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recherche de séquences biologiques divulguées dans les brevets

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Données obtenues à partir de: DDBJ Pat NCBI GenBank USPTO Fulltext EMBL-EBI Pat
20 séquences trouvées dans ce brevet (au total)

Affichage 1 - 10 de 20 séquences

SEQ ID NO
Longueur
Type
Emplacements
Organisms
Occurrence
Outils
SEQ ID NO
1
Longueur
2 465
Type
nucleotide
Emplacements
Claims, Detailed Description, Summary

Organisme déclaré:
Nicotiana tabacum

Organisme déterminé:
  • Nicotiana tabacum

    Nicotiana tabacum

    • Accès à la base de données publique
      GI:134048905
      AB289456
      1 de 3 hits signalés pour Nicotiana tabacum.
    • Longueur du coup
      2 465 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      4 553,1 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      100% cov
      AB289456
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      2 465 bp
    • Chaîne CIGARE
      2465M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Vitis vinifera

    Vitis vinifera

    • Accès à la base de données publique
      GI:225456915
      XM_002277925
    • Longueur du coup
      2 632 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 842,2 bits
    • Similarité
      83,22%
    • Couverture
      82,8%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      82,8% cov
      XM_002277925
      77,55% cov
    • Longueur d'alignement
      2 074 bp
  • Populus trichocarpa

    Populus trichocarpa

    • Accès à la base de données publique
      GI:224135920
      XM_002322158
    • Longueur du coup
      2 103 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 620,6 bits
    • Similarité
      80,93%
    • Couverture
      85,56%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      85,56% cov
      XM_002322158
      99,57% cov
    • Longueur d'alignement
      2 140 bp
  • Lotus japonicus

    Lotus japonicus

    • Accès à la base de données publique
      GI:292789576
      AK339145
    • Longueur du coup
      3 025 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 208,8 bits
    • Similarité
      80,46%
    • Couverture
      65,92%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      65,92% cov
      AK339145
      53,82% cov
    • Longueur d'alignement
      1 658 bp
Occurrence
26 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
2
Longueur
790
Type
peptide
Emplacements
Claims, Detailed Description, Summary

Organisme déclaré:
Nicotiana tabacum

Organisme déterminé:
  • Nicotiana tabacum

    Nicotiana tabacum

    • Accès à la base de données publique
      GI:115315698
      ABI93948
      1 de 2 hits signalés pour Nicotiana tabacum.
    • Longueur du coup
      790 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 645,6 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      ABI93948
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      790 aa
    • Chaîne CIGARE
      790M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Ricinus communis

    Ricinus communis

    • Accès à la base de données publique
      GI:255540539
      XP_002511334
      1 de 2 hits signalés pour Ricinus communis.
    • Longueur du coup
      797 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 329,7 bits
    • Similarité
      88,18%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      XP_002511334
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      804 aa
    • Chaîne CIGARE
      2MNMN2MNM2N3IM2NM2NMN2MN5DN5M2NMN7IN2M3N2MNM3NM3I2NM9NMN3MD2N2M2N2M3N3M2NMN4MN22MN6MN3MN4MN4MN14MN2MN6M2NI12MN4M2N4MN5MN4M2N10MNMNMN6MN2MN10M2N4MN2M2N5M2N5MN7MN5MN6MN26MN4MN13MN7MN15MNMN8M2NM2N25MN8MN17MN23MN24MN12MN24MN8MN30MN5MNMN15MN11MN5M2N4MN2M2N14MN7MNMNM2N14MN11MN26MN2M2NMN13MN3M2N4MNMN3MNMN4MN18MN3MNMN3MN11MNDNM7N2MNM2N3M5N5M incompatibilités: 146 - insertions: 14 - suppressions: 7
  • Vitis vinifera

    Vitis vinifera

    • Accès à la base de données publique
      GI:225456916
      XP_002277961
      1 de 5 hits signalés pour Vitis vinifera.
    • Longueur du coup
      791 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 324,7 bits
    • Similarité
      90,39%
    • Couverture
      94,81%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      94,81% cov
      XP_002277961
      94,56% cov
    • Longueur d'alignement
      749 aa
  • Arabidopsis lyrata subsp. lyrata

    Arabidopsis lyrata subsp. lyrata

    • Accès à la base de données publique
      GI:297827947
      XP_002881856
    • Longueur du coup
      775 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 289,2 bits
    • Similarité
      90,61%
    • Couverture
      91,65%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      91,65% cov
      XP_002881856
      92,9% cov
    • Longueur d'alignement
      724 aa
  • Arabidopsis thaliana

    Arabidopsis thaliana

    • Accès à la base de données publique
      GI:30689034
      NP_181777
      1 de 2 hits signalés pour Arabidopsis thaliana.
    • Longueur du coup
      776 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 280 bits
    • Similarité
      91,15%
    • Couverture
      90,13%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      90,13% cov
      NP_181777
      91,62% cov
    • Longueur d'alignement
      712 aa
  • Populus trichocarpa

    Populus trichocarpa

    • Accès à la base de données publique
      GI:224107787
      XP_002314600
      1 de 3 hits signalés pour Populus trichocarpa.
    • Longueur du coup
      700 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 266,5 bits
    • Similarité
      92,2%
    • Couverture
      89,24%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      89,24% cov
      XP_002314600
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      705 aa
  • Sorghum bicolor

    Sorghum bicolor

    • Accès à la base de données publique
      GI:242076200
      XP_002448036
    • Longueur du coup
      782 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 251,5 bits
    • Similarité
      84,89%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      XP_002448036
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      794 aa
Occurrence
43 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
3
Longueur
2 405
Type
nucleotide
Emplacements
Detailed Description, Summary

Organisme déclaré:
Nicotiana tabacum

Organisme déterminé:
  • Nicotiana tabacum

    Nicotiana tabacum

    • Accès à la base de données publique
      GI:134048907
      AB289457
      1 de 3 hits signalés pour Nicotiana tabacum.
    • Longueur du coup
      2 405 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      4 442,3 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 3
      100% cov
      AB289457
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      2 405 bp
    • Chaîne CIGARE
      2405M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Vitis vinifera

    Vitis vinifera

    • Accès à la base de données publique
      GI:225456915
      XM_002277925
      1 de 2 hits signalés pour Vitis vinifera.
    • Longueur du coup
      2 632 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 713 bits
    • Similarité
      82,2%
    • Couverture
      84,2%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 3
      84,2% cov
      XM_002277925
      76,94% cov
    • Longueur d'alignement
      2 056 bp
  • Populus trichocarpa

    Populus trichocarpa

    • Accès à la base de données publique
      GI:224135920
      XM_002322158
      1 de 2 hits signalés pour Populus trichocarpa.
    • Longueur du coup
      2 103 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 502,4 bits
    • Similarité
      80,51%
    • Couverture
      83,95%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 3
      83,95% cov
      XM_002322158
      95,44% cov
    • Longueur d'alignement
      2 052 bp
  • Glycine max

    Glycine max

    • Accès à la base de données publique
      GI:210140774
      AK244693
      1 de 2 hits signalés pour Glycine max.
    • Longueur du coup
      2 872 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 432,3 bits
    • Similarité
      79,83%
    • Couverture
      83,99%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 3
      83,99% cov
      AK244693
      70,33% cov
    • Longueur d'alignement
      2 058 bp
  • Lotus japonicus

    Lotus japonicus

    • Accès à la base de données publique
      GI:292789576
      AK339145
    • Longueur du coup
      3 025 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 197,7 bits
    • Similarité
      80,34%
    • Couverture
      67,44%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 3
      67,44% cov
      AK339145
      53,69% cov
    • Longueur d'alignement
      1 653 bp
Occurrence
10 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
4
Longueur
766
Type
peptide
Emplacements
Detailed Description, Summary

Organisme déclaré:
Nicotiana tabacum

Organisme déterminé:
  • Nicotiana tabacum

    Nicotiana tabacum

    • Accès à la base de données publique
      GI:134048908
      BAF49520
      1 de 2 hits signalés pour Nicotiana tabacum.
    • Longueur du coup
      766 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 594,3 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      100% cov
      BAF49520
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      766 aa
    • Chaîne CIGARE
      766M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Ricinus communis

    Ricinus communis

    • Accès à la base de données publique
      GI:255540539
      XP_002511334
      1 de 2 hits signalés pour Ricinus communis.
    • Longueur du coup
      797 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 304,3 bits
    • Similarité
      88,27%
    • Couverture
      98,96%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      98,96% cov
      XP_002511334
      97,99% cov
    • Longueur d'alignement
      784 aa
    • Chaîne CIGARE
      8H3M2N3MND2N3M12I3NMN2MNM10IM2NM3I3NM2N2MND2NM3NM3N2M3NMN2MNMN22MN6MN3MN9MN14MN2M2NMN3MNMI12M2N3M2N4MN5MN4M2N5MN6MNMN6MN2MN3MN6M2N8MN6M2N4MN7MN5MN6MN22MN3MN3MN22MN17MN11M2N9MN15MN8MN17MN23MN13MNMN8MN12MN38MN21MN3MN5MN17MN11MN5M2NMN2MN2M2N9MN2MNMN7MNM2NMN11MN2MN11M2N25MN2M2NMN13MN3M2N4MN5MN25MN5MN13MD2M2NMNMN2M2NM2N7M4NMN3M incompatibilités: 127 - insertions: 26 - suppressions: 3
  • Vitis vinifera

    Vitis vinifera

    • Accès à la base de données publique
      GI:225456916
      XP_002277961
      1 de 5 hits signalés pour Vitis vinifera.
    • Longueur du coup
      791 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 293,1 bits
    • Similarité
      90,69%
    • Couverture
      96,21%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      96,21% cov
      XP_002277961
      93,3% cov
    • Longueur d'alignement
      741 aa
  • Arabidopsis lyrata subsp. lyrata

    Arabidopsis lyrata subsp. lyrata

    • Accès à la base de données publique
      GI:297827947
      XP_002881856
    • Longueur du coup
      775 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 275,4 bits
    • Similarité
      89,58%
    • Couverture
      95,95%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      95,95% cov
      XP_002881856
      95,23% cov
    • Longueur d'alignement
      739 aa
  • Arabidopsis thaliana

    Arabidopsis thaliana

    • Accès à la base de données publique
      GI:30689034
      NP_181777
      1 de 2 hits signalés pour Arabidopsis thaliana.
    • Longueur du coup
      776 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 265,4 bits
    • Similarité
      89,05%
    • Couverture
      95,95%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      95,95% cov
      NP_181777
      95,23% cov
    • Longueur d'alignement
      740 aa
  • Populus trichocarpa

    Populus trichocarpa

    • Accès à la base de données publique
      GI:224107787
      XP_002314600
      1 de 2 hits signalés pour Populus trichocarpa.
    • Longueur du coup
      700 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 255,7 bits
    • Similarité
      92,48%
    • Couverture
      92,04%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      92,04% cov
      XP_002314600
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      705 aa
  • Glycine max

    Glycine max

    • Accès à la base de données publique
      GI:5230728
      AAD40979
    • Longueur du coup
      701 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 221,1 bits
    • Similarité
      91,09%
    • Couverture
      92,04%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      92,04% cov
      AAD40979
      100% cov
    • Longueur d'alignement
      707 aa
  • Sorghum bicolor

    Sorghum bicolor

    • Accès à la base de données publique
      GI:242076200
      XP_002448036
    • Longueur du coup
      782 aa
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 217,6 bits
    • Similarité
      88,6%
    • Couverture
      93,86%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      93,86% cov
      XP_002448036
      91,18% cov
    • Longueur d'alignement
      719 aa
Occurrence
12 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
5
Longueur
2 373
Type
nucleotide
Emplacements
Detailed Description

Organisme déclaré:
Nicotiana tabacum

Organisme déterminé:
  • Nicotiana tabacum

    Nicotiana tabacum

    • Accès à la base de données publique
      GI:134048905
      AB289456
      1 de 3 hits signalés pour Nicotiana tabacum.
    • Longueur du coup
      2 465 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      4 383,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      100% cov
      AB289456
      96,27% cov
    • Longueur d'alignement
      2 373 bp
    • Chaîne CIGARE
      2373M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Vitis vinifera

    Vitis vinifera

    • Accès à la base de données publique
      GI:225456915
      XM_002277925
    • Longueur du coup
      2 632 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 842,2 bits
    • Similarité
      83,22%
    • Couverture
      86,01%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      86,01% cov
      XM_002277925
      77,55% cov
    • Longueur d'alignement
      2 074 bp
  • Populus trichocarpa

    Populus trichocarpa

    • Accès à la base de données publique
      GI:224135920
      XM_002322158
    • Longueur du coup
      2 103 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 620,6 bits
    • Similarité
      80,93%
    • Couverture
      88,87%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      88,87% cov
      XM_002322158
      99,57% cov
    • Longueur d'alignement
      2 140 bp
  • Lotus japonicus

    Lotus japonicus

    • Accès à la base de données publique
      GI:292789576
      AK339145
    • Longueur du coup
      3 025 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 208,8 bits
    • Similarité
      80,46%
    • Couverture
      68,48%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 5
      68,48% cov
      AK339145
      53,82% cov
    • Longueur d'alignement
      1 658 bp
Occurrence
12 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
6
Longueur
2 301
Type
nucleotide
Emplacements
Detailed Description

Organisme déclaré:
Nicotiana tabacum

Organisme déterminé:
  • Nicotiana tabacum

    Nicotiana tabacum

    • Accès à la base de données publique
      GI:134048907
      AB289457
      1 de 3 hits signalés pour Nicotiana tabacum.
    • Longueur du coup
      2 405 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      4 250,3 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      AB289457
      95,68% cov
    • Longueur d'alignement
      2 301 bp
    • Chaîne CIGARE
      2301M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Vitis vinifera

    Vitis vinifera

    • Accès à la base de données publique
      GI:225456915
      XM_002277925
      1 de 2 hits signalés pour Vitis vinifera.
    • Longueur du coup
      2 632 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 713 bits
    • Similarité
      82,2%
    • Couverture
      88,01%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      88,01% cov
      XM_002277925
      76,94% cov
    • Longueur d'alignement
      2 056 bp
  • Populus trichocarpa

    Populus trichocarpa

    • Accès à la base de données publique
      GI:224135920
      XM_002322158
      1 de 2 hits signalés pour Populus trichocarpa.
    • Longueur du coup
      2 103 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 502,4 bits
    • Similarité
      80,51%
    • Couverture
      87,74%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      87,74% cov
      XM_002322158
      95,44% cov
    • Longueur d'alignement
      2 052 bp
  • Glycine max

    Glycine max

    • Accès à la base de données publique
      GI:210140774
      AK244693
      1 de 2 hits signalés pour Glycine max.
    • Longueur du coup
      2 872 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 432,3 bits
    • Similarité
      79,83%
    • Couverture
      87,79%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      87,79% cov
      AK244693
      70,33% cov
    • Longueur d'alignement
      2 058 bp
  • Lotus japonicus

    Lotus japonicus

    • Accès à la base de données publique
      GI:292789576
      AK339145
    • Longueur du coup
      3 025 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 197,7 bits
    • Similarité
      80,34%
    • Couverture
      70,49%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 6
      70,49% cov
      AK339145
      53,69% cov
    • Longueur d'alignement
      1 653 bp
Occurrence
12 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
7
Longueur
40
Type
nucleotide
Emplacements
Undetermined

Organisme déclaré:
Artificial

Organisme déterminé:
  • Nicotiana tabacum

    Nicotiana tabacum

    • Accès à la base de données publique
      GI:134048905
      AB289456
      1 de 2 hits signalés pour Nicotiana tabacum.
    • Longueur du coup
      2 465 bp
    • Valeur E
      1,17E-8
    • Score BLAST
      65,9 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      82,5%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 7
      82,5% cov
      AB289456
      1,34% cov
    • Longueur d'alignement
      33 bp
    • Chaîne CIGARE
      7H33M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
Occurrence
10 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
8
Longueur
27
Type
nucleotide
Emplacements
Undetermined

Organisme déclaré:
Artificial

Organisme déterminé:
Occurrence
10 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
9
Longueur
20
Type
nucleotide
Emplacements
Undetermined

Organisme déclaré:
Artificial

Organisme déterminé:
  • Nicotiana tabacum

    Nicotiana tabacum

    • Accès à la base de données publique
      GI:134048905
      AB289456
      1 de 2 hits signalés pour Nicotiana tabacum.
    • Longueur du coup
      2 465 bp
    • Valeur E
      4,54E-1
    • Score BLAST
      37,4 bits
    • Similarité
      95%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      AB289456
      0,81% cov
    • Longueur d'alignement
      20 bp
    • Chaîne CIGARE
      11MN8M incompatibilités: 1 - insertions: 0 - suppressions: 0
Occurrence
10 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
10
Longueur
21
Type
nucleotide
Emplacements
Undetermined

Organisme déclaré:
Artificial

Organisme déterminé:
  • Nicotiana tabacum

    Nicotiana tabacum

    • Accès à la base de données publique
      GI:134048905
      AB289456
      1 de 3 hits signalés pour Nicotiana tabacum.
    • Longueur du coup
      2 465 bp
    • Valeur E
      2,55E-2
    • Score BLAST
      42,1 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      AB289456
      0,85% cov
    • Longueur d'alignement
      21 bp
    • Chaîne CIGARE
      21M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
Occurrence
10 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq

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