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recherche de séquences biologiques divulguées dans les brevets

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Données obtenues à partir de: DDBJ Pat NCBI GenBank (DDBJ) EMBL-EBI Pat
69 séquences trouvées dans ce brevet (au total)

Affichage 1 - 10 de 69 séquences

SEQ ID NO
Longueur
Type
Emplacements
Organisms
Occurrence
Outils
SEQ ID NO
1
Longueur
546
Type
DNA
Emplacements
Fulltext

Organisme déclaré:
Bacillus subtilis

Organisme déterminé:
  • Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168

    Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168

    • Accès à la base de données publique
      GI:225184640
      AL009126
    • Longueur du coup
      4 215 606 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 009,4 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      100% cov
      AL009126
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      546 bp
    • Chaîne CIGARE
      546M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Bacillus subtilis BSn5

    Bacillus subtilis BSn5

    • Accès à la base de données publique
      GI:320017650
      CP002468
    • Longueur du coup
      4 093 599 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      981,7 bits
    • Similarité
      99,08%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      100% cov
      CP002468
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      546 bp
    • Chaîne CIGARE
      299MN123MN22MN41MN5MN51M incompatibilités: 5 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Bacillus subtilis subsp. spizizenii str. W23

    Bacillus subtilis subsp. spizizenii str. W23

    • Accès à la base de données publique
      GI:305410941
      CP002183
    • Longueur du coup
      4 027 676 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      787,8 bits
    • Similarité
      92,67%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 1
      100% cov
      CP002183
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      546 bp
    • Chaîne CIGARE
      29MN47MN5MN21MNMN3MN10MN2MN5MN14MN17MN2MNMN30MN23MN2MN12MN19MN8MN21MN25MN32MN6MN16MN5MN11MN5MN11MN12MN5MN16MN2MN5MN5MN5MN5MN2MN20MN5MN17MN24M incompatibilités: 40 - insertions: 0 - suppressions: 0
Occurrence
6 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
2
Longueur
1 467
Type
DNA
Emplacements
Fulltext

Organisme déclaré:
Bacillus subtilis

Organisme déterminé:
  • Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168

    Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168

    • Accès à la base de données publique
      GI:225184640
      AL009126
      1 de 2 hits signalés pour Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168.
    • Longueur du coup
      4 215 606 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      2 710,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      AL009126
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 467 bp
    • Chaîne CIGARE
      1467M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Bacillus subtilis BSn5

    Bacillus subtilis BSn5

    • Accès à la base de données publique
      GI:320017650
      CP002468
    • Longueur du coup
      4 093 599 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      2 654,8 bits
    • Similarité
      99,32%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      100% cov
      CP002468
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      1 467 bp
    • Chaîne CIGARE
      335MN5MN84MN258MN102MN35MN137MN197MN149MN9MN146M incompatibilités: 10 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Bacillus subtilis subsp. spizizenii str. W23

    Bacillus subtilis subsp. spizizenii str. W23

    • Accès à la base de données publique
      GI:305410941
      CP002183
    • Longueur du coup
      4 027 676 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 399 bits
    • Similarité
      91,87%
    • Couverture
      68,1%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 2
      68,1% cov
      CP002183
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 008 bp
    • Chaîne CIGARE
      468H6MN13MN8MN5MN14MN8MN20MN38MN41MN8MN2MN20MN3MN10MN7MN6MN2MN4MN3MN13M2NM2N5MN2MN8MN17MN38MNMN9MN8M2N4MN14M2N19MN8M2IMI2MN8MN20MN5M2N31MN26MN35MN24MN20M2N3M2I3M4IMN10MN19M2NMN12MN2MN21MNMN10MN40MN4MN26MNMN39MN21MN4MN8MN24MN37MN2MN2MN14MN2MN5MN22MN55M incompatibilités: 73 - insertions: 9 - suppressions: 0
Occurrence
10 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
3
Longueur
1 005
Type
DNA
Emplacements
Undetermined

Organisme déclaré:
Bacillus subtilis

Organisme déterminé:
  • Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168

    Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168

    • Accès à la base de données publique
      GI:225184640
      AL009126
      1 de 3 hits signalés pour Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168.
    • Longueur du coup
      4 215 606 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 857 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 3
      100% cov
      AL009126
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      1 005 bp
    • Chaîne CIGARE
      1005M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Bacillus subtilis BSn5

    Bacillus subtilis BSn5

    • Accès à la base de données publique
      GI:320017650
      CP002468
    • Longueur du coup
      4 093 599 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 823,8 bits
    • Similarité
      99,4%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 3
      100% cov
      CP002468
      0,02% cov
    • Longueur d'alignement
      1 005 bp
    • Chaîne CIGARE
      442MN15MN74MN80MN5MN107MN276M incompatibilités: 6 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Bacillus subtilis subsp. spizizenii str. W23

    Bacillus subtilis subsp. spizizenii str. W23

    • Accès à la base de données publique
      GI:305410941
      CP002183
    • Longueur du coup
      4 027 676 bp
    • Valeur E
      0E0
    • Score BLAST
      1 354,7 bits
    • Similarité
      91%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 3
      100% cov
      CP002183
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      1 022 bp
    • Chaîne CIGARE
      50MN32MN14MN5MN23MN5MN27MN25MI3MD2MN50MN2MDMDMD12M2N32MN17M2N3MN9MN2MN14MN5MN9MNMN27MNMN14MN10M2N2MN3M3I2MN2M3I9MN15MN4MN5MN2MN8MN2MNMI4MD8MN2MN41MN17MN5MN2MN18M3D14M4IM2I8MN11MN3MNMN8MIM2I32MN9MN4MN8MN23MN23MN26MN20MN27MN13MN2MN5MN14MN17MN8MN5M2NMN15MNMN8MN27MN47M incompatibilités: 67 - insertions: 17 - suppressions: 8
Occurrence
6 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
4
Longueur
18
Type
DNA
Emplacements
Undetermined

Organisme déclaré:
Unspecified

Organisme déterminé:
  • Bacillus subtilis BSn5

    Bacillus subtilis BSn5

    • Accès à la base de données publique
      GI:320017650
      CP002468
    • Longueur du coup
      4 093 599 bp
    • Valeur E
      1,05E0
    • Score BLAST
      36,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      100% cov
      CP002468
      0% cov
    • Longueur d'alignement
      18 bp
    • Chaîne CIGARE
      18M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168

    Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168

    • Accès à la base de données publique
      GI:225184640
      AL009126
      1 de 2 hits signalés pour Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168.
    • Longueur du coup
      4 215 606 bp
    • Valeur E
      1,05E0
    • Score BLAST
      36,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      100% cov
      AL009126
      0% cov
    • Longueur d'alignement
      18 bp
    • Chaîne CIGARE
      18M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Arabidopsis lyrata subsp. lyrata

    Arabidopsis lyrata subsp. lyrata

    • Accès à la base de données publique
      GI:297839766
      XM_002887719
      1 de 2 hits signalés pour Arabidopsis lyrata subsp. lyrata.
    • Longueur du coup
      661 bp
    • Valeur E
      4,14E0
    • Score BLAST
      34,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      94,44%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      94,44% cov
      XM_002887719
      2,57% cov
    • Longueur d'alignement
      17 bp
  • Pyrenophora tritici-repentis Pt-1C-BFP

    Pyrenophora tritici-repentis Pt-1C-BFP

    • Accès à la base de données publique
      GI:189204357
      XM_001938479
      1 de 2 hits signalés pour Pyrenophora tritici-repentis Pt-1C-BFP.
    • Longueur du coup
      2 634 bp
    • Valeur E
      4,14E0
    • Score BLAST
      34,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      94,44%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      94,44% cov
      XM_001938479
      0,65% cov
    • Longueur d'alignement
      17 bp
  • Culex quinquefasciatus

    Culex quinquefasciatus

    • Accès à la base de données publique
      GI:170043099
      XM_001849187
      1 de 4 hits signalés pour Culex quinquefasciatus.
    • Longueur du coup
      870 bp
    • Valeur E
      4,14E0
    • Score BLAST
      34,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      94,44%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      94,44% cov
      XM_001849187
      1,95% cov
    • Longueur d'alignement
      17 bp
  • Arabidopsis thaliana

    Arabidopsis thaliana

    • Accès à la base de données publique
      GI:145337733
      NM_106555
      1 de 7 hits signalés pour Arabidopsis thaliana.
    • Longueur du coup
      720 bp
    • Valeur E
      4,14E0
    • Score BLAST
      34,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      94,44%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      94,44% cov
      NM_106555
      2,36% cov
    • Longueur d'alignement
      17 bp
  • Caenorhabditis elegans

    Caenorhabditis elegans

    • Accès à la base de données publique
      GI:71995652
      NM_075595
      1 de 2 hits signalés pour Caenorhabditis elegans.
    • Longueur du coup
      672 bp
    • Valeur E
      4,14E0
    • Score BLAST
      34,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      94,44%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      94,44% cov
      NM_075595
      2,53% cov
    • Longueur d'alignement
      17 bp
  • Eutrema halophilum

    Eutrema halophilum

    • Accès à la base de données publique
      GI:193872615
      EU714082
    • Longueur du coup
      643 bp
    • Valeur E
      4,14E0
    • Score BLAST
      34,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      94,44%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      94,44% cov
      EU714082
      2,64% cov
    • Longueur d'alignement
      17 bp
  • Brassica rapa

    Brassica rapa

    • Accès à la base de données publique
      GI:119720779
      EF110964
      1 de 2 hits signalés pour Brassica rapa.
    • Longueur du coup
      423 bp
    • Valeur E
      4,14E0
    • Score BLAST
      34,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      94,44%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      94,44% cov
      EF110964
      4,02% cov
    • Longueur d'alignement
      17 bp
  • Zea mays

    Zea mays

    • Accès à la base de données publique
      GI:77818482
      DQ245799
    • Longueur du coup
      630 bp
    • Valeur E
      4,14E0
    • Score BLAST
      34,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      94,44%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      94,44% cov
      DQ245799
      2,7% cov
    • Longueur d'alignement
      17 bp
  • Granulibacter bethesdensis CGDNIH1

    Granulibacter bethesdensis CGDNIH1

    • Accès à la base de données publique
      GI:114314838
      CP000394
    • Longueur du coup
      2 708 355 bp
    • Valeur E
      4,14E0
    • Score BLAST
      34,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      94,44%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 4
      94,44% cov
      CP000394
      0% cov
    • Longueur d'alignement
      17 bp
Occurrence
12 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
5
Longueur
32
Type
DNA
Emplacements
Undetermined

Organisme déclaré:
Unspecified

Organisme déterminé:
Occurrence
12 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
6
Longueur
31
Type
DNA
Emplacements
Undetermined

Organisme déclaré:
Unspecified

Organisme déterminé:
Occurrence
11 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
7
Longueur
39
Type
DNA
Emplacements
Undetermined

Organisme déclaré:
Unspecified

Organisme déterminé:
Occurrence
12 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
8
Longueur
18
Type
DNA
Emplacements
Undetermined

Organisme déclaré:
Unspecified

Organisme déterminé:
  • Loa loa

    Loa loa

    • Accès à la base de données publique
      GI:312066188
      XM_003136104
      1 de 2 hits signalés pour Loa loa.
    • Longueur du coup
      897 bp
    • Valeur E
      1,05E0
    • Score BLAST
      36,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      XM_003136104
      2,01% cov
    • Longueur d'alignement
      18 bp
    • Chaîne CIGARE
      18M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Streptococcus pasteurianus ATCC 43144

    Streptococcus pasteurianus ATCC 43144

    • Accès à la base de données publique
      GI:334281572
      AP012054
    • Longueur du coup
      2 100 077 bp
    • Valeur E
      1,05E0
    • Score BLAST
      36,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      AP012054
      0% cov
    • Longueur d'alignement
      18 bp
    • Chaîne CIGARE
      18M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Expression vector pEDMS1

    Expression vector pEDMS1

    • Accès à la base de données publique
      GI:329790867
      AB571797
    • Longueur du coup
      7 909 bp
    • Valeur E
      1,05E0
    • Score BLAST
      36,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      AB571797
      0,23% cov
    • Longueur d'alignement
      18 bp
    • Chaîne CIGARE
      18M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Staphylococcus aureus subsp. aureus ECT-R 2

    Staphylococcus aureus subsp. aureus ECT-R 2

    • Accès à la base de données publique
      GI:312828563
      FR714927
    • Longueur du coup
      2 729 540 bp
    • Valeur E
      1,05E0
    • Score BLAST
      36,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      FR714927
      0% cov
    • Longueur d'alignement
      18 bp
  • Staphylococcus aureus 04-02981

    Staphylococcus aureus 04-02981

    • Accès à la base de données publique
      GI:311222926
      CP001844
    • Longueur du coup
      2 821 452 bp
    • Valeur E
      1,05E0
    • Score BLAST
      36,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      CP001844
      0% cov
    • Longueur d'alignement
      18 bp
  • Bacillus sp. BS-02

    Bacillus sp. BS-02

    • Accès à la base de données publique
      GI:307634034
      HQ128580
    • Longueur du coup
      16 543 bp
    • Valeur E
      1,05E0
    • Score BLAST
      36,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      HQ128580
      0,11% cov
    • Longueur d'alignement
      18 bp
  • Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008

    Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008

    • Accès à la base de données publique
      GI:302749911
      CP002120
    • Longueur du coup
      2 924 344 bp
    • Valeur E
      1,05E0
    • Score BLAST
      36,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      CP002120
      0% cov
    • Longueur d'alignement
      18 bp
  • GFP expression vector pHapII

    GFP expression vector pHapII

    • Accès à la base de données publique
      GI:301341611
      HM151400
    • Longueur du coup
      6 838 bp
    • Valeur E
      1,05E0
    • Score BLAST
      36,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      HM151400
      0,26% cov
    • Longueur d'alignement
      18 bp
  • uncultured bacterium MID12

    uncultured bacterium MID12

    • Accès à la base de données publique
      GI:296777654
      GU951538
    • Longueur du coup
      45 360 bp
    • Valeur E
      1,05E0
    • Score BLAST
      36,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      GU951538
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      18 bp
  • Staphylococcus aureus subsp. aureus ST398

    Staphylococcus aureus subsp. aureus ST398

    • Accès à la base de données publique
      GI:295807781
      FN390948
    • Longueur du coup
      6 242 bp
    • Valeur E
      1,05E0
    • Score BLAST
      36,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      FN390948
      0,29% cov
    • Longueur d'alignement
      18 bp
  • Bacillus sp. BS-01

    Bacillus sp. BS-01

    • Accès à la base de données publique
      GI:291276222
      GU591497
    • Longueur du coup
      16 492 bp
    • Valeur E
      1,05E0
    • Score BLAST
      36,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      GU591497
      0,11% cov
    • Longueur d'alignement
      18 bp
  • Streptococcus gallolyticus UCN34

    Streptococcus gallolyticus UCN34

    • Accès à la base de données publique
      GI:288730948
      FN597254
    • Longueur du coup
      2 350 911 bp
    • Valeur E
      1,05E0
    • Score BLAST
      36,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      FN597254
      0% cov
    • Longueur d'alignement
      18 bp
  • Escherichia coli

    Escherichia coli

    • Accès à la base de données publique
      GI:282161295
      GQ149347
      1 de 2 hits signalés pour Escherichia coli.
    • Longueur du coup
      6 130 bp
    • Valeur E
      1,05E0
    • Score BLAST
      36,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      GQ149347
      0,29% cov
    • Longueur d'alignement
      18 bp
  • Staphylococcus epidermidis

    Staphylococcus epidermidis

    • Accès à la base de données publique
      GI:260066083
      GQ900381
    • Longueur du coup
      43 807 bp
    • Valeur E
      1,05E0
    • Score BLAST
      36,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      GQ900381
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      18 bp
  • Staphylococcus aureus

    Staphylococcus aureus

    • Accès à la base de données publique
      GI:260066081
      GQ900379
      1 de 5 hits signalés pour Staphylococcus aureus.
    • Longueur du coup
      50 429 bp
    • Valeur E
      1,05E0
    • Score BLAST
      36,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      GQ900379
      0,04% cov
    • Longueur d'alignement
      18 bp
  • Streptococcus suis BM407

    Streptococcus suis BM407

    • Accès à la base de données publique
      GI:251817111
      FM252032
    • Longueur du coup
      2 146 229 bp
    • Valeur E
      1,05E0
    • Score BLAST
      36,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      FM252032
      0% cov
    • Longueur d'alignement
      18 bp
  • Expression vector pCL311

    Expression vector pCL311

    • Accès à la base de données publique
      GI:171465609
      EU391617
    • Longueur du coup
      3 857 bp
    • Valeur E
      1,05E0
    • Score BLAST
      36,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      EU391617
      0,47% cov
    • Longueur d'alignement
      18 bp
  • Sinorhizobium fredii NGR234

    Sinorhizobium fredii NGR234

    • Accès à la base de données publique
      GI:227339586
      CP001389
    • Longueur du coup
      3 925 702 bp
    • Valeur E
      1,05E0
    • Score BLAST
      36,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      CP001389
      0% cov
    • Longueur d'alignement
      18 bp
  • Lactobacillus reuteri

    Lactobacillus reuteri

    • Accès à la base de données publique
      GI:220897973
      FJ489650
    • Longueur du coup
      5 139 bp
    • Valeur E
      1,05E0
    • Score BLAST
      36,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 8
      100% cov
      FJ489650
      0,35% cov
    • Longueur d'alignement
      18 bp
Occurrence
12 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
9
Longueur
21
Type
DNA
Emplacements
Undetermined

Organisme déclaré:
Unspecified

Organisme déterminé:
  • Bacillus subtilis subsp. natto

    Bacillus subtilis subsp. natto

    • Accès à la base de données publique
      GI:323461483
      AB615352
    • Longueur du coup
      65 774 bp
    • Valeur E
      2,55E-2
    • Score BLAST
      42,1 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      AB615352
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      21 bp
    • Chaîne CIGARE
      21M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Streptococcus pneumoniae

    Streptococcus pneumoniae

    • Accès à la base de données publique
      GI:321156784
      FR671403
      1 de 5 hits signalés pour Streptococcus pneumoniae.
    • Longueur du coup
      73 716 bp
    • Valeur E
      2,55E-2
    • Score BLAST
      42,1 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      FR671403
      0,03% cov
    • Longueur d'alignement
      21 bp
    • Chaîne CIGARE
      21M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Cloning vector pMQ351

    Cloning vector pMQ351

    • Accès à la base de données publique
      GI:312191039
      HQ418395
    • Longueur du coup
      9 921 bp
    • Valeur E
      2,55E-2
    • Score BLAST
      42,1 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      HQ418395
      0,21% cov
    • Longueur d'alignement
      21 bp
  • Cloning vector pCFPamy

    Cloning vector pCFPamy

    • Accès à la base de données publique
      GI:306491164
      HM204939
    • Longueur du coup
      7 265 bp
    • Valeur E
      2,55E-2
    • Score BLAST
      42,1 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      HM204939
      0,29% cov
    • Longueur d'alignement
      21 bp
  • Cloning vector pYFPamy

    Cloning vector pYFPamy

    • Accès à la base de données publique
      GI:306491156
      HM204937
    • Longueur du coup
      7 420 bp
    • Valeur E
      2,55E-2
    • Score BLAST
      42,1 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      HM204937
      0,28% cov
    • Longueur d'alignement
      21 bp
  • Cloning vector pGFPamy

    Cloning vector pGFPamy

    • Accès à la base de données publique
      GI:306491148
      HM204935
    • Longueur du coup
      7 390 bp
    • Valeur E
      2,55E-2
    • Score BLAST
      42,1 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      HM204935
      0,28% cov
    • Longueur d'alignement
      21 bp
  • Streptococcus pneumoniae 670-6B

    Streptococcus pneumoniae 670-6B

    • Accès à la base de données publique
      GI:306483213
      CP002176
    • Longueur du coup
      2 240 045 bp
    • Valeur E
      2,55E-2
    • Score BLAST
      42,1 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      CP002176
      0% cov
    • Longueur d'alignement
      21 bp
  • Cloning vector pMQ353

    Cloning vector pMQ353

    • Accès à la base de données publique
      GI:301134304
      GU339053
    • Longueur du coup
      8 843 bp
    • Valeur E
      2,55E-2
    • Score BLAST
      42,1 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      GU339053
      0,24% cov
    • Longueur d'alignement
      21 bp
  • Shuttle vector pMQ235

    Shuttle vector pMQ235

    • Accès à la base de données publique
      GI:301134301
      GU339050
    • Longueur du coup
      9 568 bp
    • Valeur E
      2,55E-2
    • Score BLAST
      42,1 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      GU339050
      0,22% cov
    • Longueur d'alignement
      21 bp
  • Staphylococcus aureus

    Staphylococcus aureus

    • Accès à la base de données publique
      GI:299758050
      AB539725
      1 de 4 hits signalés pour Staphylococcus aureus.
    • Longueur du coup
      2 908 bp
    • Valeur E
      2,55E-2
    • Score BLAST
      42,1 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      AB539725
      0,72% cov
    • Longueur d'alignement
      21 bp
  • Shuttle vector pTET15

    Shuttle vector pTET15

    • Accès à la base de données publique
      GI:270064174
      FJ859896
    • Longueur du coup
      6 151 bp
    • Valeur E
      2,55E-2
    • Score BLAST
      42,1 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      FJ859896
      0,34% cov
    • Longueur d'alignement
      21 bp
  • Persephonella marina EX-H1

    Persephonella marina EX-H1

    • Accès à la base de données publique
      GI:225644775
      CP001230
    • Longueur du coup
      1 930 284 bp
    • Valeur E
      2,55E-2
    • Score BLAST
      42,1 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      CP001230
      0% cov
    • Longueur d'alignement
      21 bp
  • Streptococcus pneumoniae ATCC 700669

    Streptococcus pneumoniae ATCC 700669

    • Accès à la base de données publique
      GI:220673408
      FM211187
    • Longueur du coup
      2 221 315 bp
    • Valeur E
      2,55E-2
    • Score BLAST
      42,1 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      FM211187
      0% cov
    • Longueur d'alignement
      21 bp
  • Staphylococcus sciuri

    Staphylococcus sciuri

    • Accès à la base de données publique
      GI:183604842
      EU602348
    • Longueur du coup
      2 908 bp
    • Valeur E
      2,55E-2
    • Score BLAST
      42,1 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      EU602348
      0,72% cov
    • Longueur d'alignement
      21 bp
  • Streptococcus pneumoniae CGSP14

    Streptococcus pneumoniae CGSP14

    • Accès à la base de données publique
      GI:182628304
      CP001033
    • Longueur du coup
      2 209 198 bp
    • Valeur E
      2,55E-2
    • Score BLAST
      42,1 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      CP001033
      0% cov
    • Longueur d'alignement
      21 bp
  • Cloning vector pMQ2

    Cloning vector pMQ2

    • Accès à la base de données publique
      GI:171193986
      EU546815
    • Longueur du coup
      8 636 bp
    • Valeur E
      2,55E-2
    • Score BLAST
      42,1 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      EU546815
      0,24% cov
    • Longueur d'alignement
      21 bp
  • Shuttle vector pMK4

    Shuttle vector pMK4

    • Accès à la base de données publique
      GI:171188275
      EU549778
    • Longueur du coup
      5 585 bp
    • Valeur E
      2,55E-2
    • Score BLAST
      42,1 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      EU549778
      0,38% cov
    • Longueur d'alignement
      21 bp
  • Streptococcus pneumoniae Hungary19A-6

    Streptococcus pneumoniae Hungary19A-6

    • Accès à la base de données publique
      GI:168994879
      CP000936
    • Longueur du coup
      2 245 615 bp
    • Valeur E
      2,55E-2
    • Score BLAST
      42,1 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 9
      100% cov
      CP000936
      0% cov
    • Longueur d'alignement
      21 bp
Occurrence
12 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq
SEQ ID NO
10
Longueur
18
Type
DNA
Emplacements
Undetermined

Organisme déclaré:
Unspecified

Organisme déterminé:
  • Bacillus subtilis BSn5

    Bacillus subtilis BSn5

    • Accès à la base de données publique
      GI:320017650
      CP002468
    • Longueur du coup
      4 093 599 bp
    • Valeur E
      1,05E0
    • Score BLAST
      36,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      CP002468
      0% cov
    • Longueur d'alignement
      18 bp
    • Chaîne CIGARE
      18M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168

    Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168

    • Accès à la base de données publique
      GI:225184640
      AL009126
      1 de 2 hits signalés pour Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168.
    • Longueur du coup
      4 215 606 bp
    • Valeur E
      1,05E0
    • Score BLAST
      36,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      100%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 10
      100% cov
      AL009126
      0% cov
    • Longueur d'alignement
      18 bp
    • Chaîne CIGARE
      18M incompatibilités: 0 - insertions: 0 - suppressions: 0
  • Mus musculus

    Mus musculus

    • Accès à la base de données publique
      GI:78486709
      AC164648
      1 de 2 hits signalés pour Mus musculus.
    • Longueur du coup
      198 430 bp
    • Valeur E
      4,14E0
    • Score BLAST
      34,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      94,44%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 10
      94,44% cov
      AC164648
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      17 bp
  • Homo sapiens

    Homo sapiens

    • Accès à la base de données publique
      GI:14715434
      AL512358
    • Longueur du coup
      144 665 bp
    • Valeur E
      4,14E0
    • Score BLAST
      34,2 bits
    • Similarité
      100%
    • Couverture
      94,44%
    • Alignement (schématique)

      SEQ ID NO 10
      94,44% cov
      AL512358
      0,01% cov
    • Longueur d'alignement
      17 bp
Occurrence
12 fois dans PatSeqDB
Outils
Détecteur PatSeq

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