Загрузка...

поиск биологических последовательностей, раскрытых в патентах

Discover Patseq Finder: поиск и анализ аналогичных совпадений последовательностей в базе данных Lens Patseq без усилий с использованием Patseq Finder. Сканирование 480m+ биологические последовательности, раскрытые в патентах на платформу, затраченной на конфиденциальность, и придают вашей стратегии IP преимущество.

view patseq Увольнять
Данные получены из: DDBJ Pat NCBI GenBank USPTO Fulltext EMBL-EBI Pat
110 последовательностей, найденных в этом патенте (всего)

Отображение 1 - 10 из 110 последовательностей

SEQ ID NO
Длина
Тип
Местоположения
Organisms
Вхождение
Инструменты
SEQ ID NO
1
Длина
142
Тип
peptide
Местоположения
Detailed Description, Drawings

Объявленный организм:
Agrobacterium tumefaciens

Определенный организм:
  • Agrobacterium sp. H13-3

    Agrobacterium sp. H13-3

    • Общедоступная БД
      GI:325292293
      YP_004278157
    • Длина попадания
      142 aa
    • Значение E
      2,92E-78
    • Оценка BLAST
      295 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 1
      100% cov
      YP_004278157
      100% cov
    • Длина выравнивания
      142 aa
    • Строка СИГАРЫ
      142M несоответствия: 0 - вставки: 0 - удаления: 0
  • Agrobacterium fabrum str. C58

    Agrobacterium fabrum str. C58

    • Общедоступная БД
      GI:15888254
      NP_353935
    • Длина попадания
      142 aa
    • Значение E
      1,31E-77
    • Оценка BLAST
      293,1 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 1
      100% cov
      NP_353935
      100% cov
    • Длина выравнивания
      142 aa
    • Строка СИГАРЫ
      140MNM несоответствия: 1 - вставки: 0 - удаления: 0
  • Agrobacterium tumefaciens

    Agrobacterium tumefaciens

    • Общедоступная БД
      GI:1710640
      P55324
    • Длина попадания
      142 aa
    • Значение E
      1,8E-77
    • Оценка BLAST
      292,7 биты
    • Сходство
      99,3%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 1
      100% cov
      P55324
      100% cov
    • Длина выравнивания
      142 aa
    • Строка СИГАРЫ
      110MN31M несоответствия: 1 - вставки: 0 - удаления: 0
  • Agrobacterium radiobacter K84

    Agrobacterium radiobacter K84

    • Общедоступная БД
      GI:222085297
      YP_002543827
    • Длина попадания
      143 aa
    • Значение E
      3,29E-64
    • Оценка BLAST
      248,4 биты
    • Сходство
      89,21%
    • Покрытие
      97,89%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 1
      97,89% cov
      YP_002543827
      97,2% cov
    • Длина выравнивания
      139 aa
  • Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304

    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304

    • Общедоступная БД
      GI:209548484
      YP_002280401
    • Длина попадания
      143 aa
    • Значение E
      3,67E-62
    • Оценка BLAST
      241,9 биты
    • Сходство
      87,32%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 1
      100% cov
      YP_002280401
      99,3% cov
    • Длина выравнивания
      142 aa
  • Rhizobium gallicum bv. gallicum

    Rhizobium gallicum bv. gallicum

    • Общедоступная БД
      GI:170783770
      ACB37369
    • Длина попадания
      143 aa
    • Значение E
      1,17E-61
    • Оценка BLAST
      240 биты
    • Сходство
      87,32%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 1
      100% cov
      ACB37369
      99,3% cov
    • Длина выравнивания
      142 aa
  • Rhizobium leguminosarum bv. trifolii

    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii

    • Общедоступная БД
      GI:51012474
      AAT92553
    • Длина попадания
      143 aa
    • Значение E
      1,19E-61
    • Оценка BLAST
      240 биты
    • Сходство
      87,32%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 1
      100% cov
      AAT92553
      99,3% cov
    • Длина выравнивания
      142 aa
  • Rhizobium etli CFN 42

    Rhizobium etli CFN 42

    • Общедоступная БД
      GI:86356889
      YP_468781
    • Длина попадания
      143 aa
    • Значение E
      1,23E-61
    • Оценка BLAST
      240 биты
    • Сходство
      87,32%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 1
      100% cov
      YP_468781
      99,3% cov
    • Длина выравнивания
      142 aa
  • Rhizobium etli CIAT 652

    Rhizobium etli CIAT 652

    • Общедоступная БД
      GI:190890962
      YP_001977504
    • Длина попадания
      143 aa
    • Значение E
      3,32E-61
    • Оценка BLAST
      238,4 биты
    • Сходство
      86,62%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 1
      100% cov
      YP_001977504
      99,3% cov
    • Длина выравнивания
      142 aa
  • Sinorhizobium meliloti 1021

    Sinorhizobium meliloti 1021

    • Общедоступная БД
      GI:15964752
      NP_385105
    • Длина попадания
      143 aa
    • Значение E
      3,83E-61
    • Оценка BLAST
      238,4 биты
    • Сходство
      89,93%
    • Покрытие
      97,89%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 1
      97,89% cov
      NP_385105
      97,2% cov
    • Длина выравнивания
      139 aa
  • Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841

    Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841

    • Общедоступная БД
      GI:116251147
      YP_766985
    • Длина попадания
      143 aa
    • Значение E
      4,88E-61
    • Оценка BLAST
      238 биты
    • Сходство
      87,32%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 1
      100% cov
      YP_766985
      99,3% cov
    • Длина выравнивания
      142 aa
  • Sinorhizobium medicae WSM419

    Sinorhizobium medicae WSM419

    • Общедоступная БД
      GI:150395838
      YP_001326305
    • Длина попадания
      143 aa
    • Значение E
      9,66E-61
    • Оценка BLAST
      236,9 биты
    • Сходство
      89,93%
    • Покрытие
      97,89%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 1
      97,89% cov
      YP_001326305
      97,2% cov
    • Длина выравнивания
      139 aa
  • Sinorhizobium fredii NGR234

    Sinorhizobium fredii NGR234

    • Общедоступная БД
      GI:227821334
      YP_002825304
    • Длина попадания
      143 aa
    • Значение E
      2,14E-60
    • Оценка BLAST
      235,7 биты
    • Сходство
      88,49%
    • Покрытие
      97,89%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 1
      97,89% cov
      YP_002825304
      97,2% cov
    • Длина выравнивания
      139 aa
  • Agrobacterium vitis S4

    Agrobacterium vitis S4

    • Общедоступная БД
      GI:222147959
      YP_002548916
    • Длина попадания
      143 aa
    • Значение E
      8,19E-58
    • Оценка BLAST
      227,3 биты
    • Сходство
      90%
    • Покрытие
      97,89%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 1
      97,89% cov
      YP_002548916
      97,9% cov
    • Длина выравнивания
      140 aa
Вхождение
18 количество раз в PatSeqDB
Инструменты
Поиск Patseqfinder
SEQ ID NO
2
Длина
472
Тип
nucleotide
Местоположения
Detailed Description, Drawings

Объявленный организм:
Artificial

Определенный организм:
Вхождение
10 количество раз в PatSeqDB
Инструменты
Поиск Patseqfinder
SEQ ID NO
3
Длина
447
Тип
nucleotide
Местоположения
Detailed Description, Drawings

Объявленный организм:
Artificial

Определенный организм:
Вхождение
16 количество раз в PatSeqDB
Инструменты
Поиск Patseqfinder
SEQ ID NO
4
Длина
149
Тип
peptide
Местоположения
Detailed Description, Drawings

Объявленный организм:
Artificial

Определенный организм:
  • Agrobacterium sp. H13-3

    Agrobacterium sp. H13-3

    • Общедоступная БД
      GI:325292293
      YP_004278157
    • Длина попадания
      142 aa
    • Значение E
      2,22E-78
    • Оценка BLAST
      295,4 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      95,3%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 4
      95,3% cov
      YP_004278157
      100% cov
    • Длина выравнивания
      142 aa
    • Строка СИГАРЫ
      142M7H несоответствия: 0 - вставки: 0 - удаления: 0
  • Agrobacterium fabrum str. C58

    Agrobacterium fabrum str. C58

    • Общедоступная БД
      GI:15888254
      NP_353935
    • Длина попадания
      142 aa
    • Значение E
      1,05E-77
    • Оценка BLAST
      293,5 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      95,3%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 4
      95,3% cov
      NP_353935
      100% cov
    • Длина выравнивания
      142 aa
    • Строка СИГАРЫ
      140MNM7H несоответствия: 1 - вставки: 0 - удаления: 0
  • Agrobacterium tumefaciens

    Agrobacterium tumefaciens

    • Общедоступная БД
      GI:1710640
      P55324
    • Длина попадания
      142 aa
    • Значение E
      1,76E-77
    • Оценка BLAST
      292,7 биты
    • Сходство
      99,3%
    • Покрытие
      95,3%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 4
      95,3% cov
      P55324
      100% cov
    • Длина выравнивания
      142 aa
    • Строка СИГАРЫ
      110MN31M7H несоответствия: 1 - вставки: 0 - удаления: 0
  • Agrobacterium radiobacter K84

    Agrobacterium radiobacter K84

    • Общедоступная БД
      GI:222085297
      YP_002543827
    • Длина попадания
      143 aa
    • Значение E
      3,08E-64
    • Оценка BLAST
      248,4 биты
    • Сходство
      89,21%
    • Покрытие
      93,29%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 4
      93,29% cov
      YP_002543827
      97,2% cov
    • Длина выравнивания
      139 aa
  • Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304

    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304

    • Общедоступная БД
      GI:209548484
      YP_002280401
    • Длина попадания
      143 aa
    • Значение E
      3,96E-62
    • Оценка BLAST
      241,5 биты
    • Сходство
      87,32%
    • Покрытие
      95,3%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 4
      95,3% cov
      YP_002280401
      99,3% cov
    • Длина выравнивания
      142 aa
  • Rhizobium leguminosarum bv. trifolii

    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii

    • Общедоступная БД
      GI:51012474
      AAT92553
    • Длина попадания
      143 aa
    • Значение E
      9,84E-62
    • Оценка BLAST
      240,4 биты
    • Сходство
      87,32%
    • Покрытие
      95,3%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 4
      95,3% cov
      AAT92553
      99,3% cov
    • Длина выравнивания
      142 aa
  • Rhizobium etli CFN 42

    Rhizobium etli CFN 42

    • Общедоступная БД
      GI:86356889
      YP_468781
    • Длина попадания
      143 aa
    • Значение E
      1,04E-61
    • Оценка BLAST
      240,4 биты
    • Сходство
      87,32%
    • Покрытие
      95,3%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 4
      95,3% cov
      YP_468781
      99,3% cov
    • Длина выравнивания
      142 aa
  • Rhizobium gallicum bv. gallicum

    Rhizobium gallicum bv. gallicum

    • Общедоступная БД
      GI:170783770
      ACB37369
    • Длина попадания
      143 aa
    • Значение E
      1,06E-61
    • Оценка BLAST
      240,4 биты
    • Сходство
      87,32%
    • Покрытие
      95,3%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 4
      95,3% cov
      ACB37369
      99,3% cov
    • Длина выравнивания
      142 aa
  • Rhizobium etli CIAT 652

    Rhizobium etli CIAT 652

    • Общедоступная БД
      GI:190890962
      YP_001977504
    • Длина попадания
      143 aa
    • Значение E
      3,01E-61
    • Оценка BLAST
      238,8 биты
    • Сходство
      86,62%
    • Покрытие
      95,3%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 4
      95,3% cov
      YP_001977504
      99,3% cov
    • Длина выравнивания
      142 aa
  • Sinorhizobium meliloti 1021

    Sinorhizobium meliloti 1021

    • Общедоступная БД
      GI:15964752
      NP_385105
    • Длина попадания
      143 aa
    • Значение E
      3,56E-61
    • Оценка BLAST
      238,4 биты
    • Сходство
      89,93%
    • Покрытие
      93,29%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 4
      93,29% cov
      NP_385105
      97,2% cov
    • Длина выравнивания
      139 aa
  • Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841

    Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841

    • Общедоступная БД
      GI:116251147
      YP_766985
    • Длина попадания
      143 aa
    • Значение E
      4,46E-61
    • Оценка BLAST
      238 биты
    • Сходство
      87,32%
    • Покрытие
      95,3%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 4
      95,3% cov
      YP_766985
      99,3% cov
    • Длина выравнивания
      142 aa
  • Sinorhizobium medicae WSM419

    Sinorhizobium medicae WSM419

    • Общедоступная БД
      GI:150395838
      YP_001326305
    • Длина попадания
      143 aa
    • Значение E
      9,93E-61
    • Оценка BLAST
      236,9 биты
    • Сходство
      89,93%
    • Покрытие
      93,29%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 4
      93,29% cov
      YP_001326305
      97,2% cov
    • Длина выравнивания
      139 aa
  • Sinorhizobium fredii NGR234

    Sinorhizobium fredii NGR234

    • Общедоступная БД
      GI:227821334
      YP_002825304
    • Длина попадания
      143 aa
    • Значение E
      2,35E-60
    • Оценка BLAST
      235,7 биты
    • Сходство
      88,49%
    • Покрытие
      93,29%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 4
      93,29% cov
      YP_002825304
      97,2% cov
    • Длина выравнивания
      139 aa
  • Agrobacterium vitis S4

    Agrobacterium vitis S4

    • Общедоступная БД
      GI:222147959
      YP_002548916
    • Длина попадания
      143 aa
    • Значение E
      6,33E-58
    • Оценка BLAST
      227,6 биты
    • Сходство
      90%
    • Покрытие
      93,29%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 4
      93,29% cov
      YP_002548916
      97,9% cov
    • Длина выравнивания
      140 aa
Вхождение
18 количество раз в PatSeqDB
Инструменты
Поиск Patseqfinder
SEQ ID NO
5
Длина
10
Тип
peptide
Местоположения
Detailed Description, Drawings

Объявленный организм:
Artificial

Определенный организм:
Вхождение
7 количество раз в PatSeqDB
Инструменты
Поиск Patseqfinder
SEQ ID NO
6
Длина
7
Тип
peptide
Местоположения
Detailed Description, Drawings

Объявленный организм:
Simian virus 12

Определенный организм:
  • Cryptococcus gattii WM276

    Cryptococcus gattii WM276

    • Общедоступная БД
      GI:321253042
      XP_003192608
    • Длина попадания
      273 aa
    • Значение E
      1,94E3
    • Оценка BLAST
      24,8 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      XP_003192608
      2,56% cov
    • Длина выравнивания
      7 aa
    • Строка СИГАРЫ
      7M несоответствия: 0 - вставки: 0 - удаления: 0
  • Schizophyllum commune H4-8

    Schizophyllum commune H4-8

    • Общедоступная БД
      GI:302689607
      XP_003034483
    • Длина попадания
      654 aa
    • Значение E
      1,94E3
    • Оценка BLAST
      24,8 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      XP_003034483
      1,07% cov
    • Длина выравнивания
      7 aa
    • Строка СИГАРЫ
      7M несоответствия: 0 - вставки: 0 - удаления: 0
  • Bacillus cereus SJ1

    Bacillus cereus SJ1

    • Общедоступная БД
      GI:300117853
      ZP_07055620
    • Длина попадания
      174 aa
    • Значение E
      1,94E3
    • Оценка BLAST
      24,8 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      ZP_07055620
      4,02% cov
    • Длина выравнивания
      7 aa
    • Строка СИГАРЫ
      7M несоответствия: 0 - вставки: 0 - удаления: 0
  • Bacillus thuringiensis BMB171

    Bacillus thuringiensis BMB171

    • Общедоступная БД
      GI:296505763
      YP_003667463
    • Длина попадания
      162 aa
    • Значение E
      1,94E3
    • Оценка BLAST
      24,8 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      YP_003667463
      4,32% cov
    • Длина выравнивания
      7 aa
  • Streptomyces griseus XylebKG-1

    Streptomyces griseus XylebKG-1

    • Общедоступная БД
      GI:326780780
      ZP_08240045
    • Длина попадания
      857 aa
    • Значение E
      1,94E3
    • Оценка BLAST
      24,8 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      ZP_08240045
      0,82% cov
    • Длина выравнивания
      7 aa
  • Streptomyces sp. SirexAA-E

    Streptomyces sp. SirexAA-E

    • Общедоступная БД
      GI:282863147
      ZP_06272207
    • Длина попадания
      857 aa
    • Значение E
      1,94E3
    • Оценка BLAST
      24,8 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      ZP_06272207
      0,82% cov
    • Длина выравнивания
      7 aa
  • Candida tropicalis MYA-3404

    Candida tropicalis MYA-3404

    • Общедоступная БД
      GI:255725830
      XP_002547841
    • Длина попадания
      1 138 aa
    • Значение E
      1,94E3
    • Оценка BLAST
      24,8 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      XP_002547841
      0,62% cov
    • Длина выравнивания
      7 aa
  • Streptomyces roseosporus NRRL 15998

    Streptomyces roseosporus NRRL 15998

    • Общедоступная БД
      GI:239939640
      ZP_04691577
    • Длина попадания
      837 aa
    • Значение E
      1,94E3
    • Оценка BLAST
      24,8 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      ZP_04691577
      0,84% cov
    • Длина выравнивания
      7 aa
  • Schistosoma mansoni

    Schistosoma mansoni

    • Общедоступная БД
      GI:256074558
      XP_002573591
    • Длина попадания
      682 aa
    • Значение E
      1,94E3
    • Оценка BLAST
      24,8 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      XP_002573591
      1,03% cov
    • Длина выравнивания
      7 aa
  • Bacillus thuringiensis IBL 200

    Bacillus thuringiensis IBL 200

    • Общедоступная БД
      GI:228911179
      ZP_04074984
    • Длина попадания
      177 aa
    • Значение E
      1,94E3
    • Оценка BLAST
      24,8 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      ZP_04074984
      3,95% cov
    • Длина выравнивания
      7 aa
  • Bacillus thuringiensis serovar pulsiensis BGSC 4CC1

    Bacillus thuringiensis serovar pulsiensis BGSC 4CC1

    • Общедоступная БД
      GI:228917948
      ZP_04081484
    • Длина попадания
      176 aa
    • Значение E
      1,94E3
    • Оценка BLAST
      24,8 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      ZP_04081484
      3,98% cov
    • Длина выравнивания
      7 aa
  • Bacillus thuringiensis serovar berliner ATCC 10792

    Bacillus thuringiensis serovar berliner ATCC 10792

    • Общедоступная БД
      GI:228942486
      ZP_04105022
    • Длина попадания
      179 aa
    • Значение E
      1,94E3
    • Оценка BLAST
      24,8 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      ZP_04105022
      3,91% cov
    • Длина выравнивания
      7 aa
  • Bacillus pseudomycoides DSM 12442

    Bacillus pseudomycoides DSM 12442

    • Общедоступная БД
      GI:228994058
      ZP_04153959
    • Длина попадания
      172 aa
    • Значение E
      1,94E3
    • Оценка BLAST
      24,8 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      ZP_04153959
      4,07% cov
    • Длина выравнивания
      7 aa
  • Bacillus mycoides Rock3-17

    Bacillus mycoides Rock3-17

    • Общедоступная БД
      GI:229000127
      ZP_04159697
    • Длина попадания
      170 aa
    • Значение E
      1,94E3
    • Оценка BLAST
      24,8 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      ZP_04159697
      4,12% cov
    • Длина выравнивания
      7 aa
  • Bacillus mycoides Rock1-4

    Bacillus mycoides Rock1-4

    • Общедоступная БД
      GI:229007648
      ZP_04165241
    • Длина попадания
      170 aa
    • Значение E
      1,94E3
    • Оценка BLAST
      24,8 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      ZP_04165241
      4,12% cov
    • Длина выравнивания
      7 aa
  • Bacillus cereus AH1273

    Bacillus cereus AH1273

    • Общедоступная БД
      GI:229020560
      ZP_04177302
    • Длина попадания
      178 aa
    • Значение E
      1,94E3
    • Оценка BLAST
      24,8 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      ZP_04177302
      3,93% cov
    • Длина выравнивания
      7 aa
  • Bacillus cereus AH1271

    Bacillus cereus AH1271

    • Общедоступная БД
      GI:229033972
      ZP_04188925
    • Длина попадания
      175 aa
    • Значение E
      1,94E3
    • Оценка BLAST
      24,8 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      ZP_04188925
      4% cov
    • Длина выравнивания
      7 aa
  • Bacillus cereus Rock4-18

    Bacillus cereus Rock4-18

    • Общедоступная БД
      GI:229076553
      ZP_04209513
    • Длина попадания
      176 aa
    • Значение E
      1,94E3
    • Оценка BLAST
      24,8 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      ZP_04209513
      3,98% cov
    • Длина выравнивания
      7 aa
  • Bacillus cereus Rock3-29

    Bacillus cereus Rock3-29

    • Общедоступная БД
      GI:229099772
      ZP_04230697
    • Длина попадания
      176 aa
    • Значение E
      1,94E3
    • Оценка BLAST
      24,8 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      ZP_04230697
      3,98% cov
    • Длина выравнивания
      7 aa
  • Bacillus cereus BDRD-ST196

    Bacillus cereus BDRD-ST196

    • Общедоступная БД
      GI:229136158
      ZP_04264911
    • Длина попадания
      176 aa
    • Значение E
      1,94E3
    • Оценка BLAST
      24,8 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      ZP_04264911
      3,98% cov
    • Длина выравнивания
      7 aa
  • Bacillus cereus AH676

    Bacillus cereus AH676

    • Общедоступная БД
      GI:229051010
      ZP_04194558
    • Длина попадания
      177 aa
    • Значение E
      1,94E3
    • Оценка BLAST
      24,8 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      ZP_04194558
      3,95% cov
    • Длина выравнивания
      7 aa
  • Bacillus thuringiensis serovar tochigiensis BGSC 4Y1

    Bacillus thuringiensis serovar tochigiensis BGSC 4Y1

    • Общедоступная БД
      GI:228988566
      ZP_04148653
    • Длина попадания
      176 aa
    • Значение E
      1,94E3
    • Оценка BLAST
      24,8 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      ZP_04148653
      3,98% cov
    • Длина выравнивания
      7 aa
  • Bacillus cereus R309803

    Bacillus cereus R309803

    • Общедоступная БД
      GI:229164288
      ZP_04292220
    • Длина попадания
      176 aa
    • Значение E
      1,94E3
    • Оценка BLAST
      24,8 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      ZP_04292220
      3,98% cov
    • Длина выравнивания
      7 aa
  • Bacillus cereus AH603

    Bacillus cereus AH603

    • Общедоступная БД
      GI:229064989
      ZP_04200287
    • Длина попадания
      176 aa
    • Значение E
      1,94E3
    • Оценка BLAST
      24,8 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      ZP_04200287
      3,98% cov
    • Длина выравнивания
      7 aa
  • Bacillus cereus MM3

    Bacillus cereus MM3

    • Общедоступная БД
      GI:229176015
      ZP_04303510
    • Длина попадания
      176 aa
    • Значение E
      1,94E3
    • Оценка BLAST
      24,8 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 6
      100% cov
      ZP_04303510
      3,98% cov
    • Длина выравнивания
      7 aa
Вхождение
6142 количество раз в PatSeqDB
Инструменты
Поиск Patseqfinder
SEQ ID NO
7
Длина
25
Тип
nucleotide
Местоположения
Detailed Description

Объявленный организм:
Agrobacterium tumefaciens

Определенный организм:
  • Agrobacterium fabrum str. C58

    Agrobacterium fabrum str. C58

    • Общедоступная БД
      GI:159141737
      AE007871
    • Длина попадания
      214 233 bp
    • Значение E
      2,09E-4
    • Оценка BLAST
      50,1 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 7
      100% cov
      AE007871
      0,01% cov
    • Длина выравнивания
      25 bp
    • Строка СИГАРЫ
      25M несоответствия: 0 - вставки: 0 - удаления: 0
  • Agrobacterium tumefaciens

    Agrobacterium tumefaciens

    • Общедоступная БД
      GI:6498173
      AB016260
      1 из 3 попадания зарегистрированы для Agrobacterium tumefaciens.
    • Длина попадания
      206 479 bp
    • Значение E
      2,09E-4
    • Оценка BLAST
      50,1 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 7
      100% cov
      AB016260
      0,01% cov
    • Длина выравнивания
      25 bp
    • Строка СИГАРЫ
      25M несоответствия: 0 - вставки: 0 - удаления: 0
  • Plasmid pTiC58

    Plasmid pTiC58

    • Общедоступная БД
      GI:154823
      M16397
      1 из 2 попадания зарегистрированы для Plasmid pTiC58.
    • Длина попадания
      1 717 bp
    • Значение E
      2,09E-4
    • Оценка BLAST
      50,1 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 7
      100% cov
      M16397
      1,46% cov
    • Длина выравнивания
      25 bp
  • Plasmid Ti

    Plasmid Ti

    • Общедоступная БД
      GI:154781
      J03320
    • Длина попадания
      29 802 bp
    • Значение E
      2,09E-4
    • Оценка BLAST
      50,1 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 7
      100% cov
      J03320
      0,08% cov
    • Длина выравнивания
      25 bp
  • Choloepus hoffmanni

    Choloepus hoffmanni

    • Общедоступная БД
      GI:335892788
      AC243778
    • Длина попадания
      112 146 bp
    • Значение E
      5,09E-2
    • Оценка BLAST
      42,1 биты
    • Сходство
      96%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 7
      100% cov
      AC243778
      0,02% cov
    • Длина выравнивания
      25 bp
  • Danio rerio

    Danio rerio

    • Общедоступная БД
      GI:34582250
      BX537168
    • Длина попадания
      200 744 bp
    • Значение E
      2,01E-1
    • Оценка BLAST
      40,1 биты
    • Сходство
      95,83%
    • Покрытие
      96%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 7
      96% cov
      BX537168
      0,01% cov
    • Длина выравнивания
      24 bp
  • Homo sapiens

    Homo sapiens

    • Общедоступная БД
      GI:21218126
      AP001091
    • Длина попадания
      207 785 bp
    • Значение E
      2,01E-1
    • Оценка BLAST
      40,1 биты
    • Сходство
      95,83%
    • Покрытие
      96%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 7
      96% cov
      AP001091
      0,01% cov
    • Длина выравнивания
      24 bp
Вхождение
26 количество раз в PatSeqDB
Инструменты
Поиск Patseqfinder
SEQ ID NO
8
Длина
27
Тип
nucleotide
Местоположения
Detailed Description, Drawings

Объявленный организм:
Agrobacterium tumefaciens

Определенный организм:
  • Agrobacterium fabrum str. C58

    Agrobacterium fabrum str. C58

    • Общедоступная БД
      GI:159141737
      AE007871
    • Длина попадания
      214 233 bp
    • Значение E
      1,78E-5
    • Оценка BLAST
      54 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      AE007871
      0,01% cov
    • Длина выравнивания
      27 bp
    • Строка СИГАРЫ
      27M несоответствия: 0 - вставки: 0 - удаления: 0
  • Agrobacterium tumefaciens

    Agrobacterium tumefaciens

    • Общедоступная БД
      GI:6498173
      AB016260
      1 из 3 попадания зарегистрированы для Agrobacterium tumefaciens.
    • Длина попадания
      206 479 bp
    • Значение E
      1,78E-5
    • Оценка BLAST
      54 биты
    • Сходство
      100%
    • Покрытие
      100%
    • Выравнивание (схема)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      AB016260
      0,01% cov
    • Длина выравнивания
      27 bp
    • Строка СИГАРЫ
      27M несоответствия: 0 - вставки: 0 - удаления: 0
Вхождение
18 количество раз в PatSeqDB
Инструменты
Поиск Patseqfinder
SEQ ID NO
9
Длина
11
Тип
nucleotide
Местоположения
Detailed Description

Объявленный организм:
Nicotiana tabacum

Определенный организм:
Вхождение
45 количество раз в PatSeqDB
Инструменты
Поиск Patseqfinder
SEQ ID NO
10
Длина
9
Тип
nucleotide
Местоположения
Detailed Description

Объявленный организм:
Solanum tuberosum

Определенный организм:
Вхождение
11 количество раз в PatSeqDB
Инструменты
Поиск Patseqfinder

Фильтровать последовательности

Очистить

Войдите в объектив

Забыли пароль? Зарегистрировать новую учетную запись

Улучшения языка

Мы были заняты обновлением нашей локализации и всех существующих языков.

Большая часть этих переводов была выполнена с использованием машинного перевода с проверкой носителя языка, однако не все элементы пользовательского интерфейса были проверены для каждого языка. Если вы видите термин, который переведен неправильно или нуждается в улучшении, обратитесь в службу поддержки.

  Больше не показывать
Отзыв