MN13MIMD30MN8MNM2N16MN11M2N4MN3M2N5MN9MD3M2N14MN2M2N21MN40M3H несоответствия: 68 - вставки: 3 - удаления: 4
Вхождение
12 количество раз в PatSeqDB
Инструменты
Поиск Patseqfinder
SEQ ID NO
8
Длина
502
Тип
peptide
Местоположения
Detailed Description

Объявленный организм:
not provided

Определенный организм:
  • Homo sapiens

    Homo sapiens

    • Общедоступная БД
      GI:4502831
      NP_000737
      1 из 6 попадания зарегистрированы для Homo sapiens.
    • Длина попадания
      502 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      1 043,1 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      NP_000737
      100% cov
    • Длина выравнивания
      502 aa
    • Строка СИГАРЫ
      502M несоответствия: 0 - вставки: 0 - удаления: 0
  • Pongo abelii

    Pongo abelii

    • Общедоступная БД
      GI:297696182
      XP_002825286
      1 из 3 попадания зарегистрированы для Pongo abelii.
    • Длина попадания
      502 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      1 035 биты
    • Сходство
      99,6%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      XP_002825286
      100% cov
    • Длина выравнивания
      502 aa
  • Macaca mulatta

    Macaca mulatta

    • Общедоступная БД
      GI:74136321
      NP_001028055
      1 из 2 попадания зарегистрированы для Macaca mulatta.
    • Длина попадания
      502 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      1 035 биты
    • Сходство
      99,6%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      NP_001028055
      100% cov
    • Длина выравнивания
      502 aa
  • Ailuropoda melanoleuca

    Ailuropoda melanoleuca

    • Общедоступная БД
      GI:301787629
      XP_002929231
      1 из 2 попадания зарегистрированы для Ailuropoda melanoleuca.
    • Длина попадания
      502 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      1 013,4 биты
    • Сходство
      98,01%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      XP_002929231
      100% cov
    • Длина выравнивания
      502 aa
  • Oryctolagus cuniculus

    Oryctolagus cuniculus

    • Общедоступная БД
      GI:291403989
      XP_002718333
    • Длина попадания
      502 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      1 006,1 биты
    • Сходство
      97,81%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      XP_002718333
      100% cov
    • Длина выравнивания
      502 aa
  • Canis lupus familiaris

    Canis lupus familiaris

    • Общедоступная БД
      GI:73951004
      XP_545813
    • Длина попадания
      499 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      1 005,4 биты
    • Сходство
      98,79%
    • Покрытие
      98,61%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 8
      98,61% cov
      XP_545813
      99,2% cov
    • Длина выравнивания
      495 aa
  • Equus caballus

    Equus caballus

    • Общедоступная БД
      GI:149691102
      XP_001492303
    • Длина попадания
      499 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      1 004,6 биты
    • Сходство
      98,39%
    • Покрытие
      98,8%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 8
      98,8% cov
      XP_001492303
      99,4% cov
    • Длина выравнивания
      496 aa
  • Bos taurus

    Bos taurus

    • Общедоступная БД
      GI:151555807
      AAI49341
      1 из 2 попадания зарегистрированы для Bos taurus.
    • Длина попадания
      499 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      988,4 биты
    • Сходство
      97,79%
    • Покрытие
      99%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 8
      99% cov
      AAI49341
      99,6% cov
    • Длина выравнивания
      497 aa
Вхождение
139 количество раз в PatSeqDB
Инструменты
Поиск Patseqfinder
SEQ ID NO
9
Длина
2 450
Тип
DNA
Местоположения
Detailed Description

Объявленный организм:
not provided

Определенный организм:
  • Homo sapiens

    Homo sapiens

    • Общедоступная БД
      GI:1458121
      U62437
      1 из 7 попадания зарегистрированы для Homo sapiens.
    • Длина попадания
      2 448 bp
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      4 505,1 биты
    • Сходство
      99,88%
    • Покрытие
      99,92%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 9
      99,92% cov
      U62437
      100% cov
    • Длина выравнивания
      2 448 bp
    • Строка СИГАРЫ
      2H104M2N9MN2332M несоответствия: 3 - вставки: 0 - удаления: 0
  • Pan troglodytes

    Pan troglodytes

    • Общедоступная БД
      GI:332810382
      XM_001152392
    • Длина попадания
      5 860 bp
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      4 398 биты
    • Сходство
      99,1%
    • Покрытие
      99,92%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 9
      99,92% cov
      XM_001152392
      41,76% cov
    • Длина выравнивания
      2 448 bp
    • Строка СИГАРЫ
      2H45MN58M2N9MN75MN7MN11MN132MN221MN83MN839MN369MD8MN14MN81MN107MN10MN71MN22MN44MN110MN3MN107M несоответствия: 21 - вставки: 0 - удаления: 1
  • Pongo abelii

    Pongo abelii

    • Общедоступная БД
      GI:297663367
      XM_002810110
    • Длина попадания
      3 073 bp
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      3 997,3 биты
    • Сходство
      96,29%
    • Покрытие
      99,18%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 9
      99,18% cov
      XM_002810110
      79,5% cov
    • Длина выравнивания
      2 454 bp
    • Строка СИГАРЫ
      20H22MN31MN6MN24M2N5MN3MN17MN17MN59MN28MN70MN32MN27MN70MN47MN74MN77MN2MD10MIM5IM3IMI2M9IN118MN50MN50MN17MN191MN14MN44MN126MN13MN29MN80MN2MN47MN31M2N11MN16MN72MN211MN64MN46MN6MN42MN23MD2MI14MN2DM2DMDMD2M2NM2N3M2D26MN29MN48MN45MN2MN20MN27MI4MIMI75MN23MN65MI2MD13MN29M несоответствия: 56 - вставки: 24 - удаления: 11
  • Macaca mulatta

    Macaca mulatta

    • Общедоступная БД
      GI:297280141
      XM_001114439
    • Длина попадания
      2 934 bp
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      3 938,2 биты
    • Сходство
      95,66%
    • Покрытие
      99,92%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 9
      99,92% cov
      XM_001114439
      83,78% cov
    • Длина выравнивания
      2 464 bp
    • Строка СИГАРЫ
      2H66MN3MN8MN24M2N9MD2MI17MN14MN45MN14MN32MN96MN2MN86MN11MN5MN98MN17MN83MN32MN15MN106MN9MN16MN68MN17MN92MN35MN164MN17MN41MN50MN11MN12MN5MN4MN20MN5MN3MN16MN31MN6MN8MN5MN9MN16MN11MN89MN77MN17MN95MN11MN7MN36MN14MN2MN9MN2MN13MN21MN10MN3MN42MN7M2I16MD2MI29MN5MD12MIMIMI11MN3MN11MN3MN6M2IM2I3MN28MN13MN17MN33MN8MN42MI4MIMI4MN11MN7MN2MN35MN10MIMD8MN6MD7MN7MI2MD27MN29MN6MN6MN6MN22M несоответствия: 85 - вставки: 16 - удаления: 6
  • Callithrix jacchus

    Callithrix jacchus

    • Общедоступная БД
      GI:296228996
      XM_002760042
    • Длина попадания
      1 853 bp
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      2 902,2 биты
    • Сходство
      94,94%
    • Покрытие
      75,67%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 9
      75,67% cov
      XM_002760042
      100% cov
    • Длина выравнивания
      1 858 bp
    • Строка СИГАРЫ
      17H6MN39MN4MN3MN6MNMN8MN15M2N3MN5MN10MN7MN15MN45MNMN11MIN3MD7M2N23MN51MN16M2N23MN2MN29MN68MN110MN11MN65MN35MN14MN113MN2MN5MN9MNMN5MN8MN35MN35MN14MN47MN29MN17MN8MN14MN8MN15MN10MN17MN14MN17MN26MN59MN44MN2MN33MNMN20MN5MN11MN44MN26MN47MN34MD2MI7MN8MN2MI2MD20MN30MN21MNMN29MN2MN62MN37MN30MN19MD6MN5MN5M2N6MN5MN5MN8MNMDMI12MN27M579H несоответствия: 85 - вставки: 4 - удаления: 5
  • Macaca fascicularis

    Macaca fascicularis

    • Общедоступная БД
      GI:90079278
      AB172257
    • Длина попадания
      2 168 bp
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      2 403,6 биты
    • Сходство
      95,39%
    • Покрытие
      61,59%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 9
      61,59% cov
      AB172257
      69,83% cov
    • Длина выравнивания
      1 519 bp
    • Строка СИГАРЫ
      719H89MN9MN16MN68MN17MN92MN35MN164MN17MN38MN2MN50MN11MN12MN5MN4MN20MN3MNMN3MN16MN31MN6MN8MN5MN9MN16MN11MN89MN77MN17MN95MN11MN7MN36MN14MN2MN9MN2MN13MN21MN10MN3MN42MN7M2I16MD2MI29MN5MD12M3I13MN3MN11MN3MN7M4I3MN28MN13MN5MN10M3D32MN8MN36M222H несоответствия: 55 - вставки: 10 - удаления: 5
  • Bos taurus

    Bos taurus

    • Общедоступная БД
      GI:300794785
      NM_001192474
      1 из 4 попадания зарегистрированы для Bos taurus.
    • Длина попадания
      1 741 bp
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      2 165,4 биты
    • Сходство
      91,06%
    • Покрытие
      65,51%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 9
      65,51% cov
      NM_001192474
      92,07% cov
    • Длина выравнивания
      1 611 bp
    • Строка СИГАРЫ
      170H22MNMI4MN9MN3MIN2MN2MD9M2N2MIMD2MN8MNMN12MNMN9MN3MN2MDMI2MN3M2N4MN7M2N4MN8MD3MI11MN2MN8MN2MN5MN11MN32MN47MN71MN11MN26MN2MN62MN11MN35MN65MN2MN14MN32MN20MN9MN7MN8MN7MN18MN2MN2MN11MN11MN5MN14MN2MN5MN2MN14MN2MN11MN2MN8MN17MN14MN2MN11MN11MN14MN2MN5MN2MN12MNMN8MN14MN2MN20MN11MN11MN5MN5MN32MN53MN29MN27MN7MN14MN5MNM2N8MN2MN5MN11MN8MN5MN5MN2MN2MN2M2D3MD9MN4M2N47MN5MN11M2NMN5MN2MN2MNM2N2MN12MNMI5MD12MN41MN2MN8MN8MN29MN2MN11MN8MN5MN14MN17MN36MN4M2N14MN10MN2MN15M675H несоответствия: 130 - вставки: 6 - удаления: 8
  • Sus scrofa

    Sus scrofa

    • Общедоступная БД
      GI:311254197
      XM_003125722
    • Длина попадания
      1 509 bp
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      2 106,3 биты
    • Сходство
      91,87%
    • Покрытие
      61,59%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 9
      61,59% cov
      XM_003125722
      100% cov
    • Длина выравнивания
      1 512 bp
    • Строка СИГАРЫ
      266H6MN6MDMI6MN13M2N2MN11MN13MN2MN8MN2MN81MN16MN5MN3MNMN26MN17MN14MN11MN26MN2MN60MN10MN5MN8MN5MN35MN20MN2MN14MN8MN17MN32MN11MN8MN9MN7MN8MN14MN11MN5MN17MN5MN5MN5MN17MN2MN14MN2MN11MN11MN38MN8MN35MN2MN2MN9MNMN8MN5MN11MN6MN25MN5MN5MN11MN2MN50MN2MN14MN14MN29MN27MN22MN5MNM2N2MN5MN20MN20MN2MN2MN14MN7MND3MI6MN7MN4MIMD7M2N14MN5MN11MN5MN2MN2MN2MN2MN2MN5MN8MN4MN3MN8MN20MN14MN17MN8MN2MN8MN17MN23MN20MN54MN5MN14MN10MN2MN15M675H несоответствия: 117 - вставки: 3 - удаления: 3
Вхождение
5 количество раз в PatSeqDB
Инструменты
Поиск Patseqfinder
SEQ ID NO
10
Длина
502
Тип
peptide
Местоположения
Detailed Description

Объявленный организм:
not provided

Определенный организм:
  • Homo sapiens

    Homo sapiens

    • Общедоступная БД
      GI:4502833
      NP_000739
      1 из 2 попадания зарегистрированы для Homo sapiens.
    • Длина попадания
      502 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      1 041,6 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      NP_000739
      100% cov
    • Длина выравнивания
      502 aa
    • Строка СИГАРЫ
      502M несоответствия: 0 - вставки: 0 - удаления: 0
  • Macaca mulatta

    Macaca mulatta

    • Общедоступная БД
      GI:109016655
      XP_001114439
    • Длина попадания
      502 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      1 032,3 биты
    • Сходство
      99,4%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      XP_001114439
      100% cov
    • Длина выравнивания
      502 aa
    • Строка СИГАРЫ
      189MN186MN15MN10MN98M несоответствия: 4 - вставки: 0 - удаления: 0
  • Callithrix jacchus

    Callithrix jacchus

    • Общедоступная БД
      GI:296228997
      XP_002760088
    • Длина попадания
      502 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      1 026,5 биты
    • Сходство
      99,4%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      XP_002760088
      100% cov
    • Длина выравнивания
      502 aa
    • Строка СИГАРЫ
      17MN171MN154MN64M2N6MN6MN17MN44MN14M несоответствия: 9 - вставки: 0 - удаления: 0
  • Bos taurus

    Bos taurus

    • Общедоступная БД
      GI:300794786
      NP_001179403
    • Длина попадания
      501 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      937,6 биты
    • Сходство
      97,01%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      NP_001179403
      100% cov
    • Длина выравнивания
      502 aa
  • Sus scrofa

    Sus scrofa

    • Общедоступная БД
      GI:311254198
      XP_003125770
    • Длина попадания
      502 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      934,9 биты
    • Сходство
      97,61%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      XP_003125770
      100% cov
    • Длина выравнивания
      502 aa
  • Pongo abelii

    Pongo abelii

    • Общедоступная БД
      GI:297663368
      XP_002810156
    • Длина попадания
      508 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      934,5 биты
    • Сходство
      97,44%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      XP_002810156
      100% cov
    • Длина выравнивания
      508 aa
  • Mus musculus

    Mus musculus

    • Общедоступная БД
      GI:31542397
      NP_033732
      1 из 4 попадания зарегистрированы для Mus musculus.
    • Длина попадания
      501 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      914,8 биты
    • Сходство
      95,22%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      NP_033732
      100% cov
    • Длина выравнивания
      502 aa
  • Rattus norvegicus

    Rattus norvegicus

    • Общедоступная БД
      GI:9506485
      NP_062170
    • Длина попадания
      500 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      906,7 биты
    • Сходство
      95,73%
    • Покрытие
      98,01%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 10
      98,01% cov
      NP_062170
      98,2% cov
    • Длина выравнивания
      492 aa
  • Monodelphis domestica

    Monodelphis domestica

    • Общедоступная БД
      GI:126307760
      XP_001373153
    • Длина попадания
      509 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      849 биты
    • Сходство
      91,8%
    • Покрытие
      95,82%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 10
      95,82% cov
      XP_001373153
      95,87% cov
    • Длина выравнивания
      488 aa
  • Taeniopygia guttata

    Taeniopygia guttata

    • Общедоступная БД
      GI:224084068
      XP_002188221
    • Длина попадания
      486 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      837,4 биты
    • Сходство
      89,59%
    • Покрытие
      96,81%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 10
      96,81% cov
      XP_002188221
      99,59% cov
    • Длина выравнивания
      490 aa
  • Canis lupus familiaris

    Canis lupus familiaris

    • Общедоступная БД
      GI:73961634
      XP_547565
    • Длина попадания
      478 aa
    • Значение E
      0E0
    • Оценка BLAST
      829,7 биты
    • Сходство
      91,25%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      XP_547565
      100% cov
    • Длина выравнивания
      503 aa
Вхождение
100 количество раз в PatSeqDB
Инструменты
Поиск Patseqfinder

Фильтровать последовательности

Очистить

Войдите в объектив

Забыли пароль? Зарегистрировать новую учетную запись

Улучшения языка

Мы были заняты обновлением нашей локализации и всех существующих языков.

Большая часть этих переводов была выполнена с использованием машинного перевода с проверкой носителя языка, однако не все элементы пользовательского интерфейса были проверены для каждого языка. Если вы видите термин, который переведен неправильно или нуждается в улучшении, обратитесь в службу поддержки.

  Больше не показывать
Отзыв